More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0211 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  60.34 
 
 		 617 aa  805    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2145  DNA mismatch repair protein MutL  53.17 
 
 		 612 aa  694    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000372508  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0211  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 644 aa  1327    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  48.47 
 
 		 623 aa  608  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  44.31 
 
 		 610 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  43.74 
 
 		 629 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  42.25 
 
 		 685 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  42.06 
 
 		 630 aa  522  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  39.38 
 
 		 608 aa  497  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  40.91 
 
 		 628 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  38.64 
 
 		 618 aa  466  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  35.08 
 
 		 629 aa  398  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  34.87 
 
 		 644 aa  395  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  33.96 
 
 		 624 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  33.23 
 
 		 626 aa  382  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  32.77 
 
 		 626 aa  376  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  32.92 
 
 		 622 aa  369  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  31.76 
 
 		 628 aa  326  7e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  30.73 
 
 		 644 aa  323  6e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  32.39 
 
 		 640 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  31.22 
 
 		 632 aa  319  9e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  31.22 
 
 		 633 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  30.97 
 
 		 632 aa  318  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  30.72 
 
 		 641 aa  317  5e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  31.71 
 
 		 659 aa  314  3.9999999999999997e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  30.38 
 
 		 647 aa  313  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  30.79 
 
 		 633 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  29.77 
 
 		 692 aa  310  4e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  30.63 
 
 		 636 aa  310  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  29.79 
 
 		 632 aa  310  6.999999999999999e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  29.49 
 
 		 691 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  31.86 
 
 		 630 aa  306  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  31.63 
 
 		 665 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  29.25 
 
 		 670 aa  304  3.0000000000000004e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  28.98 
 
 		 647 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  31.65 
 
 		 647 aa  302  2e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  30.73 
 
 		 645 aa  301  3e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  29.75 
 
 		 605 aa  300  7e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  29.01 
 
 		 613 aa  299  9e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  29.94 
 
 		 623 aa  299  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  29.83 
 
 		 635 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  31.5 
 
 		 639 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  28.9 
 
 		 655 aa  297  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  29.59 
 
 		 625 aa  296  5e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  30.98 
 
 		 695 aa  295  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  30.38 
 
 		 629 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  30.21 
 
 		 641 aa  294  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  29.85 
 
 		 633 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  29.98 
 
 		 645 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  29.7 
 
 		 633 aa  293  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  30.84 
 
 		 628 aa  292  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  28.57 
 
 		 652 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  30 
 
 		 630 aa  291  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  43.77 
 
 		 624 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  29.79 
 
 		 656 aa  288  2e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  28.4 
 
 		 643 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  30.57 
 
 		 620 aa  287  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  28.46 
 
 		 631 aa  287  5e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  31.47 
 
 		 619 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  30.7 
 
 		 612 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  29.29 
 
 		 647 aa  283  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  28.13 
 
 		 649 aa  282  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  28.44 
 
 		 644 aa  282  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  29.81 
 
 		 612 aa  278  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  28.05 
 
 		 601 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  30.06 
 
 		 630 aa  278  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  28.57 
 
 		 622 aa  277  5e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  28.3 
 
 		 586 aa  276  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  28.46 
 
 		 602 aa  276  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  30.19 
 
 		 617 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  30.23 
 
 		 626 aa  275  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  27.86 
 
 		 626 aa  273  8.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  29.06 
 
 		 668 aa  272  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  28.59 
 
 		 611 aa  270  5e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  27.57 
 
 		 607 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  29.48 
 
 		 599 aa  268  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  29.86 
 
 		 603 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0599  DNA mismatch repair protein MutL  30.08 
 
 		 621 aa  266  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0798741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  37.57 
 
 		 622 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  29.1 
 
 		 611 aa  266  1e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  28.86 
 
 		 622 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  26.08 
 
 		 623 aa  265  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  26.08 
 
 		 623 aa  265  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  28.77 
 
 		 595 aa  264  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  28.77 
 
 		 595 aa  264  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  39.88 
 
 		 589 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  27.96 
 
 		 644 aa  263  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  36.88 
 
 		 559 aa  262  1e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3217  DNA mismatch repair protein MutL  39.64 
 
 		 762 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0687703 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  28.49 
 
 		 644 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  27.78 
 
 		 605 aa  262  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  40.67 
 
 		 560 aa  259  7e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0215  DNA mismatch repair protein MutL  29.86 
 
 		 608 aa  259  8e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.137951 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  39.01 
 
 		 616 aa  259  8e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  27.06 
 
 		 617 aa  259  8e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  40.98 
 
 		 680 aa  259  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  40.18 
 
 		 661 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  28.5 
 
 		 604 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  40.18 
 
 		 662 aa  258  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  37.73 
 
 		 602 aa  258  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>