More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0800 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
586 aa  1202    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  39.87 
 
 
605 aa  421  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  39.7 
 
 
605 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  39.64 
 
 
612 aa  416  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  38.25 
 
 
631 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  39.04 
 
 
566 aa  401  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  38.91 
 
 
566 aa  401  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  38.7 
 
 
566 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  34.57 
 
 
645 aa  379  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  36.25 
 
 
619 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  36.07 
 
 
603 aa  377  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  34.78 
 
 
626 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  34.9 
 
 
644 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  34.78 
 
 
626 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  36.44 
 
 
620 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  36.14 
 
 
644 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  36.75 
 
 
600 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  34.53 
 
 
647 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  34.94 
 
 
649 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  34.37 
 
 
647 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  33.9 
 
 
647 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  37.23 
 
 
565 aa  369  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  36.03 
 
 
605 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  36.54 
 
 
602 aa  369  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  36.92 
 
 
600 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  33.49 
 
 
632 aa  362  7.0000000000000005e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  35.57 
 
 
607 aa  362  9e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  34.79 
 
 
656 aa  362  1e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  33.67 
 
 
589 aa  360  4e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  34.78 
 
 
623 aa  359  7e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  34.78 
 
 
623 aa  359  7e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  34.45 
 
 
628 aa  359  8e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  35.67 
 
 
626 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  33.99 
 
 
614 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  35.34 
 
 
608 aa  357  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  35.34 
 
 
647 aa  356  5.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  32.1 
 
 
668 aa  354  2e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  35.26 
 
 
617 aa  354  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  34.38 
 
 
640 aa  353  5e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  34.75 
 
 
630 aa  353  5e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  35.7 
 
 
608 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  36.47 
 
 
559 aa  353  7e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  35.17 
 
 
607 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  34.34 
 
 
659 aa  352  1e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  35.53 
 
 
603 aa  352  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  33.49 
 
 
647 aa  352  1e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  36.09 
 
 
630 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  37.2 
 
 
557 aa  351  2e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  35.73 
 
 
620 aa  350  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  36.8 
 
 
560 aa  350  4e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  36.46 
 
 
572 aa  350  6e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  34.8 
 
 
629 aa  347  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  34.52 
 
 
584 aa  347  4e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  34.35 
 
 
644 aa  346  6e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  35.87 
 
 
612 aa  345  8.999999999999999e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  35.83 
 
 
611 aa  345  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  34.62 
 
 
622 aa  345  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  34.64 
 
 
606 aa  345  2e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  34.91 
 
 
648 aa  344  2e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  35.33 
 
 
611 aa  343  7e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  35.57 
 
 
585 aa  342  8e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  34.96 
 
 
630 aa  342  8e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  35.45 
 
 
626 aa  342  1e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  35.09 
 
 
603 aa  341  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  34.02 
 
 
643 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  34.98 
 
 
597 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  35.4 
 
 
624 aa  339  7e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  34.21 
 
 
643 aa  339  8e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  35.23 
 
 
610 aa  339  8e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 
626 aa  339  9.999999999999999e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  33.71 
 
 
612 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  33.77 
 
 
601 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  33.55 
 
 
618 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  33.66 
 
 
605 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  32.81 
 
 
644 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  34.75 
 
 
599 aa  337  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  35.69 
 
 
575 aa  336  7e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  35.69 
 
 
574 aa  335  1e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  36.36 
 
 
588 aa  335  1e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  33.88 
 
 
621 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  31.64 
 
 
647 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  34.45 
 
 
611 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  33.78 
 
 
597 aa  333  6e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  33.75 
 
 
633 aa  333  6e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 
616 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  34.15 
 
 
623 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  33.55 
 
 
632 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  33.6 
 
 
633 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  33.5 
 
 
599 aa  332  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  32.84 
 
 
594 aa  331  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  30.92 
 
 
602 aa  330  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  32.18 
 
 
606 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  34.53 
 
 
616 aa  329  8e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  34.49 
 
 
595 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  36.61 
 
 
582 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  33.97 
 
 
635 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  33.88 
 
 
621 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  34.19 
 
 
633 aa  328  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  33.39 
 
 
632 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  33.99 
 
 
603 aa  327  3e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>