More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3217 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3217  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 762 aa  1511    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0687703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  32.69 
 
 		 730 aa  361  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  33.29 
 
 		 692 aa  345  1e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  49.85 
 
 		 608 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  51.06 
 
 		 607 aa  307  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  43.64 
 
 		 650 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  50.76 
 
 		 607 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  46.36 
 
 		 647 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  46.29 
 
 		 622 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  46.45 
 
 		 606 aa  301  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  45.18 
 
 		 602 aa  300  6e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  49.55 
 
 		 601 aa  300  6e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  45.29 
 
 		 605 aa  296  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  48.48 
 
 		 628 aa  293  6e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  44.03 
 
 		 589 aa  286  9e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  46.25 
 
 		 670 aa  283  8.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1729  DNA mismatch repair protein MutL  34.05 
 
 		 763 aa  279  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  39.4 
 
 		 647 aa  280  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  41.92 
 
 		 608 aa  280  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  46.75 
 
 		 628 aa  277  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  39.45 
 
 		 639 aa  275  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  42.77 
 
 		 559 aa  273  7e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  40.87 
 
 		 610 aa  273  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  44.92 
 
 		 603 aa  272  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  42.15 
 
 		 644 aa  272  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  42.69 
 
 		 632 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  45.43 
 
 		 625 aa  271  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  44.15 
 
 		 634 aa  270  5.9999999999999995e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  40.32 
 
 		 692 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  39.55 
 
 		 629 aa  270  8e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  40 
 
 		 630 aa  270  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  40.74 
 
 		 628 aa  268  2e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  40.25 
 
 		 755 aa  268  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  45.1 
 
 		 640 aa  268  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0007  DNA mismatch repair protein MutL  44.61 
 
 		 709 aa  267  7e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  38.24 
 
 		 680 aa  266  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  40.91 
 
 		 630 aa  265  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  40.87 
 
 		 629 aa  264  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  40.18 
 
 		 618 aa  263  1e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  39.57 
 
 		 665 aa  262  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  34.67 
 
 		 644 aa  262  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  44.17 
 
 		 626 aa  261  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  37.46 
 
 		 623 aa  261  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0211  DNA mismatch repair protein MutL  39.57 
 
 		 644 aa  261  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  45.78 
 
 		 621 aa  259  1e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  40.05 
 
 		 605 aa  259  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  41.86 
 
 		 608 aa  259  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  45.78 
 
 		 619 aa  258  2e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  38.19 
 
 		 615 aa  258  2e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  40.96 
 
 		 647 aa  259  2e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  36.7 
 
 		 647 aa  258  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  42.86 
 
 		 631 aa  258  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  36.45 
 
 		 647 aa  257  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  36.29 
 
 		 617 aa  256  8e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  43.11 
 
 		 602 aa  256  9e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  36.45 
 
 		 647 aa  256  9e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  41.23 
 
 		 644 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  36.45 
 
 		 647 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  36.7 
 
 		 647 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  40 
 
 		 668 aa  256  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  43.16 
 
 		 633 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  36.45 
 
 		 647 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  42.86 
 
 		 632 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  42.55 
 
 		 632 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  40.31 
 
 		 624 aa  254  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  42.55 
 
 		 633 aa  254  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0795  DNA mismatch repair protein  41.28 
 
 		 624 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.741444  hitchhiker  0.00456525 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  36.21 
 
 		 647 aa  253  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  39.94 
 
 		 685 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  41.32 
 
 		 628 aa  252  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  39.08 
 
 		 656 aa  253  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  36.3 
 
 		 626 aa  252  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  36.3 
 
 		 626 aa  252  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  44.31 
 
 		 560 aa  251  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  40.8 
 
 		 586 aa  251  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0509  DNA mismatch repair protein  41.41 
 
 		 598 aa  251  4e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.587743  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  42.34 
 
 		 644 aa  251  5e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  34.71 
 
 		 649 aa  250  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0323  DNA mismatch repair protein MutL  38.79 
 
 		 652 aa  250  8e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  40.27 
 
 		 648 aa  250  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  45.75 
 
 		 620 aa  249  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  38.55 
 
 		 597 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  42.33 
 
 		 613 aa  249  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  45.12 
 
 		 597 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  39.3 
 
 		 566 aa  249  1e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4172  DNA mismatch repair protein  40.3 
 
 		 614 aa  249  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  42.33 
 
 		 582 aa  249  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  41.62 
 
 		 610 aa  248  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  44.31 
 
 		 630 aa  249  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  43.5 
 
 		 615 aa  249  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1289  DNA mismatch repair protein MutL  41.38 
 
 		 765 aa  248  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  45.43 
 
 		 603 aa  248  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  40.62 
 
 		 626 aa  248  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  40.8 
 
 		 626 aa  248  4e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0595  DNA mismatch repair protein  40.54 
 
 		 648 aa  248  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232497 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  42.28 
 
 		 619 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  41.44 
 
 		 636 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  43.21 
 
 		 616 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  41.69 
 
 		 603 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  45.34 
 
 		 604 aa  247  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>