More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0934 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 603 aa  1214    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  49.75 
 
 		 585 aa  548  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  44.63 
 
 		 612 aa  489  1e-137  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  44.01 
 
 		 603 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  41.6 
 
 		 599 aa  457  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  41.44 
 
 		 588 aa  426  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  33.49 
 
 		 644 aa  373  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  33.64 
 
 		 649 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  33.85 
 
 		 644 aa  364  3e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  33.9 
 
 		 647 aa  363  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  34.29 
 
 		 626 aa  362  8e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  34.29 
 
 		 626 aa  362  8e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  34.21 
 
 		 647 aa  361  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  33.85 
 
 		 647 aa  362  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  35.43 
 
 		 559 aa  360  3e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  34.21 
 
 		 647 aa  360  5e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  33.44 
 
 		 647 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  36.92 
 
 		 639 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 		 645 aa  356  7.999999999999999e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  36.13 
 
 		 647 aa  353  5e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  38.16 
 
 		 620 aa  348  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  33.91 
 
 		 647 aa  348  1e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  36.39 
 
 		 630 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  33.18 
 
 		 668 aa  347  5e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  36.83 
 
 		 605 aa  347  5e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  35.28 
 
 		 619 aa  346  8.999999999999999e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  32.5 
 
 		 656 aa  341  2e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  34.57 
 
 		 572 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  35.34 
 
 		 628 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  34.86 
 
 		 632 aa  341  2.9999999999999998e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  35.11 
 
 		 626 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  32.6 
 
 		 659 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  36.69 
 
 		 605 aa  335  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  32.56 
 
 		 644 aa  333  6e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  36.01 
 
 		 612 aa  333  7.000000000000001e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  33.07 
 
 		 640 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  36.73 
 
 		 631 aa  330  4e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  33.99 
 
 		 586 aa  330  4e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  35.49 
 
 		 605 aa  330  6e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  35.1 
 
 		 566 aa  327  3e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  35.04 
 
 		 566 aa  323  7e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  37.15 
 
 		 607 aa  323  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  37.19 
 
 		 608 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  34 
 
 		 565 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  33.17 
 
 		 626 aa  320  6e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  33.28 
 
 		 629 aa  320  7e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  34.88 
 
 		 575 aa  319  9e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  34.88 
 
 		 574 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  34.85 
 
 		 608 aa  317  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  31.84 
 
 		 648 aa  317  5e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  29.82 
 
 		 674 aa  316  6e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  33.97 
 
 		 602 aa  316  8e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  36.2 
 
 		 607 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  32.01 
 
 		 647 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  29.97 
 
 		 674 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  33.96 
 
 		 625 aa  314  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  36.59 
 
 		 602 aa  314  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  35.88 
 
 		 611 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  35.53 
 
 		 608 aa  312  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  34.83 
 
 		 606 aa  311  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  33.22 
 
 		 589 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  33.39 
 
 		 619 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  33.65 
 
 		 622 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  34.38 
 
 		 630 aa  311  2.9999999999999997e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  34.05 
 
 		 566 aa  310  4e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  35.61 
 
 		 622 aa  310  4e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  34.61 
 
 		 623 aa  310  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  34.61 
 
 		 623 aa  310  5e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  33.71 
 
 		 621 aa  310  5.9999999999999995e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  35.2 
 
 		 617 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  33.85 
 
 		 641 aa  309  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  35.57 
 
 		 601 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  32.06 
 
 		 624 aa  307  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  33.18 
 
 		 644 aa  307  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  32.5 
 
 		 584 aa  307  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  34.01 
 
 		 560 aa  306  8.000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  34.5 
 
 		 632 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  30.86 
 
 		 589 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  50.61 
 
 		 692 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  30.9 
 
 		 650 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  33.88 
 
 		 611 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  32.8 
 
 		 626 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  35.16 
 
 		 605 aa  302  9e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  34.66 
 
 		 616 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 		 655 aa  300  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  35.75 
 
 		 582 aa  300  7e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  32.45 
 
 		 632 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  33.54 
 
 		 652 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  34.04 
 
 		 597 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  32.44 
 
 		 632 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  31.65 
 
 		 623 aa  298  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  34.2 
 
 		 612 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 		 600 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  34.55 
 
 		 603 aa  296  5e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  32.3 
 
 		 633 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  31.96 
 
 		 641 aa  295  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  34.35 
 
 		 620 aa  295  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  33.92 
 
 		 629 aa  294  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  35.5 
 
 		 610 aa  293  5e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  32.28 
 
 		 624 aa  293  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>