More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1087 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 582 aa  1174    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  45.51 
 
 		 610 aa  476  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3464  DNA mismatch repair protein MutL  39.26 
 
 		 692 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  38.52 
 
 		 623 aa  363  3e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  37.26 
 
 		 632 aa  357  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2458  DNA mismatch repair protein MutL  56.57 
 
 		 711 aa  356  5e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.593809 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  37.4 
 
 		 641 aa  356  7.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  37.03 
 
 		 632 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  37.44 
 
 		 635 aa  355  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  37.03 
 
 		 633 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  36.19 
 
 		 645 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  38.83 
 
 		 606 aa  354  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1729  DNA mismatch repair protein MutL  55.62 
 
 		 763 aa  353  4e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  37.14 
 
 		 633 aa  352  8e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  36.71 
 
 		 633 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  36.98 
 
 		 633 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  35.7 
 
 		 648 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  39.44 
 
 		 612 aa  351  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  37.06 
 
 		 632 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  39.21 
 
 		 632 aa  350  5e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  36.6 
 
 		 625 aa  349  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  38.88 
 
 		 616 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2319  DNA mismatch repair protein MutL  55.52 
 
 		 739 aa  348  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  38.37 
 
 		 600 aa  347  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  38.22 
 
 		 594 aa  344  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  36.54 
 
 		 636 aa  343  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  36.82 
 
 		 611 aa  343  5e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  36.88 
 
 		 647 aa  342  8e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  35.83 
 
 		 628 aa  342  9e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  35.29 
 
 		 647 aa  341  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  36.21 
 
 		 566 aa  340  4e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  37.29 
 
 		 586 aa  340  4e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  36.61 
 
 		 621 aa  339  8e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  37.52 
 
 		 621 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  36.67 
 
 		 619 aa  337  3.9999999999999995e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  37.98 
 
 		 600 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  36.77 
 
 		 629 aa  336  7e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  37.3 
 
 		 608 aa  336  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  37.08 
 
 		 635 aa  335  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  35.7 
 
 		 566 aa  334  2e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  35.97 
 
 		 643 aa  335  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  36.23 
 
 		 622 aa  335  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  37.07 
 
 		 616 aa  334  2e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  37.5 
 
 		 608 aa  334  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  36.15 
 
 		 644 aa  333  4e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  39.08 
 
 		 610 aa  332  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  33.86 
 
 		 630 aa  331  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  37.1 
 
 		 620 aa  331  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  38.31 
 
 		 601 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  35.1 
 
 		 605 aa  331  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  37.36 
 
 		 607 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  38.58 
 
 		 598 aa  330  4e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  36.05 
 
 		 602 aa  330  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  35.99 
 
 		 603 aa  330  4e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  36.61 
 
 		 641 aa  330  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  35.51 
 
 		 559 aa  330  5.0000000000000004e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  35.57 
 
 		 603 aa  330  6e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  35.11 
 
 		 636 aa  330  6e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  35.71 
 
 		 584 aa  329  8e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  36.28 
 
 		 661 aa  329  9e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  37.76 
 
 		 595 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  35.81 
 
 		 611 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  36.3 
 
 		 643 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  37.76 
 
 		 595 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  37.21 
 
 		 607 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  34.98 
 
 		 626 aa  327  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  34.57 
 
 		 641 aa  326  6e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  37.76 
 
 		 626 aa  326  6e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  38.36 
 
 		 621 aa  326  7e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  36.24 
 
 		 597 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  35.36 
 
 		 602 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  32.82 
 
 		 589 aa  325  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  35.77 
 
 		 606 aa  324  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  36.28 
 
 		 648 aa  324  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  34.65 
 
 		 631 aa  323  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  34.97 
 
 		 566 aa  323  6e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  37.46 
 
 		 637 aa  323  6e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  36.39 
 
 		 612 aa  322  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  35.48 
 
 		 603 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  36.51 
 
 		 615 aa  321  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  35.75 
 
 		 595 aa  321  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  35.43 
 
 		 629 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  36.41 
 
 		 613 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  36.8 
 
 		 603 aa  319  7.999999999999999e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  36.75 
 
 		 605 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  35.62 
 
 		 617 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  34.6 
 
 		 623 aa  318  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  36.27 
 
 		 652 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  35.76 
 
 		 603 aa  318  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  34.6 
 
 		 623 aa  318  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  35.93 
 
 		 597 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  35.44 
 
 		 687 aa  316  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  34.6 
 
 		 608 aa  316  7e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  35.61 
 
 		 620 aa  316  7e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  37.88 
 
 		 582 aa  316  8e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  34.1 
 
 		 668 aa  316  8e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  31.52 
 
 		 624 aa  316  8e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  35.27 
 
 		 705 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  35.57 
 
 		 622 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  31.9 
 
 		 626 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>