More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2096 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  59.66 
 
 
647 aa  783    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  58.93 
 
 
649 aa  786    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  60.5 
 
 
626 aa  786    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  59.66 
 
 
647 aa  782    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  59.66 
 
 
647 aa  782    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  47.71 
 
 
669 aa  642    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  60.09 
 
 
644 aa  783    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  59.51 
 
 
647 aa  781    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  60.5 
 
 
626 aa  786    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  59.27 
 
 
647 aa  783    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  72.91 
 
 
619 aa  919    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
630 aa  1290    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  59.66 
 
 
647 aa  782    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  59.2 
 
 
647 aa  781    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  48.23 
 
 
645 aa  631  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  45.74 
 
 
668 aa  575  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  43.59 
 
 
659 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  43.35 
 
 
648 aa  549  1e-155  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  44.89 
 
 
647 aa  550  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  43.62 
 
 
656 aa  537  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  40.39 
 
 
639 aa  432  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  39.41 
 
 
630 aa  424  1e-117  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  37.75 
 
 
644 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  36.81 
 
 
680 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  40.72 
 
 
620 aa  409  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  38.54 
 
 
640 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  39.28 
 
 
585 aa  403  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  38.35 
 
 
603 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  39.46 
 
 
612 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  35.78 
 
 
665 aa  395  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  37.26 
 
 
647 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  39.2 
 
 
622 aa  394  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  38.55 
 
 
612 aa  391  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  34.62 
 
 
674 aa  392  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  34.18 
 
 
674 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  37.58 
 
 
628 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  35.97 
 
 
614 aa  382  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  37.99 
 
 
605 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  37.6 
 
 
605 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  36.17 
 
 
632 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  36.09 
 
 
586 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  37.44 
 
 
631 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  37.54 
 
 
605 aa  362  9e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  35.77 
 
 
566 aa  361  2e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  36.45 
 
 
603 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  34.77 
 
 
584 aa  358  1.9999999999999998e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  36.72 
 
 
606 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  36.6 
 
 
588 aa  352  2e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  36.25 
 
 
559 aa  351  3e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  34.53 
 
 
599 aa  350  3e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  35.77 
 
 
622 aa  350  5e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  34.66 
 
 
644 aa  348  2e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  34.11 
 
 
626 aa  347  3e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  32.86 
 
 
589 aa  347  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  33.63 
 
 
647 aa  347  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  34.79 
 
 
624 aa  342  9e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  35.52 
 
 
661 aa  342  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  35.65 
 
 
687 aa  341  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  34.22 
 
 
626 aa  340  4e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  36.3 
 
 
670 aa  340  4e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  36.45 
 
 
601 aa  340  5e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  34.69 
 
 
647 aa  339  8e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  35.61 
 
 
635 aa  339  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  34.65 
 
 
602 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  35.21 
 
 
636 aa  337  5.999999999999999e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  33.91 
 
 
608 aa  335  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  34.76 
 
 
622 aa  335  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  35.08 
 
 
671 aa  334  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  36.32 
 
 
607 aa  334  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  34.05 
 
 
652 aa  334  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  35.82 
 
 
607 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  37.58 
 
 
643 aa  333  6e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  37.14 
 
 
648 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  34.01 
 
 
629 aa  332  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  36.46 
 
 
597 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  36.42 
 
 
644 aa  331  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  35.95 
 
 
597 aa  329  8e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  36.12 
 
 
611 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  35.77 
 
 
602 aa  329  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  33.64 
 
 
629 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  31.11 
 
 
692 aa  328  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  37.75 
 
 
625 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  34.97 
 
 
608 aa  328  3e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0215  DNA mismatch repair protein MutL  32.82 
 
 
608 aa  327  3e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.137951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  33.79 
 
 
641 aa  326  9e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  34.37 
 
 
600 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  34.77 
 
 
655 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  36.35 
 
 
621 aa  325  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  35.71 
 
 
632 aa  325  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  33.49 
 
 
624 aa  325  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  35.53 
 
 
605 aa  325  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  32.56 
 
 
621 aa  324  3e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  35.87 
 
 
612 aa  324  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  35.42 
 
 
582 aa  323  6e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  34.5 
 
 
616 aa  323  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  33.39 
 
 
610 aa  323  8e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  34.78 
 
 
600 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  34.95 
 
 
623 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  35.4 
 
 
620 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  35.39 
 
 
628 aa  321  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>