More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0554 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
565 aa  1113    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  41.34 
 
 
639 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  45.6 
 
 
560 aa  431  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  41.17 
 
 
620 aa  399  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  33.93 
 
 
614 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  37.79 
 
 
603 aa  387  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  39.08 
 
 
612 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  40.89 
 
 
605 aa  382  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  38.88 
 
 
605 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  39.4 
 
 
566 aa  381  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  39.75 
 
 
566 aa  377  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  41.01 
 
 
585 aa  376  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  38.97 
 
 
566 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  38.18 
 
 
612 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  34.43 
 
 
589 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  37.23 
 
 
586 aa  369  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  37.19 
 
 
559 aa  367  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  39.2 
 
 
608 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  39.74 
 
 
606 aa  361  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  37.48 
 
 
602 aa  361  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  34.68 
 
 
619 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  38.75 
 
 
623 aa  360  4e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  38.9 
 
 
622 aa  358  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  38.93 
 
 
622 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  38.12 
 
 
633 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  37.48 
 
 
575 aa  351  3e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  37.48 
 
 
632 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  37.48 
 
 
633 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  37.25 
 
 
588 aa  348  1e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  38.71 
 
 
641 aa  348  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  37.5 
 
 
574 aa  348  2e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  37 
 
 
632 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  37.36 
 
 
605 aa  346  6e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  32.81 
 
 
572 aa  341  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  35.26 
 
 
584 aa  341  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  39.43 
 
 
611 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  38.45 
 
 
611 aa  340  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  34.52 
 
 
647 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  36.52 
 
 
645 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  36.3 
 
 
608 aa  333  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  35.7 
 
 
630 aa  332  7.000000000000001e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  33.44 
 
 
626 aa  332  9e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  38.47 
 
 
589 aa  330  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  39.8 
 
 
601 aa  331  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  32.75 
 
 
624 aa  329  6e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  37.6 
 
 
629 aa  329  7e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  39.05 
 
 
608 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  36.94 
 
 
633 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  37.1 
 
 
633 aa  327  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  39.44 
 
 
607 aa  325  9e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  39.18 
 
 
607 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  36.71 
 
 
620 aa  325  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  37.08 
 
 
557 aa  325  2e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  35.57 
 
 
635 aa  323  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  34.65 
 
 
630 aa  323  7e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  34.56 
 
 
599 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  36.84 
 
 
603 aa  320  6e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  38.6 
 
 
606 aa  319  7e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  33.83 
 
 
603 aa  319  7e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  36.95 
 
 
602 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  44.58 
 
 
755 aa  317  3e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  37.14 
 
 
594 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0215  DNA mismatch repair protein MutL  32.47 
 
 
608 aa  317  5e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.137951 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  39.97 
 
 
632 aa  316  8e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  38.88 
 
 
582 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0034  DNA mismatch repair protein MutL  37.5 
 
 
590 aa  315  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  36.96 
 
 
625 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  39.12 
 
 
616 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1331  DNA mismatch repair protein MutL  35.93 
 
 
579 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  35.64 
 
 
600 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  30.77 
 
 
606 aa  312  1e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  39.44 
 
 
621 aa  312  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  35.83 
 
 
600 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  31.02 
 
 
610 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  38.78 
 
 
621 aa  310  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  36.81 
 
 
628 aa  310  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  37.12 
 
 
597 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  44.95 
 
 
640 aa  310  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  39.93 
 
 
612 aa  310  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  35.66 
 
 
616 aa  309  6.999999999999999e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  36.98 
 
 
603 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  36.59 
 
 
605 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  43.47 
 
 
680 aa  308  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  33.44 
 
 
608 aa  307  3e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  36.73 
 
 
643 aa  307  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  37.12 
 
 
597 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  35.52 
 
 
633 aa  307  4.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  37.42 
 
 
603 aa  306  8.000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  35.31 
 
 
613 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  37.04 
 
 
621 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  37.27 
 
 
599 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  36.51 
 
 
598 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  36.41 
 
 
595 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  36.86 
 
 
603 aa  302  9e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2869  DNA mismatch repair protein MutL  36.53 
 
 
605 aa  302  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  42.64 
 
 
665 aa  300  6e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  35.08 
 
 
644 aa  300  7e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  33.76 
 
 
623 aa  299  9e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  33.76 
 
 
623 aa  299  9e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  44.44 
 
 
695 aa  298  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>