More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0412 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 618 aa  1266    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  40.54 
 
 		 617 aa  487  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  39.71 
 
 		 623 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0211  DNA mismatch repair protein MutL  38.18 
 
 		 644 aa  464  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  39.59 
 
 		 629 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  39.13 
 
 		 610 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2145  DNA mismatch repair protein MutL  38.44 
 
 		 612 aa  446  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000372508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  38.21 
 
 		 630 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  38.65 
 
 		 628 aa  425  1e-117  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  53.53 
 
 		 685 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  37.46 
 
 		 608 aa  393  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  35.71 
 
 		 628 aa  334  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  32.97 
 
 		 624 aa  324  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  31.62 
 
 		 644 aa  321  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  33.55 
 
 		 626 aa  321  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  32.22 
 
 		 624 aa  316  8e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  32.31 
 
 		 644 aa  316  9.999999999999999e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  32.94 
 
 		 670 aa  316  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  31.34 
 
 		 629 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  32.47 
 
 		 626 aa  313  4.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  34.2 
 
 		 652 aa  313  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  32.85 
 
 		 622 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  32.46 
 
 		 631 aa  309  9e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  33.01 
 
 		 608 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  32.52 
 
 		 589 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  32.64 
 
 		 607 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  32.37 
 
 		 603 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  29.56 
 
 		 647 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  31.38 
 
 		 629 aa  307  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  31.49 
 
 		 667 aa  308  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  31.49 
 
 		 667 aa  308  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  32.71 
 
 		 655 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  31.9 
 
 		 606 aa  306  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  32.09 
 
 		 559 aa  306  6e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  32.09 
 
 		 662 aa  306  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  32.3 
 
 		 661 aa  306  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  32.26 
 
 		 605 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  31.49 
 
 		 632 aa  306  8.000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  32.24 
 
 		 647 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  31.67 
 
 		 661 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  31.71 
 
 		 647 aa  306  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  32.61 
 
 		 661 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  32.71 
 
 		 636 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  33.18 
 
 		 628 aa  304  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  30.95 
 
 		 602 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  31.3 
 
 		 607 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  31.64 
 
 		 667 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  32.95 
 
 		 612 aa  300  5e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  31.83 
 
 		 641 aa  298  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  32.15 
 
 		 705 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  32.04 
 
 		 635 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  32.44 
 
 		 612 aa  296  7e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  32.91 
 
 		 645 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  31.69 
 
 		 623 aa  294  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  34.35 
 
 		 619 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  31.04 
 
 		 622 aa  292  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  32.17 
 
 		 622 aa  292  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  31.37 
 
 		 660 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  30.26 
 
 		 665 aa  290  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  31.8 
 
 		 625 aa  290  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  32.59 
 
 		 601 aa  290  6e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  32.31 
 
 		 633 aa  290  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  32.15 
 
 		 632 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  31.99 
 
 		 632 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  32.03 
 
 		 648 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  33.72 
 
 		 615 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  29.02 
 
 		 669 aa  288  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  30.61 
 
 		 608 aa  288  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  31.66 
 
 		 565 aa  288  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  30.73 
 
 		 659 aa  287  4e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  32.36 
 
 		 603 aa  286  5e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  31.52 
 
 		 641 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  31.16 
 
 		 640 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  29.6 
 
 		 692 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  31.4 
 
 		 651 aa  285  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  33.45 
 
 		 604 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  31.65 
 
 		 616 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  30.77 
 
 		 613 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  32.3 
 
 		 630 aa  284  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  31.75 
 
 		 635 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  32.74 
 
 		 626 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  32.41 
 
 		 643 aa  283  5.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  31.96 
 
 		 639 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  30 
 
 		 620 aa  283  8.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  29.92 
 
 		 647 aa  283  8.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  31.73 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  32.21 
 
 		 574 aa  282  1e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  31.57 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  31.96 
 
 		 621 aa  281  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  32.28 
 
 		 644 aa  281  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  32.05 
 
 		 575 aa  281  3e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  33.87 
 
 		 585 aa  281  3e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  31.34 
 
 		 633 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  30 
 
 		 645 aa  279  1e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  29.89 
 
 		 647 aa  279  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  31.12 
 
 		 605 aa  279  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  30.16 
 
 		 647 aa  279  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  30.26 
 
 		 668 aa  279  1e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  30 
 
 		 647 aa  278  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  31.07 
 
 		 598 aa  278  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>