More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2634 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  56.11 
 
 
641 aa  724    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  56.08 
 
 
632 aa  742    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  52.74 
 
 
611 aa  662    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  55.99 
 
 
645 aa  721    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  58.11 
 
 
623 aa  759    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  53.96 
 
 
648 aa  718    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  56.33 
 
 
635 aa  732    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  57.01 
 
 
633 aa  731    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  56.08 
 
 
611 aa  704    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
641 aa  1313    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  55.35 
 
 
633 aa  731    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  57.83 
 
 
630 aa  767    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  55.94 
 
 
644 aa  714    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  59.91 
 
 
629 aa  761    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  56.83 
 
 
632 aa  738    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  56.27 
 
 
633 aa  741    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  57.01 
 
 
633 aa  731    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  50.39 
 
 
636 aa  624  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  49.39 
 
 
625 aa  608  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  50.62 
 
 
626 aa  598  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  47.29 
 
 
630 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  48.54 
 
 
616 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  49.22 
 
 
621 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  49.29 
 
 
619 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  47.01 
 
 
613 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  47.78 
 
 
652 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  46.98 
 
 
636 aa  551  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  45.8 
 
 
628 aa  549  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  46.35 
 
 
691 aa  548  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  44.77 
 
 
575 aa  544  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  45.09 
 
 
615 aa  542  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  45.88 
 
 
655 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  46.64 
 
 
620 aa  543  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  44.98 
 
 
574 aa  542  1e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  45.54 
 
 
647 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  45.5 
 
 
661 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  45.16 
 
 
662 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  44.73 
 
 
661 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  45.98 
 
 
667 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  45.98 
 
 
667 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  45.79 
 
 
635 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  45.86 
 
 
661 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  44.81 
 
 
705 aa  533  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  44.08 
 
 
681 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  44.56 
 
 
684 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  43.58 
 
 
687 aa  531  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  44.76 
 
 
681 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  44.56 
 
 
684 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  44.56 
 
 
684 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  43.99 
 
 
688 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  44.68 
 
 
667 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  44.56 
 
 
684 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  44.56 
 
 
684 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  44.22 
 
 
598 aa  519  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  43.34 
 
 
617 aa  521  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  43.93 
 
 
644 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  44.39 
 
 
622 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  43.83 
 
 
660 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5131  DNA mismatch repair protein MutL  43.35 
 
 
674 aa  501  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4225  DNA mismatch repair protein MutL  43.19 
 
 
687 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.724774  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  42.9 
 
 
657 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  43.57 
 
 
635 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  41.85 
 
 
632 aa  484  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  44.15 
 
 
604 aa  481  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  41.89 
 
 
651 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  41.92 
 
 
629 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  40.67 
 
 
643 aa  458  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  40.06 
 
 
595 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  40.06 
 
 
595 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  41.28 
 
 
603 aa  447  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  43.2 
 
 
629 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  44.27 
 
 
653 aa  442  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  40.06 
 
 
606 aa  442  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  40.75 
 
 
600 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  39.38 
 
 
644 aa  442  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  40.71 
 
 
602 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  40.13 
 
 
600 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  40.6 
 
 
649 aa  438  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  40.22 
 
 
620 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  41.77 
 
 
624 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  39.32 
 
 
617 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  39.23 
 
 
669 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  40.58 
 
 
681 aa  433  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  42.14 
 
 
670 aa  435  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  39.2 
 
 
628 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  40 
 
 
661 aa  435  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0323  DNA mismatch repair protein MutL  42.25 
 
 
652 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  39.94 
 
 
632 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2869  DNA mismatch repair protein MutL  39.09 
 
 
605 aa  427  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  38.65 
 
 
623 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  40.06 
 
 
621 aa  428  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  40.86 
 
 
633 aa  429  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  38.65 
 
 
623 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  39.46 
 
 
616 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  38.44 
 
 
626 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  40.81 
 
 
595 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  40.09 
 
 
610 aa  424  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  37.71 
 
 
652 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  40 
 
 
615 aa  425  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  39.16 
 
 
594 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>