More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0949 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0949  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
611 aa  1201    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  33.6 
 
 
614 aa  323  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  31.19 
 
 
665 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  32.09 
 
 
644 aa  303  8.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  31.54 
 
 
639 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  29.34 
 
 
620 aa  291  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  31.87 
 
 
656 aa  291  3e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  29.6 
 
 
640 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  30.24 
 
 
605 aa  287  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  27.16 
 
 
612 aa  286  8e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  29.95 
 
 
600 aa  280  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  30.37 
 
 
623 aa  279  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  30.37 
 
 
623 aa  279  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  30.93 
 
 
674 aa  279  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  26.86 
 
 
631 aa  277  4e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  30.62 
 
 
610 aa  276  6e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  29.66 
 
 
589 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  30.81 
 
 
674 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  30 
 
 
600 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  28.11 
 
 
637 aa  273  8.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  28.92 
 
 
668 aa  273  8.000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  29.31 
 
 
620 aa  273  9e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  29.7 
 
 
603 aa  272  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  29.16 
 
 
605 aa  272  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  28.59 
 
 
586 aa  271  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  32.72 
 
 
628 aa  271  2e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  28.14 
 
 
605 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  29.83 
 
 
626 aa  270  4e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  28.22 
 
 
608 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  28 
 
 
617 aa  270  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  30.19 
 
 
626 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  30.19 
 
 
626 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  27.46 
 
 
628 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  28.39 
 
 
618 aa  268  2.9999999999999995e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  29.19 
 
 
644 aa  267  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  33.6 
 
 
572 aa  266  7e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  30.61 
 
 
611 aa  265  2e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  29.03 
 
 
566 aa  264  4e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  41.67 
 
 
695 aa  264  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  29.47 
 
 
647 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  25.74 
 
 
632 aa  263  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  29.47 
 
 
647 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  27.76 
 
 
628 aa  263  8.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  29.77 
 
 
647 aa  262  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  27.08 
 
 
612 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  27.63 
 
 
582 aa  262  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  28.73 
 
 
566 aa  261  2e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  29.77 
 
 
647 aa  262  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  29.31 
 
 
647 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  27.96 
 
 
605 aa  261  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  26.97 
 
 
602 aa  261  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  28.46 
 
 
626 aa  261  3e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  27.78 
 
 
629 aa  261  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  29.47 
 
 
647 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  26.77 
 
 
611 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  29.47 
 
 
647 aa  260  6e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  28.98 
 
 
649 aa  259  8e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  28.41 
 
 
599 aa  259  9e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  28.96 
 
 
566 aa  259  1e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  27.32 
 
 
616 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  25.95 
 
 
625 aa  259  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  29.73 
 
 
630 aa  259  1e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  27.8 
 
 
647 aa  259  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  27.65 
 
 
606 aa  257  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  29.5 
 
 
692 aa  257  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  26.88 
 
 
632 aa  257  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  26.99 
 
 
647 aa  256  8e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  29.31 
 
 
617 aa  254  2.0000000000000002e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  28.55 
 
 
644 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  28.07 
 
 
644 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  27.8 
 
 
608 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  29.03 
 
 
645 aa  254  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0086  DNA mismatch repair protein MutL  28.73 
 
 
633 aa  254  3e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.243153  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  29.25 
 
 
626 aa  254  3e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  27.56 
 
 
606 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  29.11 
 
 
624 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  41.35 
 
 
755 aa  254  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  29.22 
 
 
615 aa  253  5.000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2869  DNA mismatch repair protein MutL  26.04 
 
 
605 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  30.57 
 
 
584 aa  253  6e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  27.61 
 
 
560 aa  253  8.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  27.3 
 
 
630 aa  253  8.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  27.88 
 
 
611 aa  253  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  27.05 
 
 
622 aa  253  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  28.14 
 
 
624 aa  252  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  27.06 
 
 
648 aa  252  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  25.72 
 
 
623 aa  251  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  26.41 
 
 
633 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  26.18 
 
 
641 aa  249  8e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  29.95 
 
 
669 aa  249  8e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  26.57 
 
 
632 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  26.72 
 
 
629 aa  249  9e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0884  DNA mismatch repair protein  29.81 
 
 
673 aa  249  1e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.277202  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  28.1 
 
 
648 aa  249  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  26.48 
 
 
632 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  25.68 
 
 
622 aa  248  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  27.56 
 
 
630 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  27.87 
 
 
623 aa  248  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  27.84 
 
 
602 aa  247  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  27.94 
 
 
589 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>