More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1951 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 585 aa  1165    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  51.32 
 
 		 612 aa  595  1e-168  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  49.42 
 
 		 603 aa  543  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  46.63 
 
 		 588 aa  513  1e-144  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  45.71 
 
 		 603 aa  481  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  44.24 
 
 		 599 aa  476  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  39.17 
 
 		 619 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  36.51 
 
 		 659 aa  410  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  36.49 
 
 		 626 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  36.49 
 
 		 626 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  37.66 
 
 		 647 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  38.92 
 
 		 559 aa  396  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  35.32 
 
 		 647 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  38.34 
 
 		 639 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  40.13 
 
 		 620 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  39.28 
 
 		 630 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  41.01 
 
 		 565 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  36.28 
 
 		 656 aa  372  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  35.58 
 
 		 614 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  39.35 
 
 		 560 aa  362  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  38.93 
 
 		 605 aa  357  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  40.03 
 
 		 605 aa  355  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  37.23 
 
 		 566 aa  355  2e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  37.77 
 
 		 575 aa  354  2.9999999999999997e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  37.79 
 
 		 574 aa  353  5.9999999999999994e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  36.67 
 
 		 566 aa  352  2e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  40.22 
 
 		 622 aa  351  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  37.72 
 
 		 612 aa  351  3e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  36.49 
 
 		 566 aa  347  3e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  34.35 
 
 		 648 aa  343  5.999999999999999e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  35.57 
 
 		 586 aa  342  8e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  33.64 
 
 		 647 aa  333  4e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  36.69 
 
 		 605 aa  332  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  34.24 
 
 		 626 aa  331  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  32.86 
 
 		 624 aa  331  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  32.12 
 
 		 645 aa  331  3e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  33.64 
 
 		 644 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  36.61 
 
 		 628 aa  326  7e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  37.32 
 
 		 606 aa  323  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  36.39 
 
 		 622 aa  323  6e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  35.68 
 
 		 602 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  38.14 
 
 		 601 aa  320  5e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  37.15 
 
 		 608 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  32.66 
 
 		 589 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  37.13 
 
 		 611 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  32.65 
 
 		 572 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  34.07 
 
 		 629 aa  312  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  36.67 
 
 		 607 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  34.18 
 
 		 626 aa  311  2e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  48.66 
 
 		 692 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  35.81 
 
 		 602 aa  310  5e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  36.01 
 
 		 557 aa  309  8e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  33.06 
 
 		 610 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  44.38 
 
 		 649 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 		 623 aa  307  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  31.67 
 
 		 624 aa  307  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  35.5 
 
 		 589 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  35.66 
 
 		 625 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  36.23 
 
 		 607 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  33.56 
 
 		 584 aa  304  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  33.71 
 
 		 632 aa  303  7.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  36.59 
 
 		 626 aa  302  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  43.54 
 
 		 647 aa  301  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  43.54 
 
 		 647 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  43.54 
 
 		 647 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  43.54 
 
 		 647 aa  301  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  43.54 
 
 		 647 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  43.54 
 
 		 647 aa  301  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  43.26 
 
 		 644 aa  300  6e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  33.96 
 
 		 630 aa  299  8e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  35.74 
 
 		 628 aa  299  8e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  36.71 
 
 		 616 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  37.32 
 
 		 612 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  34.07 
 
 		 623 aa  298  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  36.39 
 
 		 632 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  30.93 
 
 		 606 aa  298  3e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  35.24 
 
 		 655 aa  296  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  36.49 
 
 		 582 aa  296  5e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  36.17 
 
 		 608 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  36.03 
 
 		 622 aa  295  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  34.81 
 
 		 611 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0034  DNA mismatch repair protein MutL  37.07 
 
 		 590 aa  293  7e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  34.65 
 
 		 615 aa  293  8e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  34.75 
 
 		 647 aa  292  9e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  34.53 
 
 		 636 aa  292  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  34.64 
 
 		 635 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  34.42 
 
 		 608 aa  292  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  32.81 
 
 		 645 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  34.69 
 
 		 636 aa  291  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  34.14 
 
 		 616 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  33.18 
 
 		 633 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  32.65 
 
 		 632 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  32.91 
 
 		 632 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  32.44 
 
 		 648 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  32.65 
 
 		 633 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  33.49 
 
 		 641 aa  287  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  38.88 
 
 		 582 aa  288  2.9999999999999996e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  36.56 
 
 		 594 aa  287  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  32.27 
 
 		 629 aa  287  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  32.5 
 
 		 635 aa  286  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>