More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1040 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
632 aa  1285    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  46.32 
 
 
606 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  45.11 
 
 
602 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  45.32 
 
 
597 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  45.74 
 
 
597 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  45.08 
 
 
603 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  45.04 
 
 
623 aa  491  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  45.04 
 
 
623 aa  491  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  45.7 
 
 
621 aa  488  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  44.86 
 
 
626 aa  487  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  45.54 
 
 
632 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  46.5 
 
 
629 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  45.17 
 
 
643 aa  488  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  43.78 
 
 
620 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  44.88 
 
 
643 aa  482  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  44.83 
 
 
612 aa  485  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  44.98 
 
 
616 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  44.31 
 
 
599 aa  485  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  43.91 
 
 
644 aa  482  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  41.85 
 
 
641 aa  484  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  44.21 
 
 
633 aa  483  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  44.52 
 
 
603 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  44.67 
 
 
605 aa  481  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  44.36 
 
 
595 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  43.82 
 
 
600 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  44.58 
 
 
632 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  45.61 
 
 
621 aa  477  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  41.05 
 
 
611 aa  477  1e-133  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  45.32 
 
 
641 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  44.58 
 
 
633 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  45.57 
 
 
618 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  44.24 
 
 
645 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  43.03 
 
 
648 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  44.27 
 
 
632 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  43.59 
 
 
600 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  43.93 
 
 
610 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  44.86 
 
 
623 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  44.43 
 
 
637 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  44.2 
 
 
633 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  44.67 
 
 
648 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  43.89 
 
 
641 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  42.88 
 
 
617 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  44.83 
 
 
633 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  43.59 
 
 
629 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  44.04 
 
 
635 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  44.06 
 
 
611 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  43.1 
 
 
687 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  43.93 
 
 
636 aa  462  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  44.83 
 
 
633 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  43.5 
 
 
661 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  43.72 
 
 
603 aa  456  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  42.17 
 
 
625 aa  457  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  43.29 
 
 
611 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  41.18 
 
 
628 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2869  DNA mismatch repair protein MutL  42.88 
 
 
605 aa  450  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  40.66 
 
 
630 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  40.83 
 
 
630 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  41.42 
 
 
647 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  41.2 
 
 
636 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  42.83 
 
 
594 aa  438  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  41.19 
 
 
635 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  41.62 
 
 
634 aa  436  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  40.84 
 
 
619 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  40.84 
 
 
621 aa  432  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  38.15 
 
 
647 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  40.73 
 
 
595 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  40.88 
 
 
655 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  41.9 
 
 
620 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  40.73 
 
 
595 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  40.41 
 
 
615 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  39.97 
 
 
652 aa  425  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  40.4 
 
 
661 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  38.58 
 
 
650 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  36.31 
 
 
608 aa  422  1e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  40.35 
 
 
622 aa  422  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  41.22 
 
 
628 aa  422  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  38.94 
 
 
602 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  39.52 
 
 
606 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  39.04 
 
 
684 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  41.04 
 
 
657 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  39.04 
 
 
684 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  39.21 
 
 
681 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  39.36 
 
 
660 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  38.57 
 
 
608 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  38.96 
 
 
681 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  39.04 
 
 
684 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  39.04 
 
 
684 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  39.04 
 
 
684 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  40.58 
 
 
657 aa  415  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  40.54 
 
 
598 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  39.21 
 
 
616 aa  411  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  39.43 
 
 
705 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  42.25 
 
 
603 aa  410  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  38.72 
 
 
644 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  41.01 
 
 
617 aa  411  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4225  DNA mismatch repair protein MutL  39.03 
 
 
687 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.724774  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  37.37 
 
 
613 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  39.34 
 
 
691 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  39.72 
 
 
635 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  39.28 
 
 
631 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>