More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1838 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 692 aa  1423    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  32.92 
 
 		 695 aa  388  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  34.78 
 
 		 628 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  34.88 
 
 		 623 aa  385  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  34.88 
 
 		 623 aa  385  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  34.18 
 
 		 641 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  35.08 
 
 		 629 aa  369  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  34.54 
 
 		 612 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  31.56 
 
 		 665 aa  365  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  30.98 
 
 		 644 aa  365  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  34.2 
 
 		 617 aa  365  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  31.84 
 
 		 669 aa  355  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  32.85 
 
 		 630 aa  353  4e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  34.01 
 
 		 628 aa  353  7e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  31.22 
 
 		 645 aa  350  6e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  30.88 
 
 		 692 aa  345  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  31.47 
 
 		 644 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  33.04 
 
 		 705 aa  343  5e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  33.1 
 
 		 648 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  32.51 
 
 		 647 aa  342  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  32.46 
 
 		 685 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  32.15 
 
 		 644 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  31.94 
 
 		 622 aa  337  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  32.52 
 
 		 661 aa  336  9e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  30.99 
 
 		 629 aa  335  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  31.21 
 
 		 647 aa  332  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2458  DNA mismatch repair protein MutL  34.58 
 
 		 711 aa  331  3e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.593809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  33.01 
 
 		 671 aa  331  3e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  32.99 
 
 		 608 aa  330  6e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  31.88 
 
 		 687 aa  330  6e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  31.84 
 
 		 649 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  29.81 
 
 		 680 aa  329  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  32.8 
 
 		 620 aa  324  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1289  DNA mismatch repair protein MutL  31.47 
 
 		 765 aa  318  3e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  29.7 
 
 		 621 aa  317  4e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  31.07 
 
 		 647 aa  316  8e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  31.11 
 
 		 630 aa  313  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  31.99 
 
 		 637 aa  310  6.999999999999999e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3464  DNA mismatch repair protein MutL  31.6 
 
 		 692 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  29.3 
 
 		 668 aa  308  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  45.19 
 
 		 623 aa  296  8e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  47.08 
 
 		 644 aa  294  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  47.2 
 
 		 625 aa  292  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  43.48 
 
 		 633 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  28.3 
 
 		 648 aa  291  3e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  47.59 
 
 		 635 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  43.21 
 
 		 633 aa  290  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0216  DNA mismatch repair protein  30.39 
 
 		 682 aa  288  2e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0851058  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  44.72 
 
 		 616 aa  288  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0609  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  31.21 
 
 		 652 aa  288  2e-76  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0884  DNA mismatch repair protein  29.6 
 
 		 673 aa  288  2e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.277202  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  43.73 
 
 		 755 aa  286  8e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  28.9 
 
 		 659 aa  286  1.0000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  46.39 
 
 		 641 aa  285  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  44.9 
 
 		 632 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  45.19 
 
 		 632 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  46.06 
 
 		 645 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  40.68 
 
 		 674 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  45.89 
 
 		 611 aa  283  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  44.9 
 
 		 633 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  44.54 
 
 		 648 aa  283  9e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  40.68 
 
 		 674 aa  283  9e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  41.95 
 
 		 647 aa  282  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  45.65 
 
 		 634 aa  282  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  46.93 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  41.37 
 
 		 613 aa  280  4e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  44.85 
 
 		 632 aa  280  7e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  44.81 
 
 		 650 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  31.26 
 
 		 632 aa  278  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  39.23 
 
 		 611 aa  277  4e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  45.09 
 
 		 730 aa  277  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  41.85 
 
 		 623 aa  276  7e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  45.34 
 
 		 621 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  45.34 
 
 		 619 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  43.79 
 
 		 607 aa  273  6e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  38.42 
 
 		 606 aa  273  7e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  43.79 
 
 		 607 aa  273  9e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  43.69 
 
 		 631 aa  273  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2752  DNA mismatch repair protein MutL  42.37 
 
 		 576 aa  272  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  43.48 
 
 		 608 aa  273  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2625  DNA mismatch repair protein MutL  42.37 
 
 		 576 aa  272  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  42.5 
 
 		 628 aa  271  2e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  40.65 
 
 		 639 aa  272  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  43.44 
 
 		 661 aa  269  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  42.28 
 
 		 640 aa  269  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  42.99 
 
 		 575 aa  269  1e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  44.07 
 
 		 620 aa  269  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  43.1 
 
 		 608 aa  269  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0629  DNA mismatch repair protein MutL  43.81 
 
 		 767 aa  268  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  38.78 
 
 		 617 aa  268  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  43.83 
 
 		 626 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  37.14 
 
 		 628 aa  268  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  43.75 
 
 		 661 aa  267  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  42.77 
 
 		 574 aa  267  4e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  43.12 
 
 		 667 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  43.12 
 
 		 667 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  43.12 
 
 		 667 aa  267  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  45.29 
 
 		 605 aa  266  8e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  43.44 
 
 		 661 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  43.48 
 
 		 605 aa  266  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>