More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2962 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  56.31 
 
 		 606 aa  671    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  62.25 
 
 		 589 aa  707    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  55.23 
 
 		 622 aa  648    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  52.74 
 
 		 647 aa  657    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  55.81 
 
 		 602 aa  660    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 608 aa  1225    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  50.68 
 
 		 650 aa  632  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  45.5 
 
 		 628 aa  524  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  41.52 
 
 		 605 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  41.71 
 
 		 607 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  42.43 
 
 		 608 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  41.19 
 
 		 607 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  41.48 
 
 		 601 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  39.36 
 
 		 625 aa  429  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  38.57 
 
 		 632 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  39.52 
 
 		 634 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  39.58 
 
 		 602 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  38.5 
 
 		 670 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  40.46 
 
 		 606 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  38.45 
 
 		 621 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  36.59 
 
 		 647 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  39.77 
 
 		 644 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  37.32 
 
 		 623 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  37.56 
 
 		 613 aa  395  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  37.83 
 
 		 603 aa  394  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  36.78 
 
 		 630 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  37.46 
 
 		 611 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  37.82 
 
 		 633 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  38.38 
 
 		 636 aa  386  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  38.09 
 
 		 632 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  37.02 
 
 		 641 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  40.03 
 
 		 616 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  37.99 
 
 		 615 aa  385  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  38.52 
 
 		 611 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  39.71 
 
 		 632 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  38.09 
 
 		 633 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  36.59 
 
 		 633 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  37.5 
 
 		 633 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  38.47 
 
 		 632 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  38.51 
 
 		 600 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  36.75 
 
 		 645 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  36.72 
 
 		 648 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  35.46 
 
 		 641 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  37.75 
 
 		 635 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  39.09 
 
 		 612 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  37.88 
 
 		 636 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  37.93 
 
 		 598 aa  379  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  36.69 
 
 		 644 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  37.91 
 
 		 600 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  38.07 
 
 		 629 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  36.66 
 
 		 644 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  38.74 
 
 		 621 aa  375  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  37.64 
 
 		 620 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  38.04 
 
 		 641 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  36.66 
 
 		 605 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  38.34 
 
 		 621 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  37.7 
 
 		 620 aa  365  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  38.01 
 
 		 597 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  39 
 
 		 610 aa  365  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  35.51 
 
 		 611 aa  365  1e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  36.19 
 
 		 652 aa  365  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  37.22 
 
 		 629 aa  364  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  37.6 
 
 		 643 aa  364  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  36.24 
 
 		 655 aa  365  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  34.43 
 
 		 626 aa  365  2e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  36.35 
 
 		 623 aa  364  3e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  36.35 
 
 		 623 aa  364  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  37.3 
 
 		 595 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  33.83 
 
 		 589 aa  363  7.0000000000000005e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  36.92 
 
 		 575 aa  362  8e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  36.39 
 
 		 626 aa  361  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  37.54 
 
 		 628 aa  361  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  36.48 
 
 		 574 aa  361  2e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  36.08 
 
 		 647 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  36.1 
 
 		 597 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  35.35 
 
 		 626 aa  360  5e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  36.69 
 
 		 603 aa  360  5e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  35.65 
 
 		 622 aa  358  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  36.3 
 
 		 599 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  36.33 
 
 		 603 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  32.87 
 
 		 659 aa  357  3.9999999999999996e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  37.7 
 
 		 626 aa  356  5.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  37.16 
 
 		 617 aa  356  5.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  36.53 
 
 		 648 aa  356  6.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  34.53 
 
 		 648 aa  356  6.999999999999999e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  36.94 
 
 		 635 aa  355  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  37.52 
 
 		 604 aa  355  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  35.6 
 
 		 586 aa  355  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  37.32 
 
 		 603 aa  354  2.9999999999999997e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  33.5 
 
 		 559 aa  353  4e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  36.47 
 
 		 661 aa  353  5e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  32.61 
 
 		 645 aa  353  5.9999999999999994e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  36.99 
 
 		 687 aa  352  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  35.34 
 
 		 616 aa  352  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  34 
 
 		 639 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  36.55 
 
 		 618 aa  350  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  36.44 
 
 		 660 aa  350  5e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  33.39 
 
 		 572 aa  349  7e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  37.54 
 
 		 633 aa  349  8e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  32.62 
 
 		 649 aa  349  9e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>