More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1275 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  60.12 
 
 
623 aa  733    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  58.04 
 
 
632 aa  723    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  54.69 
 
 
611 aa  651    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  58.06 
 
 
645 aa  718    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  58.06 
 
 
633 aa  724    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  56.37 
 
 
641 aa  729    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  58.19 
 
 
633 aa  726    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  58.37 
 
 
648 aa  723    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  57.27 
 
 
641 aa  707    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  57.72 
 
 
633 aa  718    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  57.96 
 
 
635 aa  716    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  56.9 
 
 
630 aa  744    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
644 aa  1302    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  57.94 
 
 
632 aa  724    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  57.86 
 
 
611 aa  686    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  58.22 
 
 
633 aa  726    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  59.2 
 
 
629 aa  747    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  54.04 
 
 
625 aa  634  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  53.2 
 
 
634 aa  601  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  51.39 
 
 
636 aa  600  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  51.69 
 
 
626 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  49.85 
 
 
613 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  48.6 
 
 
616 aa  566  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  47.68 
 
 
630 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  49.22 
 
 
621 aa  553  1e-156  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  49.22 
 
 
619 aa  550  1e-155  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  48.18 
 
 
628 aa  547  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  49.47 
 
 
652 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  47.82 
 
 
655 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  47.69 
 
 
636 aa  534  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  47.3 
 
 
705 aa  531  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  47.84 
 
 
647 aa  531  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  47.85 
 
 
635 aa  531  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  46.58 
 
 
681 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  46.21 
 
 
661 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  46.26 
 
 
660 aa  525  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  48.92 
 
 
617 aa  524  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  46.52 
 
 
684 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  46.05 
 
 
661 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  46.52 
 
 
684 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  46.52 
 
 
684 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  46.52 
 
 
684 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  46.43 
 
 
681 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  46.52 
 
 
684 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  45.87 
 
 
691 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  48.92 
 
 
620 aa  521  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  45.95 
 
 
661 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  45.95 
 
 
615 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  45.37 
 
 
644 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  45.78 
 
 
688 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  45.84 
 
 
667 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  46.75 
 
 
662 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  47.14 
 
 
622 aa  513  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  45.84 
 
 
667 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  44.8 
 
 
687 aa  511  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  45.07 
 
 
667 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  44.71 
 
 
657 aa  503  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  47.97 
 
 
604 aa  503  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  45.01 
 
 
657 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  46.08 
 
 
598 aa  499  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  45.75 
 
 
635 aa  489  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  44.46 
 
 
664 aa  488  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5131  DNA mismatch repair protein MutL  44.61 
 
 
674 aa  481  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  43.35 
 
 
651 aa  472  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  44.03 
 
 
606 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  40.43 
 
 
574 aa  455  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  42.64 
 
 
632 aa  454  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  40.94 
 
 
595 aa  450  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  40.94 
 
 
595 aa  450  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  44.55 
 
 
612 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  43.16 
 
 
629 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  40 
 
 
628 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  39.73 
 
 
575 aa  442  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  41.68 
 
 
644 aa  445  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  42.57 
 
 
616 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  42.77 
 
 
621 aa  439  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  43.88 
 
 
661 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  42.09 
 
 
671 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  41.44 
 
 
602 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  42.57 
 
 
632 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  41.23 
 
 
626 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  42.11 
 
 
649 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  43.37 
 
 
687 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  41.33 
 
 
643 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  42.68 
 
 
610 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  43.48 
 
 
621 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  41.43 
 
 
623 aa  428  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  41.43 
 
 
623 aa  428  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  41.33 
 
 
648 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  42.5 
 
 
629 aa  428  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4728  DNA mismatch repair protein  44.56 
 
 
615 aa  423  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0929403  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4641  DNA mismatch repair protein  44.56 
 
 
615 aa  422  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.231193  normal  0.0766044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4412  DNA mismatch repair protein  44.56 
 
 
615 aa  423  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0194282  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  42.47 
 
 
624 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  42.81 
 
 
653 aa  425  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  40.03 
 
 
681 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3843  DNA mismatch repair protein  44.39 
 
 
615 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000795964  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  40.09 
 
 
633 aa  425  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0800065 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3823  DNA mismatch repair protein MutL  44.39 
 
 
615 aa  421  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000414583  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3240  DNA mismatch repair protein MutL  41.55 
 
 
628 aa  422  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>