More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4225 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  69.88 
 
 
657 aa  892    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4225  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
687 aa  1370    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.724774  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  62.41 
 
 
660 aa  825    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1300  DNA mismatch repair protein MutL  67.74 
 
 
698 aa  869    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0863563  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  70.03 
 
 
657 aa  893    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  56.18 
 
 
651 aa  676    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5131  DNA mismatch repair protein MutL  68.13 
 
 
674 aa  852    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  63.43 
 
 
644 aa  815    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  52.75 
 
 
636 aa  620  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  51.96 
 
 
647 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  76.9 
 
 
635 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  51.49 
 
 
655 aa  608  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  50.72 
 
 
635 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  50.5 
 
 
652 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  49.85 
 
 
661 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  50.52 
 
 
661 aa  596  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  48.53 
 
 
625 aa  552  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  47.04 
 
 
616 aa  554  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  46.88 
 
 
613 aa  542  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  48.24 
 
 
628 aa  536  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  68.18 
 
 
622 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  47.48 
 
 
623 aa  527  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  43.89 
 
 
630 aa  524  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  46.03 
 
 
632 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  46.26 
 
 
632 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  44.9 
 
 
641 aa  522  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  46.02 
 
 
633 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  65.72 
 
 
664 aa  521  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  46.89 
 
 
641 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  45.88 
 
 
629 aa  517  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  45.59 
 
 
633 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  45.07 
 
 
633 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  44.49 
 
 
633 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  44.38 
 
 
645 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  46.51 
 
 
598 aa  503  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  44.25 
 
 
635 aa  505  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  69.19 
 
 
604 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  39.16 
 
 
632 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  40.98 
 
 
643 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  41.12 
 
 
603 aa  408  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  40.03 
 
 
643 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  40.21 
 
 
623 aa  402  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  40.21 
 
 
623 aa  402  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  39.61 
 
 
617 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  38.69 
 
 
603 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  60.3 
 
 
667 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  39.97 
 
 
620 aa  398  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  39.79 
 
 
600 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  59.64 
 
 
688 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  38.97 
 
 
644 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  40.77 
 
 
661 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  56.94 
 
 
691 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  59.09 
 
 
687 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  39.74 
 
 
687 aa  391  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  39.14 
 
 
605 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  58.5 
 
 
684 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  58.5 
 
 
684 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  58.5 
 
 
681 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  59.09 
 
 
662 aa  389  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  58.5 
 
 
681 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  38.87 
 
 
600 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  58.5 
 
 
684 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  58.5 
 
 
684 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  58.5 
 
 
684 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  59.04 
 
 
705 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  38.14 
 
 
633 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  38.96 
 
 
610 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  41.32 
 
 
641 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  40.18 
 
 
648 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  36.48 
 
 
602 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  39.38 
 
 
649 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  34.28 
 
 
611 aa  365  1e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  31.48 
 
 
665 aa  362  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  36.31 
 
 
606 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  34.62 
 
 
628 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  36.21 
 
 
622 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  37.46 
 
 
629 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  35.02 
 
 
608 aa  353  7e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  54.95 
 
 
615 aa  351  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  37.66 
 
 
669 aa  348  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  33.14 
 
 
692 aa  345  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  37.99 
 
 
624 aa  342  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  35.16 
 
 
605 aa  342  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  29.1 
 
 
644 aa  341  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4412  DNA mismatch repair protein  39.48 
 
 
615 aa  340  5e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0194282  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4728  DNA mismatch repair protein  39.48 
 
 
615 aa  340  5e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0929403  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3801  DNA mismatch repair protein  37.36 
 
 
635 aa  339  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4641  DNA mismatch repair protein  39.31 
 
 
615 aa  339  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.231193  normal  0.0766044 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3655  DNA mismatch repair protein  37.36 
 
 
635 aa  339  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128216  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3843  DNA mismatch repair protein  39.31 
 
 
615 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000795964  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5686  DNA mismatch repair protein  38.71 
 
 
615 aa  337  5e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000161678  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04037  DNA mismatch repair protein  39.31 
 
 
615 aa  336  9e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0484513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3823  DNA mismatch repair protein MutL  39.31 
 
 
615 aa  336  9e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000414583  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0353  DNA mismatch repair protein  38.37 
 
 
613 aa  335  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114284  hitchhiker  0.00160708 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  36.61 
 
 
661 aa  335  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  35.25 
 
 
681 aa  335  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  37.22 
 
 
670 aa  333  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  37.48 
 
 
607 aa  333  9e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  51.38 
 
 
619 aa  332  1e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  53.69 
 
 
621 aa  332  1e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>