More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2380 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 695 aa  1422    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  36.66 
 
 		 665 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  36.71 
 
 		 674 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  36.86 
 
 		 674 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  35.73 
 
 		 669 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  37.12 
 
 		 639 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  34.77 
 
 		 644 aa  395  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  32.77 
 
 		 680 aa  393  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  32.92 
 
 		 692 aa  388  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  34.39 
 
 		 645 aa  385  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  35.2 
 
 		 692 aa  383  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  45.58 
 
 		 755 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  33.48 
 
 		 659 aa  369  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  32.95 
 
 		 656 aa  367  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  32.54 
 
 		 640 aa  359  7e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  32.19 
 
 		 628 aa  348  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  32.52 
 
 		 624 aa  345  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  31.71 
 
 		 644 aa  342  2e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  31.21 
 
 		 655 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0007  DNA mismatch repair protein MutL  31.21 
 
 		 709 aa  335  2e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  31.03 
 
 		 629 aa  327  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  30.97 
 
 		 652 aa  326  7e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  31.99 
 
 		 621 aa  321  3e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  31.65 
 
 		 628 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  44.28 
 
 		 614 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  30.5 
 
 		 641 aa  308  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  41.64 
 
 		 620 aa  306  8.000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  42.94 
 
 		 649 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  30.12 
 
 		 630 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  45.27 
 
 		 631 aa  303  5.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  31.08 
 
 		 630 aa  301  2e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  30.35 
 
 		 617 aa  300  5e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  44.74 
 
 		 647 aa  300  7e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  42.38 
 
 		 647 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  42.38 
 
 		 647 aa  298  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  42.38 
 
 		 647 aa  298  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  42.38 
 
 		 647 aa  298  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  44.44 
 
 		 565 aa  298  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  42.38 
 
 		 647 aa  298  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  42.38 
 
 		 647 aa  298  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  42.38 
 
 		 626 aa  297  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  42.38 
 
 		 647 aa  297  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  42.38 
 
 		 626 aa  297  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  42.42 
 
 		 619 aa  297  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0216  DNA mismatch repair protein  31.98 
 
 		 682 aa  296  8e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0851058  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  40.62 
 
 		 603 aa  296  9e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  42.06 
 
 		 644 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0884  DNA mismatch repair protein  32.29 
 
 		 673 aa  293  9e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.277202  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  39.37 
 
 		 612 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  30.1 
 
 		 605 aa  290  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  43.23 
 
 		 630 aa  289  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  43.93 
 
 		 648 aa  288  2e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  41.48 
 
 		 622 aa  287  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  46.15 
 
 		 730 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  41.03 
 
 		 632 aa  286  9e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0599  DNA mismatch repair protein MutL  31.14 
 
 		 621 aa  286  1.0000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0798741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  40.97 
 
 		 647 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  43.92 
 
 		 612 aa  278  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  40.56 
 
 		 566 aa  278  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  42.18 
 
 		 670 aa  277  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  39.49 
 
 		 606 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  39.66 
 
 		 602 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  40.3 
 
 		 605 aa  276  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  41.59 
 
 		 584 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  40 
 
 		 560 aa  275  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  41.08 
 
 		 599 aa  274  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  42.98 
 
 		 559 aa  274  5.000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  43.58 
 
 		 585 aa  273  7e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  40 
 
 		 566 aa  273  1e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2458  DNA mismatch repair protein MutL  30.31 
 
 		 711 aa  272  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.593809 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  39.94 
 
 		 650 aa  273  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  40.69 
 
 		 618 aa  272  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  40.41 
 
 		 668 aa  270  5e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  42.05 
 
 		 605 aa  268  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0376  DNA mismatch repair protein MutL  37.64 
 
 		 709 aa  268  2e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.13305  normal  0.32452 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  40.35 
 
 		 626 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  39.63 
 
 		 622 aa  268  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  41.1 
 
 		 566 aa  267  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  39.49 
 
 		 589 aa  266  7e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  41.03 
 
 		 589 aa  266  7e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  38.76 
 
 		 608 aa  266  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  40 
 
 		 608 aa  265  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  39.76 
 
 		 623 aa  265  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  43.65 
 
 		 586 aa  265  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  40.33 
 
 		 572 aa  264  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0949  DNA mismatch repair protein MutL  41.67 
 
 		 611 aa  263  6e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  37.75 
 
 		 608 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  39.09 
 
 		 635 aa  263  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  42.42 
 
 		 615 aa  262  1e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  39.29 
 
 		 626 aa  261  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  38.28 
 
 		 685 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  39.39 
 
 		 644 aa  262  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  38.86 
 
 		 633 aa  260  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  38.67 
 
 		 629 aa  260  6e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0323  DNA mismatch repair protein MutL  41.64 
 
 		 652 aa  259  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  37.33 
 
 		 648 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  39.09 
 
 		 641 aa  259  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  38.86 
 
 		 633 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  38.02 
 
 		 615 aa  258  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  40.18 
 
 		 630 aa  258  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>