More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0413 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 630 aa  1273    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  42.88 
 
 		 659 aa  478  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  41.05 
 
 		 647 aa  457  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  42.28 
 
 		 656 aa  455  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  38.39 
 
 		 668 aa  437  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  40.44 
 
 		 619 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  40.09 
 
 		 649 aa  428  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  40.49 
 
 		 647 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  40.12 
 
 		 647 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  40.22 
 
 		 626 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  40.12 
 
 		 647 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  39.82 
 
 		 647 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  40.22 
 
 		 626 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  40.12 
 
 		 647 aa  425  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  39.97 
 
 		 644 aa  421  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  39.97 
 
 		 647 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  40.34 
 
 		 647 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  37.71 
 
 		 648 aa  417  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  37.44 
 
 		 669 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  39.1 
 
 		 630 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  36.77 
 
 		 645 aa  399  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  33.28 
 
 		 665 aa  341  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  34.42 
 
 		 622 aa  341  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  36.01 
 
 		 620 aa  339  8e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  33.14 
 
 		 680 aa  332  9e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  34.4 
 
 		 639 aa  324  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  33.49 
 
 		 640 aa  324  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  33.69 
 
 		 644 aa  322  9.999999999999999e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  34.38 
 
 		 603 aa  320  6e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  34.48 
 
 		 628 aa  318  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  34.27 
 
 		 612 aa  317  3e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  33.02 
 
 		 612 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  31.75 
 
 		 674 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  31.66 
 
 		 650 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  31.64 
 
 		 647 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  31.22 
 
 		 674 aa  303  9e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  34.17 
 
 		 605 aa  302  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  31.08 
 
 		 695 aa  301  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  33.44 
 
 		 605 aa  301  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  32.09 
 
 		 631 aa  301  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  31.23 
 
 		 632 aa  300  6e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  32.74 
 
 		 599 aa  292  1e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  31.13 
 
 		 629 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  46.69 
 
 		 755 aa  288  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  32.11 
 
 		 586 aa  286  8e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  32.19 
 
 		 643 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  32.3 
 
 		 618 aa  284  3.0000000000000004e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  32.34 
 
 		 641 aa  282  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  31.21 
 
 		 602 aa  280  7e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  30.41 
 
 		 606 aa  280  8e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  32.33 
 
 		 610 aa  280  8e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  30.86 
 
 		 647 aa  280  8e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  31.78 
 
 		 617 aa  278  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  31.44 
 
 		 600 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  30.37 
 
 		 670 aa  277  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  31.05 
 
 		 613 aa  277  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  32.35 
 
 		 611 aa  277  4e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  32.67 
 
 		 641 aa  277  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  29.29 
 
 		 644 aa  276  7e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  31.77 
 
 		 615 aa  276  9e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  28.88 
 
 		 589 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  31.24 
 
 		 572 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  30.97 
 
 		 602 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  31.9 
 
 		 621 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  31.27 
 
 		 630 aa  275  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  31.87 
 
 		 606 aa  273  6e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  31.27 
 
 		 603 aa  273  8.000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  32.23 
 
 		 626 aa  272  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  32.57 
 
 		 623 aa  272  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  31.62 
 
 		 600 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  32.25 
 
 		 633 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  31.75 
 
 		 584 aa  271  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  32.82 
 
 		 588 aa  269  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 		 632 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  33.13 
 
 		 633 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  31.94 
 
 		 633 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  44.21 
 
 		 692 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  31.68 
 
 		 629 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  30.87 
 
 		 605 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  31.91 
 
 		 630 aa  266  8e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  31.21 
 
 		 612 aa  266  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  42.2 
 
 		 730 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  32.27 
 
 		 633 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  32.98 
 
 		 632 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  44.24 
 
 		 585 aa  266  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  32.21 
 
 		 635 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  32.16 
 
 		 648 aa  265  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  29.26 
 
 		 628 aa  264  4e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  31.79 
 
 		 645 aa  264  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  31.62 
 
 		 632 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  30.08 
 
 		 623 aa  263  6e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  30.08 
 
 		 623 aa  263  6e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  33.03 
 
 		 628 aa  263  6.999999999999999e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  32.84 
 
 		 608 aa  263  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  30.79 
 
 		 605 aa  263  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  30.91 
 
 		 623 aa  263  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  31.22 
 
 		 633 aa  261  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  29.65 
 
 		 635 aa  260  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  30.92 
 
 		 620 aa  260  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  42.01 
 
 		 559 aa  260  5.0000000000000005e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>