More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0570 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  81.33 
 
 
633 aa  1032    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  84.29 
 
 
632 aa  1094    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  77.05 
 
 
641 aa  975    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  55.56 
 
 
611 aa  682    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  95.06 
 
 
645 aa  1249    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
648 aa  1320    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  58.35 
 
 
611 aa  705    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  89.56 
 
 
635 aa  1143    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  84.44 
 
 
633 aa  1096    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  55.86 
 
 
641 aa  723    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  84.76 
 
 
632 aa  1100    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  58.23 
 
 
630 aa  761    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  58.28 
 
 
644 aa  714    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  61.28 
 
 
629 aa  773    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  53.65 
 
 
625 aa  639    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  81.53 
 
 
623 aa  1045    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  81.4 
 
 
633 aa  1030    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  84.47 
 
 
633 aa  1087    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  54.26 
 
 
626 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  50.77 
 
 
636 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  51.66 
 
 
616 aa  592  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  48.71 
 
 
661 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  52.24 
 
 
621 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  49.77 
 
 
661 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  51.77 
 
 
619 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  49.62 
 
 
661 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  48.93 
 
 
667 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  49.47 
 
 
662 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  48.93 
 
 
667 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  47.78 
 
 
630 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  49.45 
 
 
613 aa  561  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  48.22 
 
 
655 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  49.24 
 
 
667 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  48.72 
 
 
684 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  46.49 
 
 
575 aa  556  1e-157  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  49.77 
 
 
636 aa  555  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  48.72 
 
 
684 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  48.94 
 
 
681 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  49.26 
 
 
705 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  48.72 
 
 
684 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  48.72 
 
 
684 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  48.72 
 
 
684 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  48.79 
 
 
681 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  46.81 
 
 
574 aa  555  1e-156  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  46.97 
 
 
691 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  47.02 
 
 
647 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  48.96 
 
 
615 aa  549  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  48.62 
 
 
628 aa  551  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  46.97 
 
 
652 aa  547  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  48.2 
 
 
688 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  48.22 
 
 
635 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  47.6 
 
 
598 aa  536  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  47.2 
 
 
620 aa  533  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  46.95 
 
 
660 aa  521  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  47.17 
 
 
617 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  45.3 
 
 
644 aa  514  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  45.67 
 
 
622 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  46.35 
 
 
604 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  44.82 
 
 
651 aa  494  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  44.19 
 
 
635 aa  484  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  43.38 
 
 
657 aa  481  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  42.9 
 
 
664 aa  481  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  43.54 
 
 
657 aa  478  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  43.24 
 
 
602 aa  478  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  45.05 
 
 
595 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  45.05 
 
 
595 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  44.67 
 
 
632 aa  471  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  43.97 
 
 
643 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  45.44 
 
 
629 aa  458  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  44.82 
 
 
624 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  42.26 
 
 
669 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  42.01 
 
 
620 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  42.31 
 
 
594 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  42.2 
 
 
606 aa  452  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  44.25 
 
 
612 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  45.13 
 
 
653 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  41.83 
 
 
600 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  41.73 
 
 
626 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  41.83 
 
 
661 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  41.18 
 
 
600 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0701  DNA mismatch repair protein  42.32 
 
 
635 aa  444  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138509  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  43 
 
 
681 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3655  DNA mismatch repair protein  43.01 
 
 
635 aa  445  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128216  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  43.6 
 
 
649 aa  443  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  41.59 
 
 
605 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3801  DNA mismatch repair protein  43.01 
 
 
635 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  43.17 
 
 
670 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  40.72 
 
 
617 aa  442  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  41.88 
 
 
623 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  41.88 
 
 
623 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  43.04 
 
 
632 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  40.33 
 
 
643 aa  441  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  41.99 
 
 
633 aa  441  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  42.79 
 
 
629 aa  438  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  43.09 
 
 
610 aa  439  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  40.75 
 
 
644 aa  438  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  44.09 
 
 
616 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  41.16 
 
 
687 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221737 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3823  DNA mismatch repair protein MutL  44.72 
 
 
615 aa  433  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000414583  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  41.6 
 
 
603 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>