More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1300 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  63.83 
 
 		 622 aa  809    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4225  DNA mismatch repair protein MutL  68.87 
 
 		 687 aa  858    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.724774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  57.55 
 
 		 651 aa  702    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  56.96 
 
 		 604 aa  681    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  76.33 
 
 		 657 aa  951    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  65.54 
 
 		 660 aa  860    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  75.76 
 
 		 657 aa  947    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  65.59 
 
 		 644 aa  838    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5131  DNA mismatch repair protein MutL  72.42 
 
 		 674 aa  910    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1300  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 698 aa  1377    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0863563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  51.24 
 
 		 681 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  50.98 
 
 		 705 aa  631  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  50.9 
 
 		 684 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  50.9 
 
 		 684 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  50.9 
 
 		 684 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  50.9 
 
 		 684 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  50.48 
 
 		 681 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  50.9 
 
 		 684 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  52.31 
 
 		 636 aa  619  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  49.44 
 
 		 661 aa  618  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  77.46 
 
 		 635 aa  618  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  51.22 
 
 		 647 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  49.44 
 
 		 661 aa  618  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  49.22 
 
 		 661 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  49.02 
 
 		 667 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  49.02 
 
 		 667 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  49.24 
 
 		 691 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  47.93 
 
 		 687 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  50.15 
 
 		 662 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  49.21 
 
 		 652 aa  599  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  49.93 
 
 		 655 aa  600  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  46.92 
 
 		 615 aa  557  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  45.65 
 
 		 616 aa  549  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  67.06 
 
 		 664 aa  537  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  45.66 
 
 		 625 aa  523  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  44.17 
 
 		 613 aa  525  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  47.42 
 
 		 628 aa  523  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  45.52 
 
 		 623 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  42.4 
 
 		 630 aa  510  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  44.59 
 
 		 633 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  44.67 
 
 		 621 aa  506  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  43.8 
 
 		 632 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  43.62 
 
 		 633 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  44.01 
 
 		 633 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  43.62 
 
 		 632 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  43.31 
 
 		 629 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  45.3 
 
 		 636 aa  503  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  42.04 
 
 		 641 aa  499  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  44.38 
 
 		 619 aa  501  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  42.53 
 
 		 645 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  42.92 
 
 		 648 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  43.79 
 
 		 635 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  43.31 
 
 		 633 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  44.03 
 
 		 626 aa  475  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  38.65 
 
 		 632 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  40.32 
 
 		 643 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  39.16 
 
 		 595 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  39.16 
 
 		 595 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  40.58 
 
 		 620 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  39.06 
 
 		 623 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  39.06 
 
 		 623 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  39.36 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  40.64 
 
 		 618 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  39.52 
 
 		 644 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  38.46 
 
 		 626 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  55.28 
 
 		 688 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  40.06 
 
 		 632 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  38.46 
 
 		 603 aa  389  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  52.72 
 
 		 635 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  40.43 
 
 		 661 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  42.19 
 
 		 648 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  40.6 
 
 		 687 aa  382  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  35.64 
 
 		 647 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  34.83 
 
 		 611 aa  378  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  37.12 
 
 		 633 aa  376  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  40.23 
 
 		 629 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  37.79 
 
 		 605 aa  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  36.69 
 
 		 606 aa  362  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  38.09 
 
 		 637 aa  360  4e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  34.71 
 
 		 628 aa  360  5e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  35.61 
 
 		 622 aa  356  7.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  39.02 
 
 		 641 aa  356  8.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  38.95 
 
 		 649 aa  348  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  36.96 
 
 		 669 aa  346  8.999999999999999e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  38.06 
 
 		 629 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  36.61 
 
 		 595 aa  339  9e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0216  DNA mismatch repair protein  31.86 
 
 		 682 aa  339  9.999999999999999e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0851058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  37.34 
 
 		 624 aa  338  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0884  DNA mismatch repair protein  31.2 
 
 		 673 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.277202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  36.23 
 
 		 607 aa  333  5e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  36.14 
 
 		 601 aa  333  6e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3655  DNA mismatch repair protein  36.72 
 
 		 635 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128216  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3801  DNA mismatch repair protein  36.72 
 
 		 635 aa  331  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0701  DNA mismatch repair protein  36.88 
 
 		 635 aa  330  5.0000000000000004e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  36.24 
 
 		 653 aa  329  9e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  52.01 
 
 		 634 aa  329  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  36.75 
 
 		 661 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  49.33 
 
 		 611 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  34.42 
 
 		 631 aa  324  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  34.68 
 
 		 605 aa  323  6e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>