More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1599 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 595 aa  1208    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 595 aa  1208    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  45.27 
 
 		 645 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  46.58 
 
 		 611 aa  497  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  46.36 
 
 		 623 aa  498  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  46.19 
 
 		 635 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  45.41 
 
 		 641 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  45.09 
 
 		 648 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  45.06 
 
 		 633 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  45.28 
 
 		 632 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  44.83 
 
 		 629 aa  488  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  44.23 
 
 		 633 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  43.83 
 
 		 632 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  44.58 
 
 		 633 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  43.8 
 
 		 636 aa  482  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  44.11 
 
 		 633 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  41.96 
 
 		 630 aa  477  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  40.38 
 
 		 641 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  44.34 
 
 		 626 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  44.2 
 
 		 625 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  44.57 
 
 		 628 aa  461  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  42.36 
 
 		 611 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  40.37 
 
 		 644 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  41.65 
 
 		 705 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  42.05 
 
 		 621 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  41.93 
 
 		 574 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  41.37 
 
 		 575 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  42.19 
 
 		 619 aa  449  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  43.29 
 
 		 635 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  43.25 
 
 		 616 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  42.41 
 
 		 620 aa  442  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  43.13 
 
 		 647 aa  445  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  42.58 
 
 		 636 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  40.03 
 
 		 613 aa  438  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  40.73 
 
 		 632 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  41.76 
 
 		 602 aa  434  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  42.35 
 
 		 615 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  41.24 
 
 		 598 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  40.77 
 
 		 652 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  42.32 
 
 		 635 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  40.86 
 
 		 657 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  41.38 
 
 		 622 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  40.5 
 
 		 655 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  40.71 
 
 		 657 aa  421  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  40 
 
 		 630 aa  422  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  42.43 
 
 		 604 aa  421  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  39.37 
 
 		 664 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  41.28 
 
 		 643 aa  419  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  41.22 
 
 		 643 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  40.57 
 
 		 644 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  39.91 
 
 		 651 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  40.13 
 
 		 600 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  38.82 
 
 		 623 aa  409  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  40.37 
 
 		 600 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  38.82 
 
 		 623 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  39.2 
 
 		 648 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  37.34 
 
 		 611 aa  412  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  41.08 
 
 		 616 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  41.27 
 
 		 606 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  41.67 
 
 		 632 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  41.27 
 
 		 629 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  39.05 
 
 		 626 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  39.81 
 
 		 660 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  40.73 
 
 		 597 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  38.96 
 
 		 644 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  42.74 
 
 		 621 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  40.86 
 
 		 612 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  40.43 
 
 		 597 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  40.4 
 
 		 595 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  41.35 
 
 		 610 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  39.08 
 
 		 621 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  39.67 
 
 		 594 aa  405  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  39.7 
 
 		 599 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  39.74 
 
 		 605 aa  402  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  40.03 
 
 		 603 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  39.94 
 
 		 617 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  38.38 
 
 		 633 aa  396  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  41.49 
 
 		 603 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  39 
 
 		 620 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  38.22 
 
 		 637 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  39.14 
 
 		 603 aa  391  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  39.87 
 
 		 618 aa  389  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  39.53 
 
 		 603 aa  388  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2869  DNA mismatch repair protein MutL  40.52 
 
 		 605 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  37.88 
 
 		 661 aa  385  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  37.25 
 
 		 687 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  36.67 
 
 		 617 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  34.65 
 
 		 608 aa  365  2e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  40.67 
 
 		 582 aa  362  1e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  35.92 
 
 		 628 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  33.49 
 
 		 648 aa  344  2.9999999999999997e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  35.14 
 
 		 647 aa  343  5.999999999999999e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  35.43 
 
 		 622 aa  342  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  34.75 
 
 		 608 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  33.6 
 
 		 624 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  34.91 
 
 		 602 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  32.81 
 
 		 626 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  37.76 
 
 		 582 aa  336  7e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  38.66 
 
 		 608 aa  336  9e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  39.08 
 
 		 607 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>