More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4044 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 628 aa  1258    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  37.89 
 
 		 628 aa  393  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  34.94 
 
 		 647 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  38.93 
 
 		 605 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  37.91 
 
 		 606 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  37.77 
 
 		 622 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  38.09 
 
 		 608 aa  362  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  36.24 
 
 		 647 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  37.5 
 
 		 608 aa  356  5.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  35.6 
 
 		 639 aa  356  7.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  36.98 
 
 		 602 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  34.94 
 
 		 624 aa  350  6e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0086  DNA mismatch repair protein MutL  37.56 
 
 		 633 aa  349  8e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.243153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  35.89 
 
 		 626 aa  349  1e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  33.85 
 
 		 626 aa  345  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  34.98 
 
 		 603 aa  345  1e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  38.28 
 
 		 589 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  38.15 
 
 		 607 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  38.79 
 
 		 608 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  34.38 
 
 		 623 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  31.21 
 
 		 692 aa  336  7.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  34.74 
 
 		 631 aa  335  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  34.82 
 
 		 644 aa  335  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  38.27 
 
 		 605 aa  332  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  38.03 
 
 		 607 aa  331  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  37.87 
 
 		 605 aa  331  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  36.68 
 
 		 632 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  35.3 
 
 		 625 aa  330  6e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  31.07 
 
 		 644 aa  329  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  35.79 
 
 		 621 aa  329  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  35.89 
 
 		 632 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  37.54 
 
 		 612 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  35.61 
 
 		 644 aa  326  8.000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  31.67 
 
 		 668 aa  326  9e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  35.68 
 
 		 629 aa  325  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  36.28 
 
 		 612 aa  324  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  35.57 
 
 		 619 aa  324  3e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  35.91 
 
 		 620 aa  323  5e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  35.39 
 
 		 623 aa  323  7e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  35.35 
 
 		 623 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  35.35 
 
 		 623 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  37.48 
 
 		 601 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  35.14 
 
 		 566 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  33.54 
 
 		 628 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  35.47 
 
 		 633 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  37.25 
 
 		 621 aa  321  3e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  32.09 
 
 		 629 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  36.38 
 
 		 616 aa  320  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  35.47 
 
 		 633 aa  320  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  35.45 
 
 		 600 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  32.92 
 
 		 622 aa  319  7.999999999999999e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  35.59 
 
 		 606 aa  319  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  33.85 
 
 		 629 aa  319  1e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  36.21 
 
 		 634 aa  319  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  31.65 
 
 		 610 aa  319  1e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  35.27 
 
 		 640 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  34.06 
 
 		 630 aa  316  7e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  31.3 
 
 		 647 aa  316  9e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  30.25 
 
 		 659 aa  316  9.999999999999999e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  34.51 
 
 		 633 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  35.88 
 
 		 605 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  35.96 
 
 		 611 aa  313  6.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  35.89 
 
 		 626 aa  312  9e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  35.09 
 
 		 617 aa  312  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  35.3 
 
 		 633 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  36.1 
 
 		 598 aa  311  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  32.54 
 
 		 586 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  35.19 
 
 		 632 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  35.19 
 
 		 632 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  36.81 
 
 		 565 aa  310  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  30.29 
 
 		 617 aa  310  5.9999999999999995e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  35.52 
 
 		 641 aa  310  5.9999999999999995e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  35.67 
 
 		 635 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  35.45 
 
 		 600 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  29.64 
 
 		 645 aa  308  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  32.72 
 
 		 641 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  35.81 
 
 		 626 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  30.03 
 
 		 614 aa  308  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 		 619 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  35.01 
 
 		 612 aa  306  6e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  33.23 
 
 		 645 aa  306  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0215  DNA mismatch repair protein MutL  34.06 
 
 		 608 aa  305  1.0000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.137951 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  34.02 
 
 		 584 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  34.23 
 
 		 648 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  35.04 
 
 		 611 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  35.66 
 
 		 622 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  33.18 
 
 		 618 aa  304  4.0000000000000003e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  29.48 
 
 		 621 aa  302  1e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  36.06 
 
 		 610 aa  302  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  36.91 
 
 		 643 aa  302  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  34.69 
 
 		 602 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  31.16 
 
 		 559 aa  301  2e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  35.85 
 
 		 560 aa  301  3e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  35.49 
 
 		 643 aa  299  8e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  35.74 
 
 		 585 aa  299  9e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  31.42 
 
 		 626 aa  299  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  31.42 
 
 		 626 aa  299  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  36.87 
 
 		 628 aa  299  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  33.75 
 
 		 647 aa  297  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  34.43 
 
 		 620 aa  297  4e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>