More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2145 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0211  DNA mismatch repair protein MutL  52.09 
 
 		 644 aa  684    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2145  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 612 aa  1258    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000372508  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  52.09 
 
 		 617 aa  677    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  46.99 
 
 		 623 aa  570  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  43.51 
 
 		 610 aa  519  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  41.07 
 
 		 629 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  40.71 
 
 		 630 aa  475  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  39.78 
 
 		 628 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  38.85 
 
 		 618 aa  447  1.0000000000000001e-124  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  37.58 
 
 		 608 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  50.5 
 
 		 685 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  34.06 
 
 		 644 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  32.15 
 
 		 624 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  33.65 
 
 		 629 aa  353  5e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  33.97 
 
 		 626 aa  351  2e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  33.65 
 
 		 624 aa  351  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  32.32 
 
 		 626 aa  346  8e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  32.09 
 
 		 622 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  30.2 
 
 		 647 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  30.32 
 
 		 628 aa  300  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  30.5 
 
 		 644 aa  300  6e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  29.54 
 
 		 670 aa  299  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  29.21 
 
 		 613 aa  296  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  30.05 
 
 		 647 aa  294  4e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  30.96 
 
 		 605 aa  290  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  28.92 
 
 		 659 aa  288  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  30.3 
 
 		 628 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  32.2 
 
 		 640 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  28.84 
 
 		 612 aa  283  6.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  29.52 
 
 		 656 aa  283  6.000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  30.29 
 
 		 603 aa  278  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  29.05 
 
 		 606 aa  278  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  31.16 
 
 		 619 aa  278  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  28.64 
 
 		 647 aa  277  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  28.89 
 
 		 669 aa  277  5e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  28.55 
 
 		 602 aa  276  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  28.97 
 
 		 631 aa  276  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  28.03 
 
 		 616 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  29.82 
 
 		 622 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  42.11 
 
 		 559 aa  273  5.000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  28.26 
 
 		 655 aa  273  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  31.14 
 
 		 639 aa  273  6e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  29.38 
 
 		 626 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  29.38 
 
 		 626 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  28.21 
 
 		 632 aa  272  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  29.06 
 
 		 645 aa  271  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  29.17 
 
 		 615 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  30.1 
 
 		 574 aa  271  4e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  28.94 
 
 		 649 aa  271  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  29.95 
 
 		 620 aa  271  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  27.59 
 
 		 635 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  29.71 
 
 		 605 aa  270  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  30.84 
 
 		 575 aa  270  5e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  27.55 
 
 		 636 aa  269  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  29.24 
 
 		 647 aa  269  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  28.81 
 
 		 644 aa  269  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  29.15 
 
 		 601 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  27.98 
 
 		 633 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  27.59 
 
 		 647 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  29.48 
 
 		 647 aa  267  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  28.55 
 
 		 630 aa  267  5e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  28.48 
 
 		 589 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  28.71 
 
 		 607 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  27.55 
 
 		 623 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  30.02 
 
 		 647 aa  264  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0215  DNA mismatch repair protein MutL  28.84 
 
 		 608 aa  264  4e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.137951 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  30.16 
 
 		 630 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  40.18 
 
 		 665 aa  263  6e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  27.83 
 
 		 598 aa  263  6.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  27.73 
 
 		 641 aa  263  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  28.21 
 
 		 641 aa  263  8e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  29.32 
 
 		 647 aa  263  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  27.9 
 
 		 605 aa  263  8.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  28.5 
 
 		 602 aa  262  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  28.07 
 
 		 632 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  37.43 
 
 		 692 aa  262  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  26.79 
 
 		 608 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  26.04 
 
 		 691 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  32.91 
 
 		 630 aa  261  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  27.97 
 
 		 622 aa  260  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  28.25 
 
 		 608 aa  261  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  30.61 
 
 		 603 aa  261  4e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  36.84 
 
 		 755 aa  261  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  27.68 
 
 		 645 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  27.79 
 
 		 668 aa  260  5.0000000000000005e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  28.78 
 
 		 628 aa  260  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  28.53 
 
 		 629 aa  259  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  27.97 
 
 		 633 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  27.43 
 
 		 622 aa  258  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  26.49 
 
 		 604 aa  258  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  27.37 
 
 		 635 aa  257  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  30.1 
 
 		 612 aa  257  4e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  27.33 
 
 		 632 aa  257  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  27.37 
 
 		 636 aa  256  9e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  37.31 
 
 		 650 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  27.27 
 
 		 648 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  30.2 
 
 		 626 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  28.01 
 
 		 630 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  27.13 
 
 		 648 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  28.57 
 
 		 611 aa  254  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>