More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1041 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  58.88 
 
 		 621 aa  702    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 606 aa  1215    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  35.34 
 
 		 665 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  32.36 
 
 		 605 aa  362  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  30.97 
 
 		 605 aa  353  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  30.91 
 
 		 647 aa  352  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  32.17 
 
 		 631 aa  351  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  35.16 
 
 		 589 aa  349  8e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  30.86 
 
 		 606 aa  348  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  34.64 
 
 		 586 aa  346  7e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  33.55 
 
 		 603 aa  346  8e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  31.88 
 
 		 612 aa  345  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  31.94 
 
 		 602 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  30.41 
 
 		 608 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  35.61 
 
 		 572 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  30.73 
 
 		 622 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  35.58 
 
 		 559 aa  335  2e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  34.21 
 
 		 644 aa  333  4e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  32.97 
 
 		 620 aa  331  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  31.1 
 
 		 622 aa  330  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  33.11 
 
 		 566 aa  330  6e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  34.21 
 
 		 566 aa  329  7e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  33.77 
 
 		 566 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  32.88 
 
 		 640 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  33.54 
 
 		 647 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  33.08 
 
 		 641 aa  326  7e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  33.08 
 
 		 644 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  33.08 
 
 		 647 aa  325  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 		 647 aa  325  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  29.94 
 
 		 647 aa  325  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  34.17 
 
 		 626 aa  324  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  34.17 
 
 		 626 aa  324  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  33.6 
 
 		 584 aa  323  4e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 		 647 aa  323  5e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 		 647 aa  323  5e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  33.44 
 
 		 656 aa  323  5e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  32.93 
 
 		 647 aa  323  6e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  31.44 
 
 		 615 aa  323  6e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  31.06 
 
 		 668 aa  322  9.999999999999999e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  28.04 
 
 		 632 aa  322  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  31.33 
 
 		 575 aa  321  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  29.29 
 
 		 607 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  32.12 
 
 		 616 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  28.94 
 
 		 608 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  29.7 
 
 		 628 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  31.32 
 
 		 574 aa  320  7e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  30.14 
 
 		 648 aa  319  7e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  32.67 
 
 		 659 aa  319  9e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  29.29 
 
 		 607 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  32.78 
 
 		 647 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  30.16 
 
 		 605 aa  318  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  30.37 
 
 		 623 aa  317  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  32.93 
 
 		 649 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  33.59 
 
 		 626 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  34.8 
 
 		 619 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  30.77 
 
 		 565 aa  312  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  31.88 
 
 		 647 aa  311  2e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  29.56 
 
 		 598 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  28.85 
 
 		 606 aa  308  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  30.92 
 
 		 611 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  29.12 
 
 		 652 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  29.63 
 
 		 602 aa  305  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  30.33 
 
 		 626 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  30.8 
 
 		 648 aa  304  2.0000000000000002e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  29.67 
 
 		 643 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  28.89 
 
 		 636 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  29.9 
 
 		 601 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  31.74 
 
 		 644 aa  302  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  29.07 
 
 		 625 aa  302  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  31.71 
 
 		 623 aa  301  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  30.89 
 
 		 630 aa  301  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  31.05 
 
 		 624 aa  301  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  31.33 
 
 		 608 aa  301  3e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  32.2 
 
 		 645 aa  300  5e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  29.65 
 
 		 600 aa  300  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  31.28 
 
 		 626 aa  300  6e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  33.23 
 
 		 624 aa  300  7e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  28.26 
 
 		 705 aa  299  9e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  28.01 
 
 		 655 aa  299  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  29.38 
 
 		 632 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  29.7 
 
 		 632 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  30.26 
 
 		 611 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  29.31 
 
 		 691 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  31.03 
 
 		 585 aa  298  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  28.59 
 
 		 633 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  28.96 
 
 		 613 aa  298  3e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  29.31 
 
 		 617 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  29.49 
 
 		 600 aa  297  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  29.55 
 
 		 633 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  31.03 
 
 		 588 aa  296  8e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  31.15 
 
 		 560 aa  296  9e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  28.64 
 
 		 604 aa  296  9e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  30.51 
 
 		 612 aa  295  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  29.13 
 
 		 582 aa  295  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  29.63 
 
 		 630 aa  296  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  31.63 
 
 		 628 aa  295  2e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  30.08 
 
 		 616 aa  294  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  28.71 
 
 		 623 aa  293  5e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  28.71 
 
 		 623 aa  293  5e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  30.06 
 
 		 632 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>