More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0100 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  64.21 
 
 		 612 aa  772    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  54.25 
 
 		 631 aa  659    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  86.47 
 
 		 605 aa  1036    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 605 aa  1214    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  44.37 
 
 		 566 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  44.04 
 
 		 566 aa  463  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  41.89 
 
 		 566 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  39.87 
 
 		 586 aa  421  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  40.58 
 
 		 620 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  36.08 
 
 		 559 aa  390  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  37.27 
 
 		 640 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  37.97 
 
 		 628 aa  385  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  38.88 
 
 		 565 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  38.21 
 
 		 605 aa  376  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  35.1 
 
 		 656 aa  376  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  41.53 
 
 		 560 aa  375  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  38.59 
 
 		 606 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  32.82 
 
 		 644 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  38.91 
 
 		 623 aa  371  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  38.13 
 
 		 626 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  38.91 
 
 		 623 aa  371  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  38.01 
 
 		 632 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  42.02 
 
 		 582 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  35.48 
 
 		 639 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  36.69 
 
 		 619 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  34.09 
 
 		 668 aa  365  1e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  37.6 
 
 		 630 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  36.09 
 
 		 647 aa  365  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  39.07 
 
 		 606 aa  363  6e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  33.39 
 
 		 614 aa  361  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  39.47 
 
 		 620 aa  360  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  35.77 
 
 		 648 aa  360  3e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  33.08 
 
 		 645 aa  360  5e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  38.07 
 
 		 600 aa  360  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  39.61 
 
 		 612 aa  359  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  34.21 
 
 		 572 aa  360  6e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  40 
 
 		 632 aa  359  6e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  33.59 
 
 		 649 aa  359  7e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 		 669 aa  359  7e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  36.29 
 
 		 603 aa  359  9.999999999999999e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  38.93 
 
 		 585 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  39.11 
 
 		 616 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  34.05 
 
 		 647 aa  356  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  40.36 
 
 		 610 aa  355  8.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  34.12 
 
 		 626 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  34.12 
 
 		 626 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  32.77 
 
 		 647 aa  355  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  38.41 
 
 		 600 aa  355  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  37.46 
 
 		 597 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  33.9 
 
 		 647 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  37.3 
 
 		 622 aa  353  4e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  33.85 
 
 		 647 aa  353  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  33.59 
 
 		 647 aa  353  5e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  33.18 
 
 		 647 aa  353  7e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  33.38 
 
 		 644 aa  353  7e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  33.13 
 
 		 647 aa  352  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  34.06 
 
 		 659 aa  352  2e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  36.45 
 
 		 602 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  30.98 
 
 		 606 aa  349  9e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  39.2 
 
 		 594 aa  348  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  35.92 
 
 		 611 aa  348  2e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  37.7 
 
 		 602 aa  347  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  37.29 
 
 		 643 aa  347  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  35.5 
 
 		 617 aa  346  6e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  37.54 
 
 		 644 aa  345  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  38.42 
 
 		 601 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  38.51 
 
 		 605 aa  345  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  38.16 
 
 		 643 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  35.84 
 
 		 584 aa  344  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  37.33 
 
 		 603 aa  343  5e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  37.82 
 
 		 603 aa  343  5e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  36.35 
 
 		 612 aa  342  8e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  37.28 
 
 		 597 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  36.58 
 
 		 595 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  38.04 
 
 		 603 aa  341  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  29.94 
 
 		 621 aa  340  4e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  37.42 
 
 		 621 aa  340  5e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  34.2 
 
 		 644 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  38.66 
 
 		 621 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  37.42 
 
 		 625 aa  337  5e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  36.79 
 
 		 608 aa  337  5e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  37.42 
 
 		 619 aa  336  9e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  36.11 
 
 		 599 aa  336  9e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  37.05 
 
 		 671 aa  334  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  33.44 
 
 		 624 aa  332  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  36.48 
 
 		 618 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  38.27 
 
 		 628 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  35.81 
 
 		 599 aa  332  1e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  36.05 
 
 		 607 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  37.04 
 
 		 687 aa  332  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  36.55 
 
 		 622 aa  332  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2869  DNA mismatch repair protein MutL  36.72 
 
 		 605 aa  330  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  37.26 
 
 		 608 aa  329  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  36.67 
 
 		 607 aa  329  9e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  37.31 
 
 		 611 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  35.28 
 
 		 603 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  36.79 
 
 		 661 aa  327  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0034  DNA mismatch repair protein MutL  39.22 
 
 		 590 aa  327  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  35.17 
 
 		 608 aa  326  6e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  32.58 
 
 		 626 aa  326  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>