More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0072 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  77.47 
 
 		 659 aa  1053    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  59.97 
 
 		 656 aa  798    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 647 aa  1338    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  46.14 
 
 		 668 aa  606  9.999999999999999e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  46.7 
 
 		 648 aa  593  1e-168  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  47.01 
 
 		 619 aa  578  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  45.71 
 
 		 626 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  45.71 
 
 		 626 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  45.07 
 
 		 649 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  45.41 
 
 		 647 aa  571  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  44.48 
 
 		 647 aa  569  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  45.26 
 
 		 647 aa  570  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  44.24 
 
 		 647 aa  571  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  45.19 
 
 		 644 aa  570  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  44.05 
 
 		 645 aa  565  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  44.41 
 
 		 647 aa  567  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  44.41 
 
 		 647 aa  567  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  44.86 
 
 		 647 aa  567  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  42.86 
 
 		 669 aa  562  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  44.43 
 
 		 630 aa  538  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  41.24 
 
 		 630 aa  462  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  36.69 
 
 		 644 aa  412  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  36.4 
 
 		 640 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  37.62 
 
 		 585 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  35.7 
 
 		 622 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  34.96 
 
 		 603 aa  393  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  37.5 
 
 		 612 aa  393  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  36.26 
 
 		 612 aa  392  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  34.26 
 
 		 680 aa  388  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  35.05 
 
 		 639 aa  389  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  33.58 
 
 		 692 aa  383  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  35.75 
 
 		 631 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  34.18 
 
 		 665 aa  382  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  34.38 
 
 		 605 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  34.46 
 
 		 628 aa  369  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  35.4 
 
 		 620 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  33.78 
 
 		 674 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  34.48 
 
 		 614 aa  364  3e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  33.84 
 
 		 647 aa  363  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  34.8 
 
 		 605 aa  363  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  34.75 
 
 		 606 aa  363  8e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  33.65 
 
 		 605 aa  361  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  33.53 
 
 		 674 aa  359  7e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  34.09 
 
 		 560 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  34.44 
 
 		 622 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  33.86 
 
 		 586 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  34.05 
 
 		 650 aa  351  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  33.39 
 
 		 602 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  31.32 
 
 		 632 aa  350  5e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  34.26 
 
 		 621 aa  346  8e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  32.85 
 
 		 566 aa  345  2e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  32.7 
 
 		 608 aa  345  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  33.23 
 
 		 599 aa  345  2e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  32.05 
 
 		 670 aa  344  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  33.95 
 
 		 588 aa  342  1e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  31.45 
 
 		 589 aa  342  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  33.49 
 
 		 566 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0007  DNA mismatch repair protein MutL  31.44 
 
 		 709 aa  336  7e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  31.79 
 
 		 647 aa  336  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  33.02 
 
 		 603 aa  335  1e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  32.09 
 
 		 629 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  32.87 
 
 		 630 aa  331  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  32.25 
 
 		 608 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  34.01 
 
 		 617 aa  327  4.0000000000000003e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  30.83 
 
 		 584 aa  326  8.000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  31.83 
 
 		 655 aa  324  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  31.91 
 
 		 624 aa  323  4e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  33.59 
 
 		 641 aa  322  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  31.37 
 
 		 652 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  34.22 
 
 		 610 aa  320  5e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  32.86 
 
 		 605 aa  319  7.999999999999999e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  31.91 
 
 		 628 aa  318  2e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  32.76 
 
 		 626 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  31.3 
 
 		 628 aa  316  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  30.58 
 
 		 607 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  32.52 
 
 		 623 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  30.59 
 
 		 616 aa  313  4.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  30.7 
 
 		 600 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  31.32 
 
 		 624 aa  313  7.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  32.39 
 
 		 626 aa  312  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  32.46 
 
 		 644 aa  312  1e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  30.24 
 
 		 608 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 		 644 aa  312  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  30.88 
 
 		 621 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  32.45 
 
 		 632 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  31.88 
 
 		 606 aa  310  4e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  32.35 
 
 		 602 aa  310  4e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  31.61 
 
 		 617 aa  310  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  32.04 
 
 		 597 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  33.13 
 
 		 648 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  46.32 
 
 		 755 aa  307  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  30.2 
 
 		 636 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  30.96 
 
 		 600 aa  306  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  31.35 
 
 		 630 aa  306  8.000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  31.52 
 
 		 582 aa  306  9.000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  29.72 
 
 		 647 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  31.74 
 
 		 615 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  31.67 
 
 		 641 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  32.25 
 
 		 616 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0211  DNA mismatch repair protein MutL  31.65 
 
 		 644 aa  303  6.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>