More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0149 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 605 aa  1229    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  42.69 
 
 		 606 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  42.17 
 
 		 602 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  41.88 
 
 		 622 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  40.34 
 
 		 647 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  41.34 
 
 		 628 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  40.58 
 
 		 650 aa  451  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  42.3 
 
 		 607 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  41.52 
 
 		 608 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  42.44 
 
 		 608 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  42.04 
 
 		 601 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  42.13 
 
 		 607 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  41.16 
 
 		 589 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  36.8 
 
 		 647 aa  405  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  38.11 
 
 		 603 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  38.4 
 
 		 632 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  35.59 
 
 		 665 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  38.02 
 
 		 605 aa  382  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  40.48 
 
 		 643 aa  378  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  36.58 
 
 		 631 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  36.59 
 
 		 559 aa  378  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  38.21 
 
 		 605 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  36.44 
 
 		 625 aa  375  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  38.93 
 
 		 628 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  37.54 
 
 		 612 aa  368  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  34.41 
 
 		 659 aa  366  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  36.03 
 
 		 586 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  33.02 
 
 		 644 aa  365  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  35.88 
 
 		 634 aa  363  5.0000000000000005e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  35.91 
 
 		 630 aa  363  6e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  34.15 
 
 		 668 aa  360  4e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  38.78 
 
 		 582 aa  360  6e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  33.39 
 
 		 647 aa  359  9e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  35.45 
 
 		 624 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  35.9 
 
 		 611 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  36.06 
 
 		 619 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  35.29 
 
 		 572 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  34.95 
 
 		 644 aa  357  5e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  35.02 
 
 		 621 aa  355  1e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  34.48 
 
 		 626 aa  355  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  34.48 
 
 		 626 aa  355  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  34.67 
 
 		 630 aa  354  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  36.08 
 
 		 623 aa  353  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  35.44 
 
 		 619 aa  353  4e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  35.71 
 
 		 602 aa  353  5.9999999999999994e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  35.01 
 
 		 626 aa  352  8.999999999999999e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  35.12 
 
 		 632 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  38.19 
 
 		 615 aa  352  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  34 
 
 		 649 aa  351  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  37.5 
 
 		 598 aa  351  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  38.01 
 
 		 603 aa  351  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  34.1 
 
 		 647 aa  352  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  35.99 
 
 		 645 aa  351  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  37.56 
 
 		 606 aa  350  4e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  38.21 
 
 		 594 aa  350  5e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  33.69 
 
 		 656 aa  349  7e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  34.47 
 
 		 566 aa  349  8e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  35.25 
 
 		 633 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  34.65 
 
 		 626 aa  348  1e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  34.96 
 
 		 633 aa  349  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  36.93 
 
 		 612 aa  348  1e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  37.76 
 
 		 632 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  30.56 
 
 		 621 aa  348  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  35.02 
 
 		 629 aa  347  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  34.99 
 
 		 608 aa  347  3e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  36.32 
 
 		 623 aa  347  3e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  37.15 
 
 		 597 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  37.38 
 
 		 630 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  35.45 
 
 		 605 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  36.32 
 
 		 623 aa  347  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  34.55 
 
 		 632 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  36.64 
 
 		 626 aa  347  5e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  35.98 
 
 		 636 aa  346  5e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  37.36 
 
 		 565 aa  346  6e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  34.25 
 
 		 647 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  34.33 
 
 		 566 aa  345  1e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  34.76 
 
 		 566 aa  345  1e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  35.51 
 
 		 648 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  37.38 
 
 		 599 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  35.64 
 
 		 633 aa  342  9e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  36.61 
 
 		 595 aa  342  9e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  35.48 
 
 		 633 aa  342  9e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  37.3 
 
 		 603 aa  342  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  36.65 
 
 		 635 aa  342  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  36.44 
 
 		 617 aa  342  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  34.05 
 
 		 641 aa  341  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  33.75 
 
 		 661 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  37.1 
 
 		 616 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  36.46 
 
 		 622 aa  340  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  36.38 
 
 		 600 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  33.12 
 
 		 624 aa  339  7e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  36.48 
 
 		 603 aa  340  7e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  35.43 
 
 		 610 aa  339  7e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  34.85 
 
 		 635 aa  339  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  37.66 
 
 		 629 aa  339  8e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  37.07 
 
 		 597 aa  339  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  36.21 
 
 		 618 aa  339  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  36.5 
 
 		 616 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  34.36 
 
 		 662 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  36.62 
 
 		 657 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>