More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1919 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 670 aa  1335    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  38.45 
 
 		 628 aa  412  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  37.91 
 
 		 622 aa  398  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  39.02 
 
 		 608 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  36.52 
 
 		 647 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  37.11 
 
 		 606 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  38.67 
 
 		 605 aa  388  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  37.81 
 
 		 632 aa  388  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  38.1 
 
 		 600 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  33.24 
 
 		 665 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  34.64 
 
 		 692 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  38.78 
 
 		 605 aa  379  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  37.65 
 
 		 623 aa  375  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  37.65 
 
 		 623 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  38.26 
 
 		 626 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  37.76 
 
 		 625 aa  372  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  37.41 
 
 		 623 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  38.94 
 
 		 628 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  36.27 
 
 		 620 aa  369  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  36.83 
 
 		 632 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  37.13 
 
 		 633 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  36.48 
 
 		 633 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  36.8 
 
 		 632 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  34.96 
 
 		 641 aa  360  6e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  36.71 
 
 		 641 aa  358  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  31.52 
 
 		 659 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  37.72 
 
 		 620 aa  358  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  35.42 
 
 		 639 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  36.42 
 
 		 648 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  36.62 
 
 		 645 aa  356  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  34.81 
 
 		 626 aa  354  2e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  36.63 
 
 		 595 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  39.18 
 
 		 648 aa  352  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  37.3 
 
 		 597 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  36.58 
 
 		 617 aa  348  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  36.82 
 
 		 635 aa  348  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  32.24 
 
 		 647 aa  346  6e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  32.29 
 
 		 647 aa  346  7e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  32.44 
 
 		 647 aa  346  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  32.29 
 
 		 647 aa  345  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  34.11 
 
 		 624 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  36.75 
 
 		 597 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  32.14 
 
 		 647 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  32.05 
 
 		 647 aa  344  2.9999999999999997e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  34.79 
 
 		 692 aa  343  5.999999999999999e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  36.48 
 
 		 661 aa  342  9e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  31.95 
 
 		 647 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  36.03 
 
 		 599 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  34.32 
 
 		 611 aa  342  1e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  31.95 
 
 		 647 aa  342  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  31.86 
 
 		 644 aa  342  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  32.01 
 
 		 680 aa  340  2.9999999999999998e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  32.75 
 
 		 644 aa  340  7e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  33.08 
 
 		 624 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  32.54 
 
 		 649 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  36.47 
 
 		 687 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  31.55 
 
 		 626 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  37.63 
 
 		 626 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  31.55 
 
 		 626 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  33.18 
 
 		 629 aa  335  1e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  37.13 
 
 		 612 aa  334  4e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  35.2 
 
 		 611 aa  333  5e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  31.73 
 
 		 674 aa  333  5e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  36.04 
 
 		 629 aa  332  9e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  32.16 
 
 		 623 aa  331  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  32.9 
 
 		 685 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  32.75 
 
 		 628 aa  330  5.0000000000000004e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  34.41 
 
 		 636 aa  330  5.0000000000000004e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  36.46 
 
 		 630 aa  330  7e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  32.5 
 
 		 668 aa  329  8e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  31.66 
 
 		 674 aa  329  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  37.5 
 
 		 628 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  31.85 
 
 		 656 aa  327  6e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  30.93 
 
 		 617 aa  326  1e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0884  DNA mismatch repair protein  31.96 
 
 		 673 aa  325  2e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.277202  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  36.66 
 
 		 603 aa  324  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  30.21 
 
 		 630 aa  324  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  36.15 
 
 		 603 aa  323  4e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  34.55 
 
 		 610 aa  323  6e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  34.58 
 
 		 602 aa  323  7e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  34.5 
 
 		 631 aa  323  7e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  28.38 
 
 		 669 aa  320  5e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  33.04 
 
 		 618 aa  318  3e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0216  DNA mismatch repair protein  31.09 
 
 		 682 aa  317  4e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0851058  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  28.93 
 
 		 645 aa  317  5e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  34.42 
 
 		 661 aa  316  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  34.67 
 
 		 662 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  29.72 
 
 		 621 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  34.03 
 
 		 661 aa  313  9e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  31.2 
 
 		 610 aa  312  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  35.24 
 
 		 641 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  34.86 
 
 		 622 aa  311  2.9999999999999997e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  34.18 
 
 		 661 aa  311  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  44.72 
 
 		 647 aa  306  9.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  34.01 
 
 		 705 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  34.41 
 
 		 684 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  34.41 
 
 		 684 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  34.41 
 
 		 684 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  34.41 
 
 		 684 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  34.41 
 
 		 684 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>