More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1981 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  62.95 
 
 
624 aa  815    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  69.75 
 
 
626 aa  918    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
626 aa  1286    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  69.18 
 
 
644 aa  909    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  67.77 
 
 
624 aa  874    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  63.22 
 
 
622 aa  808    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  67.55 
 
 
629 aa  857    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  42.93 
 
 
608 aa  511  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  38.41 
 
 
610 aa  473  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  39.4 
 
 
623 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  36.91 
 
 
630 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  36.12 
 
 
629 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  34.83 
 
 
685 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  35.41 
 
 
628 aa  405  1e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  35.02 
 
 
617 aa  391  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  32.31 
 
 
644 aa  360  4e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  33.86 
 
 
625 aa  360  5e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  34.77 
 
 
608 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  35.09 
 
 
639 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 
661 aa  350  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  32.49 
 
 
647 aa  349  7e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  35.07 
 
 
628 aa  349  8e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  35.89 
 
 
628 aa  349  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  34.65 
 
 
605 aa  348  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  33.9 
 
 
602 aa  348  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  36.35 
 
 
606 aa  347  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  34.72 
 
 
629 aa  346  6e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  32.37 
 
 
681 aa  346  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  35.07 
 
 
621 aa  346  8e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  35.16 
 
 
619 aa  345  1e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  35.75 
 
 
622 aa  345  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  35.78 
 
 
643 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  32.42 
 
 
681 aa  345  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  33.59 
 
 
632 aa  344  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  32.72 
 
 
661 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  32.67 
 
 
705 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  34.14 
 
 
647 aa  341  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2145  DNA mismatch repair protein MutL  32.32 
 
 
612 aa  341  2.9999999999999998e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000372508  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  33.44 
 
 
652 aa  340  7e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  33.28 
 
 
586 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  34.7 
 
 
645 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  34.01 
 
 
632 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  34.6 
 
 
635 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  34.01 
 
 
633 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 
632 aa  336  7e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  34.18 
 
 
572 aa  336  7.999999999999999e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  32.61 
 
 
655 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  34.25 
 
 
617 aa  335  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  32.19 
 
 
611 aa  333  4e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  34.44 
 
 
648 aa  334  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  33.44 
 
 
630 aa  334  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  33.96 
 
 
633 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  34.02 
 
 
623 aa  333  8e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  34.31 
 
 
633 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  32.56 
 
 
623 aa  332  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  32.56 
 
 
623 aa  332  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  33.54 
 
 
597 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  33.99 
 
 
628 aa  331  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  34.16 
 
 
633 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  35.11 
 
 
603 aa  330  4e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  34.07 
 
 
607 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  34.07 
 
 
621 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  34.93 
 
 
620 aa  329  9e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  32.77 
 
 
641 aa  329  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  34.61 
 
 
602 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  32.86 
 
 
626 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  32.86 
 
 
626 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  30.99 
 
 
613 aa  327  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  32.42 
 
 
647 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  32.87 
 
 
640 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  33.69 
 
 
620 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  34.3 
 
 
618 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  32.62 
 
 
626 aa  327  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  34.18 
 
 
603 aa  327  6e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  34.76 
 
 
622 aa  327  6e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  33.49 
 
 
616 aa  325  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  34.81 
 
 
597 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  32.96 
 
 
605 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 
595 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  31.9 
 
 
647 aa  324  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  34.07 
 
 
630 aa  323  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  31.74 
 
 
647 aa  323  5e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  34.07 
 
 
607 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  32.48 
 
 
603 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  31.97 
 
 
647 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  31.35 
 
 
647 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  31.74 
 
 
647 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  32.12 
 
 
647 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  34.23 
 
 
608 aa  321  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  31.6 
 
 
647 aa  320  5e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  30.99 
 
 
636 aa  319  7.999999999999999e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  33.75 
 
 
644 aa  319  7.999999999999999e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  32.52 
 
 
649 aa  319  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  34.57 
 
 
603 aa  318  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  32.66 
 
 
641 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  33.02 
 
 
619 aa  318  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  34.37 
 
 
605 aa  317  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  34.48 
 
 
612 aa  317  5e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  32.13 
 
 
622 aa  316  8e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  32.93 
 
 
648 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>