More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0172 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
624 aa  1289    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  73.25 
 
 
626 aa  937    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  67.77 
 
 
626 aa  874    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  66.1 
 
 
644 aa  869    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  64.29 
 
 
622 aa  842    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  64.33 
 
 
624 aa  820    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  71.83 
 
 
629 aa  910    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  42.65 
 
 
608 aa  514  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  40.95 
 
 
610 aa  483  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  39.03 
 
 
623 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  38.03 
 
 
630 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  37.17 
 
 
628 aa  425  1e-117  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  35.82 
 
 
629 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  34.06 
 
 
685 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  37.24 
 
 
617 aa  407  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0211  DNA mismatch repair protein MutL  33.96 
 
 
644 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  35.44 
 
 
606 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  34.87 
 
 
628 aa  365  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  34.61 
 
 
632 aa  364  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  35.29 
 
 
639 aa  364  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  35.51 
 
 
622 aa  362  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 
644 aa  360  4e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  34.37 
 
 
625 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  34.79 
 
 
647 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  35.45 
 
 
605 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  34.24 
 
 
602 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  34.45 
 
 
615 aa  356  5.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  32.87 
 
 
602 aa  350  5e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  34.94 
 
 
628 aa  350  6e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2145  DNA mismatch repair protein MutL  33.65 
 
 
612 aa  348  2e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000372508  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  33.86 
 
 
621 aa  346  7e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  33.48 
 
 
647 aa  345  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  32.52 
 
 
695 aa  345  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  33.7 
 
 
619 aa  344  2e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  32.61 
 
 
652 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  32.33 
 
 
608 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  33.44 
 
 
605 aa  340  4e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  32.97 
 
 
611 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  35.4 
 
 
586 aa  339  8e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  33.65 
 
 
603 aa  339  9e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  33.81 
 
 
623 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  34.53 
 
 
620 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  33.97 
 
 
612 aa  335  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  31.83 
 
 
691 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  32.98 
 
 
641 aa  333  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  32.33 
 
 
647 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  34.44 
 
 
614 aa  332  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  33.44 
 
 
605 aa  332  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  31.98 
 
 
623 aa  331  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  32.31 
 
 
628 aa  332  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  31.98 
 
 
623 aa  331  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  33.18 
 
 
644 aa  331  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  33.13 
 
 
645 aa  331  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  32.86 
 
 
585 aa  331  3e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  32.4 
 
 
644 aa  331  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  32.29 
 
 
630 aa  330  4e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  32.81 
 
 
616 aa  330  4e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  33.59 
 
 
631 aa  330  6e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  31.98 
 
 
626 aa  330  7e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  32.75 
 
 
565 aa  329  7e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  32.83 
 
 
649 aa  330  7e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  32.42 
 
 
647 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  32.41 
 
 
626 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  32.67 
 
 
647 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  32.41 
 
 
626 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  33.6 
 
 
595 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  33.13 
 
 
640 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  33.6 
 
 
595 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  32.32 
 
 
647 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  31.07 
 
 
635 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  31.19 
 
 
655 aa  328  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  32.72 
 
 
647 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  32.02 
 
 
647 aa  327  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  31.7 
 
 
647 aa  327  6e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  33.87 
 
 
619 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  32.92 
 
 
637 aa  325  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  34.79 
 
 
630 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  31.59 
 
 
687 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  31.6 
 
 
636 aa  324  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  32.47 
 
 
659 aa  324  3e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  32.97 
 
 
618 aa  324  4e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  31.83 
 
 
632 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  32.47 
 
 
635 aa  323  7e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  32.14 
 
 
632 aa  323  8e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  32.75 
 
 
575 aa  323  8e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  32.67 
 
 
648 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  32.72 
 
 
656 aa  322  9.999999999999999e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  31.21 
 
 
648 aa  322  9.999999999999999e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  31.72 
 
 
629 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  31.83 
 
 
633 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  31.4 
 
 
643 aa  322  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  32.3 
 
 
626 aa  321  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  31.8 
 
 
633 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  31.56 
 
 
618 aa  320  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  31.11 
 
 
597 aa  320  7e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  32.59 
 
 
574 aa  320  7e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  31.02 
 
 
606 aa  319  9e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  30.84 
 
 
684 aa  319  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  30.84 
 
 
684 aa  319  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  30.84 
 
 
684 aa  319  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>