More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0750 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  63.44 
 
 
636 aa  811    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  80.11 
 
 
684 aa  1080    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  82.5 
 
 
667 aa  1075    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  80.11 
 
 
684 aa  1080    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  63.7 
 
 
652 aa  825    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  62.11 
 
 
647 aa  800    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  78.87 
 
 
681 aa  1078    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  83.33 
 
 
661 aa  1077    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
687 aa  1389    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  80.09 
 
 
705 aa  1080    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  83.43 
 
 
662 aa  1058    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  62.34 
 
 
635 aa  797    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  94.92 
 
 
688 aa  1242    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  80.11 
 
 
684 aa  1080    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  81.99 
 
 
691 aa  1103    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  80.11 
 
 
684 aa  1080    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  64.03 
 
 
655 aa  791    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  82.58 
 
 
667 aa  1074    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  80.11 
 
 
684 aa  1080    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  82.67 
 
 
661 aa  1070    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  80.31 
 
 
681 aa  1078    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  82.58 
 
 
667 aa  1074    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  82.37 
 
 
661 aa  1068    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  50.97 
 
 
613 aa  620  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  51.84 
 
 
651 aa  615  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  48.64 
 
 
616 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  51.35 
 
 
628 aa  593  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  48.55 
 
 
660 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  47.88 
 
 
644 aa  585  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  50.08 
 
 
604 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  48.38 
 
 
632 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  47.98 
 
 
645 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  48.09 
 
 
632 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  48.95 
 
 
625 aa  558  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  48.53 
 
 
633 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  48.16 
 
 
633 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  47.53 
 
 
648 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  46.86 
 
 
629 aa  550  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  47.49 
 
 
623 aa  551  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  47.83 
 
 
635 aa  547  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  44.13 
 
 
641 aa  535  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  45.07 
 
 
630 aa  536  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  46.02 
 
 
621 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  45.8 
 
 
619 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  44.64 
 
 
611 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  43.96 
 
 
617 aa  473  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  39.58 
 
 
630 aa  468  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  43.43 
 
 
620 aa  445  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  40.9 
 
 
643 aa  425  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  41.62 
 
 
643 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  39.64 
 
 
594 aa  415  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  39 
 
 
606 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  58.19 
 
 
657 aa  395  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  57.89 
 
 
657 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  38.61 
 
 
617 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  36.92 
 
 
644 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  58.93 
 
 
622 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  59.15 
 
 
635 aa  391  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4225  DNA mismatch repair protein MutL  57.85 
 
 
687 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.724774  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1300  DNA mismatch repair protein MutL  57.52 
 
 
698 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0863563  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  60.62 
 
 
615 aa  389  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  37.83 
 
 
620 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  37.2 
 
 
628 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  37.61 
 
 
600 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  37.76 
 
 
600 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  38.81 
 
 
661 aa  385  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  37.29 
 
 
626 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  37.31 
 
 
637 aa  385  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5131  DNA mismatch repair protein MutL  58.28 
 
 
674 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  38.81 
 
 
687 aa  382  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  37.14 
 
 
623 aa  375  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  37.14 
 
 
623 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  37.88 
 
 
648 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0884  DNA mismatch repair protein  32.89 
 
 
673 aa  367  1e-100  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.277202  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  55.17 
 
 
664 aa  369  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  37.16 
 
 
601 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  33.74 
 
 
626 aa  363  8e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  57.89 
 
 
598 aa  361  3e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  37.05 
 
 
607 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  39.4 
 
 
629 aa  355  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  33.74 
 
 
626 aa  352  1e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  56.57 
 
 
641 aa  350  7e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  33.38 
 
 
685 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  32.81 
 
 
692 aa  347  4e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  31.45 
 
 
644 aa  347  5e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  55.09 
 
 
633 aa  346  8e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  31.88 
 
 
623 aa  345  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  38.13 
 
 
649 aa  345  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  35.14 
 
 
652 aa  344  2.9999999999999997e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  56.1 
 
 
611 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  54.74 
 
 
633 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  37.58 
 
 
669 aa  343  5.999999999999999e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  51.93 
 
 
636 aa  340  7e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  31.54 
 
 
624 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  31.42 
 
 
610 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  53.37 
 
 
626 aa  336  7e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  36.94 
 
 
661 aa  336  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  31.53 
 
 
628 aa  330  4e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  30.94 
 
 
630 aa  327  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  35.96 
 
 
670 aa  325  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>