More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1084 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 630 aa  1305    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  50.89 
 
 		 611 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  48.09 
 
 		 641 aa  585  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  48.28 
 
 		 630 aa  578  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  48.11 
 
 		 632 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  48.26 
 
 		 633 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  48.27 
 
 		 623 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  47.75 
 
 		 629 aa  575  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  47.96 
 
 		 632 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  47.79 
 
 		 635 aa  569  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  47.71 
 
 		 633 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  47.95 
 
 		 645 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  46.62 
 
 		 648 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  46.58 
 
 		 633 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  46.43 
 
 		 633 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  47.2 
 
 		 641 aa  561  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  47.6 
 
 		 644 aa  560  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  46.17 
 
 		 611 aa  554  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  45.94 
 
 		 636 aa  550  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  45.74 
 
 		 625 aa  534  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  45.77 
 
 		 626 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  45.35 
 
 		 619 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  45.05 
 
 		 621 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  44.25 
 
 		 575 aa  512  1e-144  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  44.08 
 
 		 574 aa  510  1e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  43.99 
 
 		 613 aa  502  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  43.15 
 
 		 615 aa  500  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  44.41 
 
 		 628 aa  495  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  43.17 
 
 		 616 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  42.26 
 
 		 647 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  42.77 
 
 		 635 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  42.79 
 
 		 636 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  42.4 
 
 		 652 aa  484  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  40.36 
 
 		 691 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  42.79 
 
 		 620 aa  482  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  43.19 
 
 		 622 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  41.94 
 
 		 598 aa  479  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  40.67 
 
 		 661 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  40.39 
 
 		 705 aa  475  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  41.69 
 
 		 655 aa  478  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  43.3 
 
 		 617 aa  478  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  39.94 
 
 		 681 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  39.94 
 
 		 681 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  40.15 
 
 		 684 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  40.15 
 
 		 684 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  40.15 
 
 		 684 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  40.15 
 
 		 684 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  41.98 
 
 		 644 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  40.15 
 
 		 684 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  40 
 
 		 667 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  40 
 
 		 667 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  43.6 
 
 		 635 aa  464  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  41.21 
 
 		 660 aa  464  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  41.98 
 
 		 657 aa  457  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  41.82 
 
 		 657 aa  457  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  41.11 
 
 		 632 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  41.02 
 
 		 664 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  39.91 
 
 		 651 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  41.13 
 
 		 604 aa  445  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  41.25 
 
 		 629 aa  435  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  40.29 
 
 		 602 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  38.18 
 
 		 661 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  40.58 
 
 		 597 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  39.75 
 
 		 643 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  40.48 
 
 		 603 aa  419  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  38.58 
 
 		 617 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  39.07 
 
 		 606 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  41.06 
 
 		 621 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  40.81 
 
 		 597 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  40.22 
 
 		 594 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  39.24 
 
 		 643 aa  412  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  40.85 
 
 		 612 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  40.07 
 
 		 603 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  38.36 
 
 		 610 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  38.67 
 
 		 644 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  39.15 
 
 		 620 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  35.67 
 
 		 628 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  38.56 
 
 		 605 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  39.15 
 
 		 603 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  40 
 
 		 595 aa  405  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  40 
 
 		 595 aa  405  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  38.45 
 
 		 600 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  38 
 
 		 661 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  39.62 
 
 		 595 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  38.2 
 
 		 608 aa  400  9.999999999999999e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  38.58 
 
 		 687 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  39.38 
 
 		 599 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  39.97 
 
 		 632 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  38.07 
 
 		 607 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  39.49 
 
 		 603 aa  397  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  38.02 
 
 		 600 aa  399  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  38.53 
 
 		 633 aa  398  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  38.7 
 
 		 616 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  37.48 
 
 		 623 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  37.88 
 
 		 611 aa  392  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  37.48 
 
 		 623 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  37.34 
 
 		 626 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  37.5 
 
 		 671 aa  392  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  38.66 
 
 		 618 aa  392  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3240  DNA mismatch repair protein MutL  40.04 
 
 		 628 aa  386  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>