More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0864 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 645 aa  1329    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  75.71 
 
 		 669 aa  1029    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  50.23 
 
 		 619 aa  637    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  48.85 
 
 		 644 aa  621  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  48.09 
 
 		 649 aa  616  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  47.86 
 
 		 647 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  48.61 
 
 		 626 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  47.79 
 
 		 647 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  47.86 
 
 		 647 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  48.61 
 
 		 626 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  48.17 
 
 		 647 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  48.17 
 
 		 647 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  48.23 
 
 		 630 aa  609  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  48 
 
 		 647 aa  610  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  44.85 
 
 		 659 aa  571  1e-161  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  44.05 
 
 		 647 aa  561  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  41.93 
 
 		 668 aa  554  1e-156  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  43.6 
 
 		 656 aa  545  1e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  42.37 
 
 		 648 aa  543  1e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  36.45 
 
 		 603 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  36.77 
 
 		 630 aa  399  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  35.79 
 
 		 680 aa  395  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  34.9 
 
 		 644 aa  395  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  35.04 
 
 		 640 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  34.47 
 
 		 612 aa  389  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  33.92 
 
 		 674 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  34.41 
 
 		 692 aa  385  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  34.39 
 
 		 695 aa  385  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  34.7 
 
 		 639 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  33.04 
 
 		 674 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  35.29 
 
 		 620 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  34.57 
 
 		 612 aa  382  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  34.3 
 
 		 631 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  34.57 
 
 		 586 aa  379  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  33.85 
 
 		 628 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  33.65 
 
 		 622 aa  375  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  33.64 
 
 		 650 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  32.93 
 
 		 647 aa  368  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  34.06 
 
 		 614 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  33.59 
 
 		 622 aa  361  3e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  33.08 
 
 		 605 aa  360  5e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  33.38 
 
 		 605 aa  356  6.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 		 603 aa  353  4e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  32.29 
 
 		 665 aa  352  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  32.35 
 
 		 602 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  31.22 
 
 		 692 aa  350  6e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  32.67 
 
 		 608 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  30.62 
 
 		 647 aa  345  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  33.95 
 
 		 611 aa  343  4e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  32.98 
 
 		 606 aa  342  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  32.16 
 
 		 605 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  33.13 
 
 		 641 aa  337  3.9999999999999995e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  33.94 
 
 		 621 aa  337  5e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  32.2 
 
 		 630 aa  335  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  31.32 
 
 		 599 aa  335  2e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  32.1 
 
 		 626 aa  334  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  32.12 
 
 		 585 aa  331  3e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  31.48 
 
 		 623 aa  330  4e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  31.48 
 
 		 623 aa  330  4e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  32.36 
 
 		 600 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  31.8 
 
 		 629 aa  329  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  31.15 
 
 		 636 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  31.4 
 
 		 635 aa  326  7e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  30 
 
 		 632 aa  323  8e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  30.35 
 
 		 617 aa  323  8e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  30.77 
 
 		 647 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  29.89 
 
 		 632 aa  322  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  31.11 
 
 		 600 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  29.85 
 
 		 616 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  30.94 
 
 		 584 aa  320  5e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  30.34 
 
 		 644 aa  319  9e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  32.23 
 
 		 644 aa  318  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  30.39 
 
 		 621 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  31.6 
 
 		 608 aa  318  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  30.08 
 
 		 643 aa  318  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  30.5 
 
 		 655 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  30.38 
 
 		 652 aa  317  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  32.37 
 
 		 644 aa  317  5e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  30.69 
 
 		 629 aa  316  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  30.7 
 
 		 566 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  30.32 
 
 		 625 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  28.93 
 
 		 670 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  29.92 
 
 		 605 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  31.02 
 
 		 620 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0007  DNA mismatch repair protein MutL  27.86 
 
 		 709 aa  314  2.9999999999999996e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  30.09 
 
 		 641 aa  314  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  30.85 
 
 		 566 aa  313  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  32.26 
 
 		 624 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  31.17 
 
 		 641 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  30.13 
 
 		 661 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  32.48 
 
 		 626 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  29.64 
 
 		 628 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  30.71 
 
 		 615 aa  307  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  30.86 
 
 		 621 aa  307  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  29.71 
 
 		 628 aa  307  5.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  31.79 
 
 		 624 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  30.56 
 
 		 632 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  31.45 
 
 		 630 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  29.92 
 
 		 623 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  29.78 
 
 		 632 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>