More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2999 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
631 aa  1303    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  54.25 
 
 
605 aa  659    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  54.77 
 
 
605 aa  666    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  50.71 
 
 
612 aa  614  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  38.86 
 
 
566 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  39.14 
 
 
566 aa  434  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  35.46 
 
 
644 aa  430  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  38.19 
 
 
566 aa  425  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  38.25 
 
 
586 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  39.28 
 
 
632 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  35.52 
 
 
680 aa  405  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  36.01 
 
 
640 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  36.84 
 
 
647 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  36.36 
 
 
628 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  38.15 
 
 
620 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  37.78 
 
 
647 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  37.09 
 
 
656 aa  386  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  37.58 
 
 
606 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  34.02 
 
 
669 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  35.7 
 
 
639 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  34.07 
 
 
559 aa  379  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  37.2 
 
 
623 aa  378  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  34.3 
 
 
645 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  37.2 
 
 
623 aa  378  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  37.4 
 
 
619 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  34.09 
 
 
668 aa  377  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  36.58 
 
 
605 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  35.75 
 
 
647 aa  377  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  35.44 
 
 
603 aa  374  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  37.75 
 
 
620 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  35.48 
 
 
648 aa  373  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  38.43 
 
 
621 aa  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  36.35 
 
 
626 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  33.91 
 
 
659 aa  372  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  35.77 
 
 
647 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  35.33 
 
 
647 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  35.47 
 
 
647 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  35.77 
 
 
647 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  36.64 
 
 
612 aa  368  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  36.26 
 
 
602 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  34.97 
 
 
644 aa  369  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  37.6 
 
 
597 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  36.89 
 
 
601 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  37.97 
 
 
597 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  35.01 
 
 
647 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  36.56 
 
 
643 aa  365  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  36.56 
 
 
619 aa  364  2e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  34.72 
 
 
647 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  36.55 
 
 
594 aa  364  3e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  35.86 
 
 
626 aa  363  4e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  35.86 
 
 
626 aa  363  4e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  35.47 
 
 
647 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  35.87 
 
 
607 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  35.58 
 
 
621 aa  362  2e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  37.44 
 
 
630 aa  361  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  38.19 
 
 
560 aa  360  4e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  35.75 
 
 
606 aa  360  4e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  37.21 
 
 
608 aa  360  5e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  35.6 
 
 
600 aa  360  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  35.43 
 
 
607 aa  359  7e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  37.95 
 
 
633 aa  359  8e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  37.03 
 
 
644 aa  359  9e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  33.75 
 
 
623 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  36.56 
 
 
595 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  35.83 
 
 
622 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  36.06 
 
 
605 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  36.45 
 
 
603 aa  357  5e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  35.76 
 
 
600 aa  356  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  36.79 
 
 
618 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  36.97 
 
 
599 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  36.14 
 
 
603 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  35.34 
 
 
625 aa  353  7e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  32.64 
 
 
589 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  35.79 
 
 
661 aa  352  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  35.38 
 
 
643 aa  352  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  36.04 
 
 
687 aa  352  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  32.17 
 
 
606 aa  350  5e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  36.91 
 
 
641 aa  350  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  36.31 
 
 
602 aa  350  5e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  35.27 
 
 
671 aa  347  5e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  36.46 
 
 
629 aa  346  8.999999999999999e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  34.95 
 
 
608 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  35.43 
 
 
617 aa  345  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  30.54 
 
 
621 aa  345  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  33.12 
 
 
572 aa  345  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  34.33 
 
 
611 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  36.42 
 
 
610 aa  344  2.9999999999999997e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  37.01 
 
 
637 aa  344  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  36.97 
 
 
632 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  35.93 
 
 
622 aa  343  7e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  33.64 
 
 
630 aa  341  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  35.33 
 
 
648 aa  340  5e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  34.7 
 
 
608 aa  339  9e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  35.17 
 
 
652 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  36.9 
 
 
621 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  35.19 
 
 
655 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  36.28 
 
 
582 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  34.83 
 
 
612 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  34.74 
 
 
628 aa  335  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  35.56 
 
 
616 aa  334  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>