More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1006 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  86.22 
 
 		 566 aa  996    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  85.87 
 
 		 566 aa  994    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 566 aa  1151    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  42.93 
 
 		 605 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  41.89 
 
 		 605 aa  448  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  41.57 
 
 		 612 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  38.19 
 
 		 631 aa  425  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  39.04 
 
 		 586 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  38.09 
 
 		 620 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  39.79 
 
 		 560 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  38.97 
 
 		 565 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  37.08 
 
 		 559 aa  364  3e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  35.15 
 
 		 647 aa  363  6e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  34.91 
 
 		 614 aa  359  7e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  35.89 
 
 		 603 aa  356  5e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  35.2 
 
 		 612 aa  356  5.999999999999999e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  35.68 
 
 		 619 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  36.81 
 
 		 557 aa  353  4e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  36.49 
 
 		 585 aa  347  3e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  34.76 
 
 		 605 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  37.1 
 
 		 589 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  32.77 
 
 		 589 aa  342  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  36.1 
 
 		 584 aa  341  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  34.71 
 
 		 599 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  36.32 
 
 		 572 aa  340  4e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  34.98 
 
 		 606 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  36.33 
 
 		 594 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  33.07 
 
 		 647 aa  336  5.999999999999999e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  35.13 
 
 		 622 aa  332  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  35.02 
 
 		 607 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  34.92 
 
 		 607 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  36.59 
 
 		 601 aa  329  8e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  34.74 
 
 		 608 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  34.72 
 
 		 602 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  35.27 
 
 		 619 aa  327  3e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  33.11 
 
 		 606 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  36.61 
 
 		 602 aa  327  5e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  35.05 
 
 		 608 aa  324  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  34.78 
 
 		 621 aa  324  3e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  31.79 
 
 		 632 aa  319  7.999999999999999e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  37.52 
 
 		 582 aa  318  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1331  DNA mismatch repair protein MutL  35.48 
 
 		 579 aa  317  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0034  DNA mismatch repair protein MutL  35.57 
 
 		 590 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  34.75 
 
 		 608 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  36.24 
 
 		 600 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  34.63 
 
 		 582 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  35.75 
 
 		 588 aa  313  6.999999999999999e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  35.36 
 
 		 599 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  36.74 
 
 		 612 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  35.8 
 
 		 611 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  36.24 
 
 		 600 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  33.66 
 
 		 603 aa  310  5e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  33.88 
 
 		 622 aa  309  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  35.26 
 
 		 603 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  36.54 
 
 		 632 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  36.53 
 
 		 616 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  34.38 
 
 		 603 aa  307  4.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  34.49 
 
 		 598 aa  302  9e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  34.24 
 
 		 615 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  35.09 
 
 		 597 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  34.42 
 
 		 574 aa  300  6e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  34.42 
 
 		 575 aa  300  6e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  34.43 
 
 		 597 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  34.48 
 
 		 605 aa  299  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  34.93 
 
 		 595 aa  298  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  35.06 
 
 		 603 aa  297  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  34.08 
 
 		 643 aa  297  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  31.54 
 
 		 623 aa  297  4e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  33.94 
 
 		 604 aa  297  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  32.64 
 
 		 628 aa  296  6e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  34.82 
 
 		 610 aa  296  8e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  34.09 
 
 		 613 aa  295  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  35.37 
 
 		 611 aa  294  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  33.76 
 
 		 617 aa  294  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  32.1 
 
 		 635 aa  293  6e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  32.65 
 
 		 630 aa  293  6e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  34.31 
 
 		 610 aa  293  8e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  34.66 
 
 		 620 aa  292  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  34.57 
 
 		 611 aa  291  2e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  34.17 
 
 		 606 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  34.58 
 
 		 603 aa  291  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  34.19 
 
 		 618 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  34.3 
 
 		 595 aa  289  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  32.64 
 
 		 635 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  34.3 
 
 		 595 aa  289  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  33.55 
 
 		 608 aa  288  2e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1711  DNA mismatch repair protein MutL  32.72 
 
 		 588 aa  288  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.619498  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  34.49 
 
 		 632 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  33.39 
 
 		 626 aa  286  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  33.92 
 
 		 644 aa  286  5.999999999999999e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  31.99 
 
 		 657 aa  286  8e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  33.86 
 
 		 648 aa  286  9e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  34.18 
 
 		 632 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  34.18 
 
 		 633 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0215  DNA mismatch repair protein MutL  32.03 
 
 		 608 aa  283  4.0000000000000003e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.137951 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  33.59 
 
 		 660 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  34.28 
 
 		 623 aa  283  6.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  34.28 
 
 		 623 aa  283  6.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  34.28 
 
 		 633 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  44.62 
 
 		 668 aa  282  1e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>