More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1696 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
665 aa  1360    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  61.41 
 
 
755 aa  486  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  38.27 
 
 
680 aa  464  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  36.66 
 
 
695 aa  464  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  36.93 
 
 
640 aa  438  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  37.3 
 
 
674 aa  425  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  36.75 
 
 
620 aa  422  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  36.93 
 
 
674 aa  422  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  38.39 
 
 
649 aa  413  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  36.92 
 
 
644 aa  411  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  37.2 
 
 
644 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  37.16 
 
 
619 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  38.44 
 
 
647 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  36.78 
 
 
647 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  36.09 
 
 
639 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  37.54 
 
 
647 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  37.28 
 
 
647 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  37.54 
 
 
647 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  38.02 
 
 
626 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  37.35 
 
 
647 aa  405  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  38.02 
 
 
626 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  37.43 
 
 
647 aa  405  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  36.3 
 
 
656 aa  403  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  35.38 
 
 
692 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  33.29 
 
 
730 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  36.48 
 
 
668 aa  397  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  35.51 
 
 
659 aa  389  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  35.59 
 
 
605 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  34.87 
 
 
669 aa  385  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  34.38 
 
 
622 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 
647 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  36.54 
 
 
603 aa  382  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  35.71 
 
 
630 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  35.57 
 
 
621 aa  378  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  33.14 
 
 
670 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  34.28 
 
 
606 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  35.04 
 
 
606 aa  370  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  31.56 
 
 
692 aa  365  1e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  33.43 
 
 
648 aa  362  2e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  32.3 
 
 
628 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  32.68 
 
 
629 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  31.78 
 
 
655 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  32.29 
 
 
645 aa  352  1e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  32.46 
 
 
630 aa  351  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  31.77 
 
 
625 aa  351  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  31.47 
 
 
626 aa  349  8e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  32.08 
 
 
635 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  32.04 
 
 
647 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4225  DNA mismatch repair protein MutL  31.86 
 
 
687 aa  345  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.724774  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  30.45 
 
 
652 aa  344  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  32.29 
 
 
661 aa  344  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 
612 aa  344  4e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  32.24 
 
 
629 aa  343  7e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  31.47 
 
 
685 aa  343  8e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 
630 aa  341  2e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  31 
 
 
644 aa  335  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  31.29 
 
 
626 aa  332  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  30.98 
 
 
648 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  32.88 
 
 
628 aa  332  2e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  32.83 
 
 
616 aa  332  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  31.84 
 
 
628 aa  330  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  31.39 
 
 
657 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  31.6 
 
 
681 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  31.21 
 
 
600 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  31.36 
 
 
705 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  31.45 
 
 
681 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  32.19 
 
 
647 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  32.08 
 
 
582 aa  328  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  31.36 
 
 
684 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  31.36 
 
 
684 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  31.36 
 
 
684 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  31.36 
 
 
684 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  31.36 
 
 
684 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  31.02 
 
 
623 aa  326  8.000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  30.84 
 
 
671 aa  325  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  31.27 
 
 
605 aa  325  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  31.31 
 
 
687 aa  324  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  32.48 
 
 
597 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  32.29 
 
 
617 aa  322  9.999999999999999e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  31.63 
 
 
637 aa  322  9.999999999999999e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  31.42 
 
 
661 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  31.89 
 
 
611 aa  318  2e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  30.24 
 
 
644 aa  317  6e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  31.98 
 
 
630 aa  315  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  30.81 
 
 
647 aa  311  2e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0884  DNA mismatch repair protein  33 
 
 
673 aa  308  3e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.277202  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  30.04 
 
 
610 aa  308  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  46.67 
 
 
631 aa  303  6.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0949  DNA mismatch repair protein MutL  31.16 
 
 
611 aa  301  2e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0599  DNA mismatch repair protein MutL  33.53 
 
 
621 aa  301  3e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0798741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  42.64 
 
 
565 aa  300  7e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  46.01 
 
 
614 aa  299  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  44.85 
 
 
589 aa  295  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  44.24 
 
 
615 aa  291  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  30.26 
 
 
618 aa  290  5.0000000000000004e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  41.57 
 
 
605 aa  288  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  41.24 
 
 
650 aa  286  9e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0609  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  30.74 
 
 
652 aa  286  1.0000000000000001e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  31.68 
 
 
574 aa  283  1e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  43.43 
 
 
559 aa  282  1e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>