More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1575 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  49.93 
 
 
668 aa  687    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
648 aa  1345    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  47.66 
 
 
659 aa  608  9.999999999999999e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  47.41 
 
 
647 aa  592  1e-168  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  44.83 
 
 
656 aa  573  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  46.14 
 
 
626 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  46.14 
 
 
626 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  44.68 
 
 
647 aa  559  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  44.38 
 
 
647 aa  556  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  44.58 
 
 
647 aa  557  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  44.74 
 
 
647 aa  556  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  44.38 
 
 
647 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  44.27 
 
 
644 aa  552  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  44.73 
 
 
647 aa  555  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  44.05 
 
 
647 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  44.12 
 
 
649 aa  546  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  42.37 
 
 
645 aa  543  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  44.04 
 
 
619 aa  538  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  41.67 
 
 
669 aa  533  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  43.19 
 
 
630 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  37.71 
 
 
630 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  34.18 
 
 
674 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  36.46 
 
 
620 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  34.03 
 
 
674 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  34.55 
 
 
680 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  36.42 
 
 
639 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  34.27 
 
 
644 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  36.46 
 
 
566 aa  375  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  35.48 
 
 
631 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  35.95 
 
 
566 aa  369  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  35.57 
 
 
612 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  34.58 
 
 
640 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  33.91 
 
 
622 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  36.22 
 
 
603 aa  366  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  33.43 
 
 
665 aa  362  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  35.77 
 
 
605 aa  360  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  35.05 
 
 
605 aa  357  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  35.06 
 
 
606 aa  357  5e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  34.53 
 
 
628 aa  357  5e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  31.78 
 
 
647 aa  355  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  34.75 
 
 
614 aa  353  4e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  34.62 
 
 
622 aa  353  4e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  32.94 
 
 
692 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  34.8 
 
 
608 aa  352  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  32.31 
 
 
647 aa  350  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  34.91 
 
 
586 aa  344  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  33.54 
 
 
602 aa  343  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  32.27 
 
 
632 aa  343  5e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  34.35 
 
 
585 aa  343  5.999999999999999e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  32.24 
 
 
626 aa  343  8e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 
623 aa  340  5.9999999999999996e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 
623 aa  340  5.9999999999999996e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  33.07 
 
 
606 aa  339  9e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  33.81 
 
 
599 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  33.07 
 
 
559 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  33.64 
 
 
625 aa  337  5.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  34 
 
 
629 aa  335  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  34 
 
 
644 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  35.09 
 
 
612 aa  335  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  33.7 
 
 
645 aa  334  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  33.44 
 
 
648 aa  332  9e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  32.86 
 
 
621 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  33.49 
 
 
595 aa  332  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  33.49 
 
 
595 aa  332  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  32.61 
 
 
600 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  33.65 
 
 
635 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  31.07 
 
 
605 aa  331  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  30.55 
 
 
589 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  33.75 
 
 
611 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 
630 aa  329  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 
633 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  33.12 
 
 
632 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  32.67 
 
 
623 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  31.81 
 
 
600 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  33.54 
 
 
605 aa  326  7e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  32.92 
 
 
633 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  33.03 
 
 
687 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  32.73 
 
 
648 aa  324  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  33.18 
 
 
620 aa  324  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  32.52 
 
 
655 aa  324  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  33.75 
 
 
602 aa  324  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  31.93 
 
 
644 aa  323  5e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  32.26 
 
 
652 aa  323  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  32.34 
 
 
616 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  31.21 
 
 
624 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  33.49 
 
 
621 aa  322  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  32.67 
 
 
661 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  33.8 
 
 
619 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  32.35 
 
 
632 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  32.19 
 
 
626 aa  321  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  31.72 
 
 
607 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  33.59 
 
 
603 aa  319  9e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  32.2 
 
 
633 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  32.2 
 
 
632 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  34.76 
 
 
608 aa  318  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  31.61 
 
 
615 aa  318  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  32.14 
 
 
633 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  32.18 
 
 
630 aa  317  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  32.57 
 
 
633 aa  317  6e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  32.54 
 
 
572 aa  317  6e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>