More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0215 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0215  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
608 aa  1248    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.137951 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  36.13 
 
 
602 aa  333  6e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  34.88 
 
 
632 aa  326  7e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  34.83 
 
 
616 aa  325  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  33.87 
 
 
606 aa  322  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  33.7 
 
 
607 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  31.9 
 
 
632 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  33.65 
 
 
608 aa  320  5e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  33.93 
 
 
559 aa  320  6e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  31.9 
 
 
633 aa  320  7e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  34.7 
 
 
621 aa  319  9e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  34.03 
 
 
608 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  32.47 
 
 
565 aa  317  6e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  33.18 
 
 
623 aa  316  7e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  33.18 
 
 
623 aa  316  7e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  31.75 
 
 
632 aa  316  8e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  32.71 
 
 
630 aa  316  9e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  34.02 
 
 
607 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  33.81 
 
 
612 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  32.67 
 
 
648 aa  313  3.9999999999999997e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  32.55 
 
 
631 aa  312  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  33.28 
 
 
603 aa  312  1e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  32.64 
 
 
605 aa  311  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  34.28 
 
 
620 aa  310  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  32.26 
 
 
605 aa  310  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  32.82 
 
 
645 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  34.03 
 
 
597 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  30.43 
 
 
623 aa  308  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  31.48 
 
 
648 aa  308  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  32.7 
 
 
622 aa  307  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  32.85 
 
 
611 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  34.62 
 
 
610 aa  307  4.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  33.65 
 
 
644 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  31.7 
 
 
633 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  34.06 
 
 
628 aa  305  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  33.12 
 
 
628 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  31.3 
 
 
635 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  31.12 
 
 
632 aa  304  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  32.82 
 
 
641 aa  303  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  32.2 
 
 
626 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  32.17 
 
 
605 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  32.53 
 
 
647 aa  303  5.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  34.06 
 
 
643 aa  303  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  31.94 
 
 
608 aa  303  5.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  32.77 
 
 
636 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  31.31 
 
 
629 aa  303  6.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  31.48 
 
 
633 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  31.96 
 
 
622 aa  303  7.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  31.24 
 
 
619 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  32.72 
 
 
624 aa  300  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  30.47 
 
 
641 aa  300  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  31.17 
 
 
633 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  33.55 
 
 
600 aa  299  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  34.62 
 
 
595 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  31.87 
 
 
613 aa  299  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  33.97 
 
 
603 aa  298  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  31.72 
 
 
575 aa  299  1e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  31.98 
 
 
589 aa  298  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  32.86 
 
 
612 aa  298  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  32.53 
 
 
614 aa  298  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  33.39 
 
 
597 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  31.2 
 
 
621 aa  298  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  31.72 
 
 
652 aa  297  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  30.47 
 
 
630 aa  298  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  31.31 
 
 
647 aa  297  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  32.19 
 
 
611 aa  297  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  34.03 
 
 
599 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  30.34 
 
 
645 aa  297  5e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  31.92 
 
 
574 aa  297  5e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  32.64 
 
 
601 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 
630 aa  296  6e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  32.13 
 
 
616 aa  296  6e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  33.38 
 
 
640 aa  296  8e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  31.59 
 
 
626 aa  295  1e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  31.37 
 
 
626 aa  295  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  32.96 
 
 
600 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  32.47 
 
 
589 aa  295  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  29.84 
 
 
669 aa  295  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  32.96 
 
 
611 aa  294  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  30.1 
 
 
681 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  32.9 
 
 
584 aa  293  4e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  32.92 
 
 
620 aa  293  5e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  32.06 
 
 
617 aa  293  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 
605 aa  293  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  31.92 
 
 
606 aa  292  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  31.92 
 
 
626 aa  292  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  31.16 
 
 
661 aa  292  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  33.64 
 
 
639 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  32.22 
 
 
643 aa  291  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  31.46 
 
 
615 aa  291  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  31.24 
 
 
602 aa  291  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  32.07 
 
 
619 aa  290  4e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  33.75 
 
 
633 aa  290  4e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  32.45 
 
 
618 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  31.83 
 
 
637 aa  290  7e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  30.43 
 
 
668 aa  289  9e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  32.5 
 
 
621 aa  289  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  31.97 
 
 
572 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  31.5 
 
 
644 aa  288  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  31.91 
 
 
622 aa  288  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>