More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1125 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4225  DNA mismatch repair protein MutL  55.75 
 
 		 687 aa  656    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.724774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  59.85 
 
 		 657 aa  712    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  54.05 
 
 		 705 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  58.7 
 
 		 635 aa  686    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  66.04 
 
 		 604 aa  759    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  58.58 
 
 		 664 aa  698    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  58.41 
 
 		 660 aa  714    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  57.97 
 
 		 644 aa  703    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  60.21 
 
 		 622 aa  722    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  60 
 
 		 657 aa  712    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 651 aa  1288    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  53.42 
 
 		 681 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  53.42 
 
 		 681 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  53.04 
 
 		 684 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  53.04 
 
 		 684 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  53.04 
 
 		 684 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  53.08 
 
 		 661 aa  625  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  53.04 
 
 		 684 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  53.04 
 
 		 684 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  53.08 
 
 		 662 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  53.61 
 
 		 667 aa  625  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  53.87 
 
 		 661 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  52.06 
 
 		 661 aa  624  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  53.61 
 
 		 667 aa  625  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  53.21 
 
 		 667 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  52.83 
 
 		 691 aa  618  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  52.12 
 
 		 687 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  52.98 
 
 		 647 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  52.46 
 
 		 635 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  52.86 
 
 		 636 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  51.56 
 
 		 652 aa  587  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  50.91 
 
 		 655 aa  585  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  48.9 
 
 		 615 aa  544  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  47.45 
 
 		 616 aa  545  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  46.44 
 
 		 613 aa  523  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  47.84 
 
 		 625 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  47.55 
 
 		 623 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  46.62 
 
 		 632 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  46.62 
 
 		 633 aa  512  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  48.45 
 
 		 598 aa  509  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  47.39 
 
 		 633 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  47.09 
 
 		 633 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  46.32 
 
 		 632 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  46.95 
 
 		 629 aa  508  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  47.15 
 
 		 641 aa  502  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  48.08 
 
 		 628 aa  499  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  46.13 
 
 		 645 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  45.58 
 
 		 635 aa  498  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  46.19 
 
 		 633 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  46.8 
 
 		 634 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  45.55 
 
 		 648 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  42.47 
 
 		 630 aa  489  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  46.33 
 
 		 636 aa  485  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  42.49 
 
 		 641 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  45.2 
 
 		 621 aa  475  1e-132  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  45.51 
 
 		 619 aa  475  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  44.22 
 
 		 611 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  44.58 
 
 		 611 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  43.35 
 
 		 644 aa  464  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1300  DNA mismatch repair protein MutL  68.64 
 
 		 698 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0863563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  44.93 
 
 		 626 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5131  DNA mismatch repair protein MutL  68.62 
 
 		 674 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  39.54 
 
 		 630 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  43.49 
 
 		 617 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  39.01 
 
 		 574 aa  434  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  44.46 
 
 		 620 aa  435  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  38.7 
 
 		 575 aa  432  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  62.76 
 
 		 688 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  39.63 
 
 		 632 aa  402  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  39.76 
 
 		 595 aa  395  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  39.76 
 
 		 595 aa  395  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  41.61 
 
 		 597 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  39.24 
 
 		 643 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  42.1 
 
 		 643 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  41.61 
 
 		 595 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  36.57 
 
 		 611 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  40.06 
 
 		 606 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  38.78 
 
 		 626 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  39.63 
 
 		 610 aa  382  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  39.1 
 
 		 600 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  41.11 
 
 		 612 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  41.37 
 
 		 618 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  40.97 
 
 		 599 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  39.2 
 
 		 597 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  39.49 
 
 		 644 aa  379  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  38.94 
 
 		 600 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  41.77 
 
 		 621 aa  375  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  41.3 
 
 		 603 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  40.24 
 
 		 632 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  39.13 
 
 		 603 aa  372  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  39.31 
 
 		 616 aa  369  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  38.96 
 
 		 623 aa  368  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  38.96 
 
 		 623 aa  368  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  38.98 
 
 		 620 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  40.43 
 
 		 603 aa  365  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  38.93 
 
 		 602 aa  365  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  39.19 
 
 		 594 aa  364  3e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  35.29 
 
 		 647 aa  363  8e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  37.84 
 
 		 633 aa  360  6e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  40.51 
 
 		 648 aa  357  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>