More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4548 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  86.47 
 
 		 605 aa  1050    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 605 aa  1217    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  54.77 
 
 		 631 aa  672    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  64.78 
 
 		 612 aa  776    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  44.21 
 
 		 566 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  43.87 
 
 		 566 aa  468  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  42.93 
 
 		 566 aa  458  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  39.7 
 
 		 586 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  40.73 
 
 		 620 aa  406  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  36.03 
 
 		 559 aa  394  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  36.81 
 
 		 640 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  39.01 
 
 		 628 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  38.02 
 
 		 605 aa  384  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  40.89 
 
 		 565 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  40.85 
 
 		 620 aa  382  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  36.6 
 
 		 639 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  38.09 
 
 		 647 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  34.26 
 
 		 644 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  35.64 
 
 		 626 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  41.65 
 
 		 560 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  34.2 
 
 		 668 aa  373  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  35.64 
 
 		 626 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  37.99 
 
 		 630 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  37.87 
 
 		 603 aa  371  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  38.71 
 
 		 626 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  39.41 
 
 		 606 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  37.92 
 
 		 606 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  38.74 
 
 		 623 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  34.86 
 
 		 647 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  34.86 
 
 		 647 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  33.04 
 
 		 669 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  35.32 
 
 		 647 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  36.49 
 
 		 619 aa  369  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 		 614 aa  369  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  34.51 
 
 		 644 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  38.74 
 
 		 623 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  34.38 
 
 		 647 aa  366  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  38.11 
 
 		 632 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  34.91 
 
 		 647 aa  365  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  35.01 
 
 		 647 aa  365  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  32.36 
 
 		 606 aa  363  4e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  41.31 
 
 		 582 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  34.55 
 
 		 649 aa  362  9e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  33.38 
 
 		 645 aa  362  1e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  38.7 
 
 		 600 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  40.03 
 
 		 585 aa  361  2e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  36.76 
 
 		 584 aa  361  2e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  37.3 
 
 		 612 aa  360  3e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  38.21 
 
 		 600 aa  360  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  33.49 
 
 		 656 aa  360  5e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  35.41 
 
 		 648 aa  360  5e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  39.11 
 
 		 597 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  37.19 
 
 		 602 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  37.54 
 
 		 622 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  34.83 
 
 		 572 aa  355  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  37.94 
 
 		 612 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  39.32 
 
 		 594 aa  353  5.9999999999999994e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  39.46 
 
 		 601 aa  353  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  38 
 
 		 644 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  32.71 
 
 		 659 aa  352  8.999999999999999e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  38.31 
 
 		 602 aa  352  8.999999999999999e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  38.59 
 
 		 643 aa  352  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  37.83 
 
 		 621 aa  352  2e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  37.1 
 
 		 617 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  38.09 
 
 		 643 aa  350  4e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  38.27 
 
 		 632 aa  350  5e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  37.54 
 
 		 616 aa  350  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  38.8 
 
 		 595 aa  349  8e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  38.76 
 
 		 607 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  38.54 
 
 		 599 aa  347  3e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  37.95 
 
 		 619 aa  347  3e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  38.15 
 
 		 625 aa  346  6e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  38.35 
 
 		 599 aa  346  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  37.46 
 
 		 605 aa  345  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  32.8 
 
 		 626 aa  345  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  38.86 
 
 		 603 aa  345  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  36.78 
 
 		 557 aa  345  2e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  33.44 
 
 		 624 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  37.78 
 
 		 608 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  37.88 
 
 		 597 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  38.9 
 
 		 608 aa  343  7e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  34.23 
 
 		 611 aa  342  1e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  38.92 
 
 		 610 aa  342  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  36.91 
 
 		 603 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  38.02 
 
 		 607 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  40.49 
 
 		 603 aa  340  5.9999999999999996e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  37.44 
 
 		 687 aa  339  8e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  38.24 
 
 		 621 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  29.92 
 
 		 621 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  37.87 
 
 		 628 aa  338  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  36.68 
 
 		 623 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2869  DNA mismatch repair protein MutL  38.73 
 
 		 605 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  36.26 
 
 		 608 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  37.04 
 
 		 661 aa  337  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  37.2 
 
 		 603 aa  335  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  37.34 
 
 		 611 aa  335  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  36.09 
 
 		 603 aa  334  2e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  34.8 
 
 		 589 aa  334  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  37.05 
 
 		 611 aa  332  9e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  33.96 
 
 		 629 aa  332  1e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>