More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3539 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  95.98 
 
 
647 aa  1252    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  91.5 
 
 
626 aa  1186    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  95.83 
 
 
647 aa  1239    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  96.29 
 
 
647 aa  1243    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  95.98 
 
 
647 aa  1237    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  59.88 
 
 
630 aa  758    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  95.36 
 
 
647 aa  1245    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  89.69 
 
 
649 aa  1190    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  65.02 
 
 
619 aa  831    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  91.5 
 
 
626 aa  1186    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  95.67 
 
 
647 aa  1246    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  95.36 
 
 
647 aa  1246    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
644 aa  1326    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  48.85 
 
 
645 aa  625  1e-177  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  46.51 
 
 
669 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  45.51 
 
 
659 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  43.83 
 
 
668 aa  576  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  45.08 
 
 
647 aa  571  1e-161  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  45.78 
 
 
656 aa  561  1e-158  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  44.73 
 
 
648 aa  555  1e-156  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  39.2 
 
 
639 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  40.06 
 
 
630 aa  423  1e-117  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  36.76 
 
 
680 aa  422  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  37.65 
 
 
665 aa  415  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  36.27 
 
 
644 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  36.19 
 
 
674 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  36.63 
 
 
622 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  36.38 
 
 
674 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  35.94 
 
 
640 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  35.5 
 
 
620 aa  396  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  35.33 
 
 
585 aa  396  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  34.78 
 
 
612 aa  392  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  36.49 
 
 
603 aa  389  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  35.05 
 
 
586 aa  381  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  35.19 
 
 
612 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  33.38 
 
 
692 aa  371  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  34.67 
 
 
632 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  35.17 
 
 
631 aa  369  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  34.21 
 
 
628 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  34.56 
 
 
622 aa  369  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 
647 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  34.51 
 
 
605 aa  365  1e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  34.98 
 
 
606 aa  361  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  33.9 
 
 
603 aa  360  4e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  33.28 
 
 
605 aa  357  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  32.75 
 
 
647 aa  356  5.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0376  DNA mismatch repair protein MutL  32.43 
 
 
709 aa  355  2e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.13305  normal  0.32452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  32.35 
 
 
602 aa  350  5e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  33.38 
 
 
584 aa  348  2e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0007  DNA mismatch repair protein MutL  33.52 
 
 
709 aa  347  4e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953905  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  32.61 
 
 
599 aa  347  5e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  31.62 
 
 
670 aa  343  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  32.93 
 
 
652 aa  343  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  32.32 
 
 
602 aa  343  5.999999999999999e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  32.67 
 
 
655 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  32.31 
 
 
636 aa  340  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  33.9 
 
 
626 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  32.09 
 
 
635 aa  338  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  33.84 
 
 
641 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  31.78 
 
 
647 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  34.35 
 
 
588 aa  335  2e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  31.94 
 
 
629 aa  334  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  33.18 
 
 
624 aa  334  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  34.09 
 
 
628 aa  333  5e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  33.59 
 
 
574 aa  333  5e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  31.64 
 
 
607 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  32.35 
 
 
600 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 
644 aa  332  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  33.69 
 
 
625 aa  332  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  31.95 
 
 
687 aa  331  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  33.13 
 
 
620 aa  332  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  31.64 
 
 
607 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  33.13 
 
 
629 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  31.45 
 
 
623 aa  329  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  31.45 
 
 
623 aa  329  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  32.72 
 
 
608 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  32.93 
 
 
621 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  32.98 
 
 
643 aa  329  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  33.38 
 
 
629 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  31.48 
 
 
641 aa  328  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  32.58 
 
 
644 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  31.53 
 
 
661 aa  327  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  32.69 
 
 
641 aa  327  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  30.97 
 
 
608 aa  327  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  31.78 
 
 
623 aa  327  6e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  32.92 
 
 
606 aa  327  6e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  31.77 
 
 
626 aa  326  6e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  32.57 
 
 
626 aa  325  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  32.31 
 
 
610 aa  324  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  32.77 
 
 
615 aa  323  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  31.96 
 
 
624 aa  323  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  31.58 
 
 
600 aa  323  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  31.74 
 
 
671 aa  323  8e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  32.83 
 
 
611 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  32.21 
 
 
644 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  31.89 
 
 
605 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  31.44 
 
 
633 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  31.51 
 
 
648 aa  319  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  32.31 
 
 
645 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  40.93 
 
 
755 aa  316  7e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>