More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2701 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  71.22 
 
 		 629 aa  910    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  64.34 
 
 		 622 aa  832    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  69.75 
 
 		 626 aa  918    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  73.88 
 
 		 644 aa  973    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  65.02 
 
 		 624 aa  843    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 626 aa  1291    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  73.25 
 
 		 624 aa  937    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  42.81 
 
 		 608 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  40.35 
 
 		 610 aa  487  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  40.16 
 
 		 623 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  36.55 
 
 		 630 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  36.06 
 
 		 628 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  34.56 
 
 		 685 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  34.52 
 
 		 629 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  36 
 
 		 617 aa  401  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  34.09 
 
 		 644 aa  369  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  34.82 
 
 		 606 aa  365  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  34.01 
 
 		 628 aa  362  1e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  33.96 
 
 		 608 aa  361  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  34.32 
 
 		 661 aa  360  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  33.78 
 
 		 647 aa  360  5e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  34.05 
 
 		 691 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  34.06 
 
 		 625 aa  357  5e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  34.42 
 
 		 652 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  35.81 
 
 		 622 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  34.62 
 
 		 611 aa  354  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  35.01 
 
 		 605 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  33.75 
 
 		 639 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  33.64 
 
 		 662 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  35.55 
 
 		 602 aa  352  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  34.92 
 
 		 640 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  34.48 
 
 		 655 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  32.97 
 
 		 632 aa  352  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  31.47 
 
 		 665 aa  349  8e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  33.7 
 
 		 661 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  33.59 
 
 		 661 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  36.15 
 
 		 641 aa  348  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  34.17 
 
 		 643 aa  347  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  34.57 
 
 		 619 aa  347  3e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  33.97 
 
 		 603 aa  346  8e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  34.66 
 
 		 572 aa  346  8.999999999999999e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  33.43 
 
 		 705 aa  345  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2145  DNA mismatch repair protein MutL  33.97 
 
 		 612 aa  345  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000372508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  33.85 
 
 		 628 aa  345  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 		 602 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  34.89 
 
 		 623 aa  344  4e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  35.45 
 
 		 586 aa  342  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  32.8 
 
 		 605 aa  342  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  33.8 
 
 		 620 aa  341  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  32.4 
 
 		 633 aa  339  7e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  33.69 
 
 		 644 aa  339  8e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  32.55 
 
 		 632 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  32.21 
 
 		 615 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  34.06 
 
 		 635 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  32.28 
 
 		 616 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  32.42 
 
 		 633 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  32.09 
 
 		 632 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  34.38 
 
 		 619 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  33.75 
 
 		 633 aa  336  9e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  33.95 
 
 		 629 aa  335  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  33.39 
 
 		 623 aa  334  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  33.39 
 
 		 623 aa  334  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  34.37 
 
 		 645 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  33.49 
 
 		 628 aa  335  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  33.44 
 
 		 626 aa  335  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  33.13 
 
 		 647 aa  334  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  34.06 
 
 		 648 aa  334  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  32.88 
 
 		 649 aa  334  3e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  33.44 
 
 		 633 aa  334  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  33.7 
 
 		 622 aa  333  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  33.54 
 
 		 626 aa  333  6e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  33.54 
 
 		 626 aa  333  6e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  33.44 
 
 		 565 aa  332  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 		 647 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  32.53 
 
 		 681 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  33.44 
 
 		 647 aa  331  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  33.85 
 
 		 630 aa  332  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  33.44 
 
 		 647 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  34.24 
 
 		 585 aa  331  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  32.24 
 
 		 631 aa  331  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  32.72 
 
 		 681 aa  332  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  33.74 
 
 		 659 aa  330  4e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  33.13 
 
 		 647 aa  330  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  33.68 
 
 		 687 aa  330  6e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  33.44 
 
 		 647 aa  329  9e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  32.97 
 
 		 647 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  33.03 
 
 		 671 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  33.48 
 
 		 661 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  32.38 
 
 		 636 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  32.21 
 
 		 598 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  33.95 
 
 		 630 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  32.76 
 
 		 622 aa  327  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  32.81 
 
 		 595 aa  327  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  32.81 
 
 		 595 aa  327  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  33.38 
 
 		 648 aa  326  6e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  31.63 
 
 		 641 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  32.58 
 
 		 605 aa  326  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  32.77 
 
 		 630 aa  324  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  30.5 
 
 		 613 aa  323  4e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  34.29 
 
 		 560 aa  323  5e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>