More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0628 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 582 aa  1124    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  46.81 
 
 		 643 aa  491  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  49.17 
 
 		 603 aa  479  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  45.87 
 
 		 600 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  49.34 
 
 		 602 aa  480  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  46.13 
 
 		 600 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  48.02 
 
 		 606 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  47.69 
 
 		 629 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  47.18 
 
 		 620 aa  468  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  45.72 
 
 		 605 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  46.91 
 
 		 594 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  45.86 
 
 		 597 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  46.03 
 
 		 597 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  44.75 
 
 		 644 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  44.73 
 
 		 623 aa  449  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  47.26 
 
 		 610 aa  450  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  47.01 
 
 		 599 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  48.51 
 
 		 612 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  48.51 
 
 		 603 aa  451  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  44.73 
 
 		 623 aa  449  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  44.66 
 
 		 626 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  47.78 
 
 		 621 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  43.64 
 
 		 617 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  46.85 
 
 		 616 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  47.85 
 
 		 632 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2869  DNA mismatch repair protein MutL  46.94 
 
 		 605 aa  443  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  44.98 
 
 		 595 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  48.61 
 
 		 621 aa  445  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  44.96 
 
 		 633 aa  442  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  46.01 
 
 		 637 aa  444  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  44.39 
 
 		 687 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  48.03 
 
 		 641 aa  435  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  44.34 
 
 		 618 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  41.67 
 
 		 611 aa  429  1e-119  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  44.68 
 
 		 671 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  45.97 
 
 		 643 aa  428  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  44.44 
 
 		 648 aa  428  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  44.14 
 
 		 661 aa  429  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  45.77 
 
 		 603 aa  425  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  44.78 
 
 		 603 aa  425  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  42.43 
 
 		 611 aa  389  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  43.22 
 
 		 611 aa  392  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  41.52 
 
 		 623 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  37.36 
 
 		 608 aa  382  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  41.2 
 
 		 633 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  40.61 
 
 		 633 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  41.67 
 
 		 598 aa  382  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  40.48 
 
 		 632 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  42.02 
 
 		 605 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  40.48 
 
 		 633 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  42.2 
 
 		 615 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  40.64 
 
 		 632 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  39.19 
 
 		 613 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  40.41 
 
 		 632 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  41.56 
 
 		 629 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  39.57 
 
 		 652 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  38.04 
 
 		 622 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  38.58 
 
 		 616 aa  371  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  37.52 
 
 		 630 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  40.1 
 
 		 641 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  40.19 
 
 		 633 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  38.78 
 
 		 605 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  39.78 
 
 		 636 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  38.3 
 
 		 645 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  39.16 
 
 		 655 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  39.4 
 
 		 625 aa  368  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  39.37 
 
 		 647 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  39.17 
 
 		 635 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0509  DNA mismatch repair protein  36.12 
 
 		 598 aa  363  3e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.587743  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  38.89 
 
 		 648 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  39.48 
 
 		 619 aa  362  1e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  39.35 
 
 		 621 aa  362  1e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  41.2 
 
 		 626 aa  361  2e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  38.71 
 
 		 575 aa  361  2e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  38.28 
 
 		 628 aa  360  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  38.71 
 
 		 574 aa  360  5e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  41.31 
 
 		 605 aa  360  6e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  42.09 
 
 		 628 aa  359  9e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  37.68 
 
 		 606 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1408  DNA mismatch repair protein MutL  61.4 
 
 		 639 aa  358  9.999999999999999e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  38.88 
 
 		 635 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  40.84 
 
 		 595 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  40.84 
 
 		 595 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  40.46 
 
 		 612 aa  356  5.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  40.68 
 
 		 622 aa  356  7.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  37.23 
 
 		 630 aa  355  1e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  43.18 
 
 		 620 aa  353  4e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  37.83 
 
 		 608 aa  353  4e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  35.32 
 
 		 641 aa  351  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  37.5 
 
 		 602 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  40.53 
 
 		 607 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  36.28 
 
 		 631 aa  346  7e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  40.03 
 
 		 635 aa  346  8e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  40.36 
 
 		 607 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  35.49 
 
 		 647 aa  345  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  35.89 
 
 		 584 aa  343  4e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  39.54 
 
 		 608 aa  343  7e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  39.94 
 
 		 620 aa  341  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  41.43 
 
 		 604 aa  340  4e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  39.07 
 
 		 601 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>