More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3225 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
599 aa  1213    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  44.24 
 
 
585 aa  476  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  41.5 
 
 
603 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  42.36 
 
 
612 aa  451  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  40.43 
 
 
588 aa  414  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  38.71 
 
 
603 aa  385  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  37.88 
 
 
560 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  33.8 
 
 
644 aa  360  5e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  32.72 
 
 
649 aa  359  8e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  36.94 
 
 
559 aa  358  1.9999999999999998e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  36.07 
 
 
619 aa  356  5e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  32.75 
 
 
626 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  32.57 
 
 
668 aa  352  1e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  32.75 
 
 
626 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  32.61 
 
 
647 aa  351  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 
656 aa  350  3e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  31.91 
 
 
659 aa  349  1e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  36.07 
 
 
640 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  32.61 
 
 
644 aa  347  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  33.82 
 
 
614 aa  347  5e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  35.88 
 
 
612 aa  346  8e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  32.15 
 
 
647 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  36.44 
 
 
620 aa  343  5.999999999999999e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  38.54 
 
 
605 aa  343  5.999999999999999e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  34.72 
 
 
566 aa  342  2e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  34.71 
 
 
566 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 
647 aa  341  2.9999999999999998e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  34.53 
 
 
630 aa  339  8e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  33.81 
 
 
648 aa  338  1.9999999999999998e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  33.08 
 
 
647 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  31.32 
 
 
645 aa  335  2e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  36.77 
 
 
622 aa  334  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  34.29 
 
 
566 aa  332  1e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  34.37 
 
 
639 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  35.81 
 
 
605 aa  332  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  33.5 
 
 
586 aa  332  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  33.11 
 
 
572 aa  326  7e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  34.56 
 
 
565 aa  321  3e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  36.41 
 
 
605 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  35.21 
 
 
584 aa  320  5e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  30.49 
 
 
669 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  37.05 
 
 
608 aa  319  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  34.05 
 
 
647 aa  318  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  34.33 
 
 
631 aa  317  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  36.12 
 
 
557 aa  311  2e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  32.91 
 
 
632 aa  307  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  32.01 
 
 
644 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  33.44 
 
 
628 aa  302  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  30.17 
 
 
589 aa  301  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  33.07 
 
 
624 aa  299  9e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  34.09 
 
 
602 aa  299  9e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  33.17 
 
 
589 aa  298  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  34.57 
 
 
606 aa  297  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  34.04 
 
 
607 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  33.94 
 
 
622 aa  295  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  32.08 
 
 
601 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  33.17 
 
 
608 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  33.55 
 
 
625 aa  293  9e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  32.74 
 
 
630 aa  292  1e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  32.43 
 
 
607 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  31.65 
 
 
623 aa  288  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  33.02 
 
 
623 aa  286  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  35.23 
 
 
582 aa  286  8e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  32.17 
 
 
626 aa  286  9e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  32.47 
 
 
626 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 
611 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  30.73 
 
 
617 aa  281  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  32.6 
 
 
635 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  33.07 
 
 
647 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  32.43 
 
 
619 aa  279  8e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  30.18 
 
 
610 aa  280  8e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  32.74 
 
 
598 aa  278  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  32.43 
 
 
621 aa  278  2e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  33.06 
 
 
574 aa  276  5e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  32.58 
 
 
608 aa  276  8e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  33.06 
 
 
575 aa  276  8e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  32.52 
 
 
632 aa  276  9e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  32.76 
 
 
641 aa  276  9e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  31.4 
 
 
630 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  31.93 
 
 
618 aa  275  2.0000000000000002e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  30.67 
 
 
641 aa  274  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  41.08 
 
 
695 aa  274  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  32.59 
 
 
636 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  32.5 
 
 
632 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  32.59 
 
 
629 aa  272  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  31.95 
 
 
616 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 
610 aa  271  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  32.32 
 
 
610 aa  271  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  31.8 
 
 
608 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  33.39 
 
 
603 aa  270  7e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  31.22 
 
 
635 aa  270  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  32.08 
 
 
632 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  31.34 
 
 
629 aa  269  8.999999999999999e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  28.28 
 
 
621 aa  269  8.999999999999999e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  31.63 
 
 
617 aa  269  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  31.87 
 
 
645 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  31.87 
 
 
633 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0599  DNA mismatch repair protein MutL  31.11 
 
 
621 aa  268  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0798741  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  30.87 
 
 
628 aa  268  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  30.78 
 
 
626 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>