More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2053 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  77.19 
 
 		 606 aa  944    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 622 aa  1259    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  69.75 
 
 		 602 aa  857    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  61.17 
 
 		 650 aa  788    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  62.38 
 
 		 647 aa  805    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  56.13 
 
 		 589 aa  645    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  55.07 
 
 		 608 aa  643    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  46.73 
 
 		 628 aa  549  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  44.06 
 
 		 607 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  44.15 
 
 		 608 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  41.88 
 
 		 605 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  44.22 
 
 		 607 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  43.23 
 
 		 601 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  38.66 
 
 		 647 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  40.35 
 
 		 632 aa  422  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  38.83 
 
 		 623 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  39.58 
 
 		 625 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  39.4 
 
 		 633 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  40.95 
 
 		 602 aa  412  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  39.43 
 
 		 632 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  38.86 
 
 		 632 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  40.72 
 
 		 611 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  38.86 
 
 		 633 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  38.63 
 
 		 611 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  38.71 
 
 		 633 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  39.16 
 
 		 641 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  38.56 
 
 		 633 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  39.59 
 
 		 629 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  39.14 
 
 		 621 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  39.62 
 
 		 619 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  37.83 
 
 		 645 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  39.38 
 
 		 606 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  38.24 
 
 		 648 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  37.17 
 
 		 635 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  37.63 
 
 		 655 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  38.75 
 
 		 644 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  37.91 
 
 		 670 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  37.66 
 
 		 636 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  37.18 
 
 		 615 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  40.03 
 
 		 612 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  36.15 
 
 		 613 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  39.05 
 
 		 636 aa  393  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  37.25 
 
 		 652 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  40.13 
 
 		 616 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  39.16 
 
 		 632 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  37.95 
 
 		 630 aa  388  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  37.23 
 
 		 603 aa  388  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  38.19 
 
 		 644 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  36.21 
 
 		 559 aa  389  1e-106  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  36.87 
 
 		 575 aa  383  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  39.38 
 
 		 608 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  38.73 
 
 		 597 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  39.64 
 
 		 610 aa  385  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  37.04 
 
 		 574 aa  382  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  36.26 
 
 		 641 aa  385  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  37.89 
 
 		 671 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  36.62 
 
 		 598 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  39.54 
 
 		 648 aa  382  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  38.33 
 
 		 612 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  37.38 
 
 		 643 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  38.09 
 
 		 687 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  38.83 
 
 		 603 aa  376  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  37.28 
 
 		 647 aa  379  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  36.51 
 
 		 616 aa  378  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  39.05 
 
 		 597 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  38.93 
 
 		 604 aa  378  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  36.42 
 
 		 635 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  37.76 
 
 		 635 aa  375  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  34.73 
 
 		 611 aa  373  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  37.72 
 
 		 639 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  38.44 
 
 		 621 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  38.03 
 
 		 594 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  38.45 
 
 		 643 aa  375  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  38.31 
 
 		 595 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  37.83 
 
 		 661 aa  375  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  35.43 
 
 		 626 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  35.43 
 
 		 626 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  38.31 
 
 		 622 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  35.34 
 
 		 647 aa  369  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  36.88 
 
 		 623 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  35.14 
 
 		 647 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  35.34 
 
 		 647 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  36.91 
 
 		 600 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  34.53 
 
 		 630 aa  366  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  34.98 
 
 		 647 aa  369  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  37.58 
 
 		 603 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  36.01 
 
 		 644 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  37.77 
 
 		 628 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  36.88 
 
 		 623 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  36.95 
 
 		 603 aa  368  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  34.67 
 
 		 649 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  39.07 
 
 		 621 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  37.38 
 
 		 618 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  34.98 
 
 		 647 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  34.56 
 
 		 644 aa  369  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  35.34 
 
 		 647 aa  365  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  36.88 
 
 		 599 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  37.86 
 
 		 633 aa  364  2e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  37.8 
 
 		 620 aa  365  2e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  36.91 
 
 		 605 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>