More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0267 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 622 aa  1285    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  65.88 
 
 		 624 aa  847    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  70.4 
 
 		 624 aa  897    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  63.22 
 
 		 626 aa  808    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  59.6 
 
 		 644 aa  799    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  64.61 
 
 		 626 aa  828    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  66.03 
 
 		 629 aa  842    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  42.65 
 
 		 608 aa  510  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  38.66 
 
 		 610 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  38.57 
 
 		 623 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  38.05 
 
 		 630 aa  429  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  35.57 
 
 		 629 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  36.41 
 
 		 628 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  33.92 
 
 		 685 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  35.9 
 
 		 617 aa  396  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  34.67 
 
 		 559 aa  355  2e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  34.19 
 
 		 606 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  34.18 
 
 		 625 aa  347  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  34.45 
 
 		 640 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  33.49 
 
 		 630 aa  344  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  34.11 
 
 		 629 aa  344  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  34.1 
 
 		 632 aa  341  2.9999999999999998e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  34.36 
 
 		 628 aa  339  7e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  32.86 
 
 		 622 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  33.02 
 
 		 644 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  34.07 
 
 		 621 aa  337  5e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  34.13 
 
 		 572 aa  337  5e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  32.3 
 
 		 639 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  33.02 
 
 		 605 aa  335  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  34.49 
 
 		 619 aa  335  2e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  32.65 
 
 		 615 aa  333  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  32.97 
 
 		 643 aa  333  4e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  32.8 
 
 		 603 aa  333  5e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  33.07 
 
 		 602 aa  333  5e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  31.99 
 
 		 665 aa  332  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  33.79 
 
 		 641 aa  331  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  32.57 
 
 		 647 aa  330  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  33.01 
 
 		 622 aa  330  5.0000000000000004e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  34.29 
 
 		 649 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  32.18 
 
 		 647 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  31.23 
 
 		 661 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  32.65 
 
 		 602 aa  328  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  32.75 
 
 		 608 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  31.76 
 
 		 623 aa  327  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  32.77 
 
 		 644 aa  327  5e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  31.54 
 
 		 606 aa  325  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2145  DNA mismatch repair protein MutL  32.58 
 
 		 612 aa  325  1e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000372508  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  32.2 
 
 		 628 aa  324  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 		 614 aa  325  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  32.65 
 
 		 595 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  33.02 
 
 		 626 aa  324  3e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  34.44 
 
 		 630 aa  324  3e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  31.65 
 
 		 616 aa  324  3e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  31.27 
 
 		 705 aa  324  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  32.15 
 
 		 647 aa  323  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  34.38 
 
 		 630 aa  324  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  31.1 
 
 		 622 aa  323  8e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  32.33 
 
 		 597 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  32.56 
 
 		 652 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  32.26 
 
 		 662 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  33.12 
 
 		 633 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  32.12 
 
 		 636 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  32.97 
 
 		 597 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  32.37 
 
 		 647 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  32.67 
 
 		 647 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  32.97 
 
 		 632 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  32.92 
 
 		 605 aa  320  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  31.76 
 
 		 623 aa  320  6e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  31.76 
 
 		 623 aa  320  6e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  31.76 
 
 		 635 aa  320  7e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  32.97 
 
 		 633 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  32.77 
 
 		 647 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  31.66 
 
 		 626 aa  319  7.999999999999999e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  32.81 
 
 		 633 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  32.55 
 
 		 645 aa  319  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  32.45 
 
 		 605 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  32.37 
 
 		 647 aa  319  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  32.65 
 
 		 632 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  32.24 
 
 		 620 aa  318  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  31.21 
 
 		 655 aa  317  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  32.5 
 
 		 670 aa  317  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  33.49 
 
 		 619 aa  317  6e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  32.92 
 
 		 628 aa  316  9e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  32.45 
 
 		 648 aa  316  9e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  32.04 
 
 		 635 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  31.11 
 
 		 611 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  31.85 
 
 		 607 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  32.45 
 
 		 633 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  32.71 
 
 		 621 aa  313  4.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  33.01 
 
 		 586 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  32.7 
 
 		 605 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  32.17 
 
 		 607 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  29.86 
 
 		 613 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  32.54 
 
 		 589 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  31.49 
 
 		 620 aa  309  9e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  32.76 
 
 		 599 aa  309  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  31.9 
 
 		 612 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  32.06 
 
 		 617 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  32.32 
 
 		 595 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  32.08 
 
 		 612 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>