More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1924 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 560 aa  1118    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  45.42 
 
 		 565 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  41.63 
 
 		 605 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  38.24 
 
 		 640 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  39.86 
 
 		 566 aa  379  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  39.79 
 
 		 566 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  38.32 
 
 		 639 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  41.63 
 
 		 605 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  39.48 
 
 		 566 aa  370  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  40.07 
 
 		 620 aa  369  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  37.88 
 
 		 599 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  40.82 
 
 		 612 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  36.47 
 
 		 559 aa  364  2e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  39.46 
 
 		 585 aa  363  4e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  37.72 
 
 		 631 aa  363  6e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  34.09 
 
 		 647 aa  361  2e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  39.53 
 
 		 608 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  36.75 
 
 		 586 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  38.65 
 
 		 602 aa  347  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  38.92 
 
 		 588 aa  346  8e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  35.77 
 
 		 603 aa  345  1e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  36.07 
 
 		 647 aa  342  7e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  37.73 
 
 		 602 aa  340  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  35.11 
 
 		 619 aa  339  8e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  34.9 
 
 		 572 aa  338  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  35.64 
 
 		 612 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  33.75 
 
 		 656 aa  338  1.9999999999999998e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  33.44 
 
 		 623 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  34.35 
 
 		 617 aa  337  5e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  38.5 
 
 		 601 aa  333  5e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  38.73 
 
 		 607 aa  333  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  35.36 
 
 		 622 aa  332  9e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  34.29 
 
 		 626 aa  331  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  33.98 
 
 		 628 aa  331  2e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  38.44 
 
 		 607 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  37.94 
 
 		 623 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  39.41 
 
 		 608 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  35.66 
 
 		 622 aa  330  5.0000000000000004e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  39.09 
 
 		 611 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  35.88 
 
 		 606 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  37.14 
 
 		 598 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  34.89 
 
 		 629 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  34.37 
 
 		 610 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  40.17 
 
 		 582 aa  327  5e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  34.43 
 
 		 589 aa  327  5e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  36.07 
 
 		 620 aa  326  9e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  37.67 
 
 		 611 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  37.72 
 
 		 633 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  37.4 
 
 		 633 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  36.01 
 
 		 648 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  37.54 
 
 		 643 aa  317  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  35.62 
 
 		 589 aa  316  6e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  34.8 
 
 		 611 aa  316  6e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  38.18 
 
 		 603 aa  316  8e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  35.45 
 
 		 605 aa  316  8e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  32.69 
 
 		 624 aa  316  8e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  36.03 
 
 		 645 aa  316  9e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  35.99 
 
 		 628 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  37.82 
 
 		 594 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0034  DNA mismatch repair protein MutL  39.09 
 
 		 590 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  36.53 
 
 		 615 aa  312  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  38.69 
 
 		 597 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  36.54 
 
 		 575 aa  312  1e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  36.56 
 
 		 574 aa  310  4e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  35.26 
 
 		 600 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  34.8 
 
 		 584 aa  310  4e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  35.84 
 
 		 632 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  35.85 
 
 		 628 aa  310  5.9999999999999995e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  35.68 
 
 		 633 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  38.24 
 
 		 595 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  35.75 
 
 		 635 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  36.9 
 
 		 603 aa  307  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  35.19 
 
 		 633 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  38.45 
 
 		 612 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  36.07 
 
 		 632 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  36.26 
 
 		 603 aa  305  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  38.1 
 
 		 597 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  34.93 
 
 		 600 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  36.63 
 
 		 625 aa  304  4.0000000000000003e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  36.94 
 
 		 599 aa  302  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  34.72 
 
 		 636 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  38.39 
 
 		 632 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  34.12 
 
 		 603 aa  301  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  31.31 
 
 		 606 aa  301  2e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  34.19 
 
 		 616 aa  301  3e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  36.71 
 
 		 610 aa  300  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  36.46 
 
 		 637 aa  299  9e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  36.01 
 
 		 606 aa  299  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  44.35 
 
 		 755 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  36.9 
 
 		 603 aa  298  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  33.6 
 
 		 617 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  35.19 
 
 		 610 aa  298  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  37.6 
 
 		 616 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  34.34 
 
 		 630 aa  297  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  34.35 
 
 		 632 aa  297  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  33.06 
 
 		 608 aa  296  5e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  34.53 
 
 		 613 aa  296  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  36.16 
 
 		 621 aa  295  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  37.34 
 
 		 628 aa  295  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  35.14 
 
 		 605 aa  295  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>