More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0571 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
636 aa  1267    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  56.71 
 
 
611 aa  660    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  54.69 
 
 
641 aa  634  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  53.89 
 
 
623 aa  634  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  54.36 
 
 
629 aa  629  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  50.15 
 
 
641 aa  630  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  53.83 
 
 
633 aa  628  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  50.55 
 
 
630 aa  628  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  53.68 
 
 
633 aa  628  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  53.87 
 
 
611 aa  618  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  50.77 
 
 
632 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  50.84 
 
 
632 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  51 
 
 
635 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  50.84 
 
 
633 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  51.45 
 
 
633 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  50.79 
 
 
645 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  50.77 
 
 
648 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  55.97 
 
 
620 aa  607  9.999999999999999e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  51.87 
 
 
625 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  50.93 
 
 
644 aa  592  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  53.29 
 
 
626 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  49.69 
 
 
621 aa  558  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  48.35 
 
 
615 aa  554  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  48.92 
 
 
613 aa  553  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  49.53 
 
 
619 aa  550  1e-155  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  45.78 
 
 
630 aa  550  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  48.99 
 
 
628 aa  535  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  46.04 
 
 
574 aa  538  1e-151  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  48.51 
 
 
598 aa  534  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  45.73 
 
 
575 aa  532  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  47.3 
 
 
616 aa  530  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  46.91 
 
 
661 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  47.49 
 
 
622 aa  527  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  48.34 
 
 
705 aa  527  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  47.89 
 
 
691 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  46.14 
 
 
661 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  46.49 
 
 
667 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  46.49 
 
 
667 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  47.59 
 
 
681 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  47.52 
 
 
681 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  46.71 
 
 
661 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  47.39 
 
 
662 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  46.7 
 
 
684 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  48.62 
 
 
652 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  46.7 
 
 
684 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  45.87 
 
 
667 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  46.7 
 
 
684 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  48.99 
 
 
617 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  46.7 
 
 
684 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  46.7 
 
 
684 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  46.15 
 
 
636 aa  512  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  46.11 
 
 
647 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5131  DNA mismatch repair protein MutL  45.62 
 
 
674 aa  505  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  46.11 
 
 
655 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  45.47 
 
 
635 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  45.79 
 
 
635 aa  495  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  44.89 
 
 
644 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  46.79 
 
 
651 aa  491  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  44.46 
 
 
660 aa  488  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  44.53 
 
 
664 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  46.88 
 
 
604 aa  477  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  44.09 
 
 
632 aa  474  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  43.63 
 
 
643 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  43.17 
 
 
595 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  44.96 
 
 
643 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  43.17 
 
 
595 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  45.12 
 
 
612 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  42.21 
 
 
623 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  42.21 
 
 
623 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  44.22 
 
 
632 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  43.29 
 
 
597 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  44.1 
 
 
616 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  42.43 
 
 
620 aa  442  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  42.26 
 
 
626 aa  442  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  42.95 
 
 
603 aa  439  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  42.09 
 
 
644 aa  436  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  42.41 
 
 
594 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  42.95 
 
 
618 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  42.79 
 
 
602 aa  435  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  43.08 
 
 
599 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  42.68 
 
 
595 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  42.48 
 
 
606 aa  432  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  43.74 
 
 
629 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  43.15 
 
 
597 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  41.23 
 
 
600 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  41.98 
 
 
603 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  43.32 
 
 
621 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  41.98 
 
 
661 aa  425  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  41.88 
 
 
687 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  43.16 
 
 
610 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  38.38 
 
 
611 aa  422  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  42.75 
 
 
603 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  40.5 
 
 
617 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  41.43 
 
 
671 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  42.05 
 
 
648 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  41.1 
 
 
600 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  41.55 
 
 
605 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  38.84 
 
 
628 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  43.51 
 
 
621 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  44.15 
 
 
629 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>