More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0145 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  59.36 
 
 		 622 aa  793    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  69.18 
 
 		 626 aa  909    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 644 aa  1331    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  73.88 
 
 		 626 aa  973    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  66.1 
 
 		 624 aa  869    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  66.82 
 
 		 629 aa  862    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  61.33 
 
 		 624 aa  813    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  40.74 
 
 		 608 aa  502  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  40.18 
 
 		 610 aa  488  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  38.96 
 
 		 623 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  36.53 
 
 		 629 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  35.57 
 
 		 630 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  35.17 
 
 		 685 aa  426  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  36.57 
 
 		 628 aa  424  1e-117  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  35.89 
 
 		 617 aa  396  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  34.41 
 
 		 625 aa  368  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  34.97 
 
 		 628 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  33.54 
 
 		 632 aa  361  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  35.28 
 
 		 619 aa  360  6e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  33.8 
 
 		 606 aa  359  8e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  34.95 
 
 		 605 aa  357  5e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  33.74 
 
 		 643 aa  353  8e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  35.21 
 
 		 622 aa  352  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  33.43 
 
 		 602 aa  352  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  33.44 
 
 		 639 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  33.19 
 
 		 647 aa  350  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2145  DNA mismatch repair protein MutL  34.06 
 
 		 612 aa  348  1e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000372508  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  34.19 
 
 		 621 aa  348  2e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 		 647 aa  346  7e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  32.92 
 
 		 667 aa  346  8e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  32.92 
 
 		 667 aa  346  8e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  32.77 
 
 		 661 aa  346  8.999999999999999e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  33.54 
 
 		 650 aa  346  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  31.47 
 
 		 692 aa  344  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  31.7 
 
 		 611 aa  345  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  32.98 
 
 		 661 aa  343  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  33.18 
 
 		 630 aa  342  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  32.83 
 
 		 628 aa  342  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  31.71 
 
 		 695 aa  342  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  34.06 
 
 		 603 aa  342  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  32.33 
 
 		 691 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  32.73 
 
 		 652 aa  339  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  34.2 
 
 		 605 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  32.14 
 
 		 602 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  32.81 
 
 		 586 aa  337  5e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  33.03 
 
 		 623 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 		 641 aa  336  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  32.15 
 
 		 623 aa  334  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  34.82 
 
 		 628 aa  335  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  32.15 
 
 		 623 aa  334  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  33.18 
 
 		 620 aa  334  4e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  32.59 
 
 		 687 aa  333  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  34.5 
 
 		 630 aa  333  5e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  32.08 
 
 		 681 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  32.98 
 
 		 641 aa  332  9e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  32.88 
 
 		 659 aa  332  1e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  32.08 
 
 		 681 aa  332  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  31.2 
 
 		 644 aa  331  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  31.98 
 
 		 684 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  31.98 
 
 		 684 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  32.68 
 
 		 597 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  31.98 
 
 		 684 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  31.98 
 
 		 684 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  31.98 
 
 		 684 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  32.53 
 
 		 597 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  31.35 
 
 		 626 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  31.25 
 
 		 680 aa  330  7e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  32.26 
 
 		 605 aa  329  9e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  31.65 
 
 		 607 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  31.7 
 
 		 705 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  32.07 
 
 		 631 aa  329  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  32.82 
 
 		 608 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  32.21 
 
 		 633 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  30.58 
 
 		 644 aa  328  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  31.48 
 
 		 635 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  31.44 
 
 		 616 aa  327  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  33.64 
 
 		 585 aa  328  3e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  32.42 
 
 		 612 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  32.82 
 
 		 603 aa  326  8.000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  31.94 
 
 		 647 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  31.91 
 
 		 595 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  32.45 
 
 		 622 aa  325  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  31.65 
 
 		 607 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  31.84 
 
 		 661 aa  325  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  31.91 
 
 		 633 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  32.74 
 
 		 649 aa  324  4e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  32.15 
 
 		 648 aa  323  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  32.51 
 
 		 636 aa  323  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  30.97 
 
 		 629 aa  323  9.000000000000001e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  32.74 
 
 		 671 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  32.56 
 
 		 635 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  31.96 
 
 		 632 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  32.62 
 
 		 637 aa  322  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  31.85 
 
 		 632 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  31.79 
 
 		 595 aa  321  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  31.69 
 
 		 633 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  32.72 
 
 		 601 aa  321  3e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  31.79 
 
 		 595 aa  321  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  30.64 
 
 		 605 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  30.92 
 
 		 603 aa  319  9e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>