More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1729 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2458  DNA mismatch repair protein MutL  62.12 
 
 		 711 aa  796    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.593809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1729  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 763 aa  1515    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3464  DNA mismatch repair protein MutL  54.13 
 
 		 692 aa  702    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2319  DNA mismatch repair protein MutL  55.04 
 
 		 739 aa  446  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  56.5 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  55.62 
 
 		 582 aa  353  5e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  47.27 
 
 		 653 aa  281  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  50.14 
 
 		 636 aa  280  8e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  29.01 
 
 		 680 aa  278  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  49.02 
 
 		 684 aa  277  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  49.02 
 
 		 684 aa  277  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  49.02 
 
 		 684 aa  277  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  49.02 
 
 		 681 aa  277  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  49.02 
 
 		 684 aa  277  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  49.02 
 
 		 684 aa  277  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  49.02 
 
 		 681 aa  277  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  47.55 
 
 		 634 aa  276  8e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  30.31 
 
 		 685 aa  276  8e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  43.07 
 
 		 661 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  46.56 
 
 		 691 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  42.82 
 
 		 669 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  47.14 
 
 		 705 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  46.69 
 
 		 630 aa  274  5.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  41.23 
 
 		 613 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  44.84 
 
 		 652 aa  273  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  46.19 
 
 		 625 aa  271  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  48.96 
 
 		 641 aa  271  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  45.15 
 
 		 681 aa  271  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  47.9 
 
 		 633 aa  270  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  46.85 
 
 		 629 aa  269  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3027  DNA mismatch repair protein  44.5 
 
 		 650 aa  269  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0173835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  45.43 
 
 		 649 aa  268  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  47.6 
 
 		 633 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  47.59 
 
 		 608 aa  268  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  44.55 
 
 		 670 aa  267  5e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  45.18 
 
 		 606 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3240  DNA mismatch repair protein MutL  42.86 
 
 		 628 aa  267  5.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  44.44 
 
 		 615 aa  267  5.999999999999999e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0596  DNA mismatch repair protein  40.13 
 
 		 644 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0279132  decreased coverage  0.0000000183924 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  47.11 
 
 		 688 aa  267  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3207  DNA mismatch repair protein  45.8 
 
 		 665 aa  266  8e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000351816  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  47.43 
 
 		 661 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  46.35 
 
 		 626 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3434  DNA mismatch repair protein  41.26 
 
 		 644 aa  266  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0482547  normal  0.130022 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  41.69 
 
 		 628 aa  265  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  47.14 
 
 		 661 aa  265  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  47.25 
 
 		 667 aa  265  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  47.25 
 
 		 667 aa  265  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0323  DNA mismatch repair protein MutL  42.51 
 
 		 652 aa  264  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  45.26 
 
 		 621 aa  264  4e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  47.5 
 
 		 632 aa  265  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  46.57 
 
 		 661 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  46.86 
 
 		 667 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0701  DNA mismatch repair protein  45.22 
 
 		 635 aa  264  4.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  47.16 
 
 		 611 aa  264  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  45.23 
 
 		 619 aa  263  6e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  46.79 
 
 		 615 aa  264  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3801  DNA mismatch repair protein  45.22 
 
 		 635 aa  264  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3655  DNA mismatch repair protein  45.22 
 
 		 635 aa  264  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128216  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  49.06 
 
 		 623 aa  264  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  48.84 
 
 		 601 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  43.39 
 
 		 648 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0601  DNA mismatch repair protein  48.35 
 
 		 631 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  47.83 
 
 		 687 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  43.75 
 
 		 608 aa  263  8.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0564  DNA mismatch repair protein  47.43 
 
 		 631 aa  263  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.273606 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  47.92 
 
 		 607 aa  263  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  47.67 
 
 		 662 aa  263  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  45.71 
 
 		 607 aa  263  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  46.63 
 
 		 611 aa  261  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  47.04 
 
 		 635 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  47.29 
 
 		 629 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  43.08 
 
 		 633 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  43.08 
 
 		 632 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0595  DNA mismatch repair protein  43.51 
 
 		 648 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232497 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04037  DNA mismatch repair protein  47.04 
 
 		 615 aa  261  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0484513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3823  DNA mismatch repair protein MutL  47.04 
 
 		 615 aa  261  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000414583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4728  DNA mismatch repair protein  47.04 
 
 		 615 aa  261  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0929403  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3712  DNA mismatch repair protein  48.8 
 
 		 637 aa  261  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4412  DNA mismatch repair protein  47.04 
 
 		 615 aa  261  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0194282  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4701  DNA mismatch repair protein  47.04 
 
 		 615 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915673  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  49.52 
 
 		 598 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  47.63 
 
 		 647 aa  261  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  44.99 
 
 		 644 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  46.53 
 
 		 655 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4641  DNA mismatch repair protein  47.04 
 
 		 615 aa  260  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.231193  normal  0.0766044 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0556  DNA mismatch repair protein  48.8 
 
 		 638 aa  260  7e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000137773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  47.19 
 
 		 633 aa  260  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5686  DNA mismatch repair protein  47.04 
 
 		 615 aa  260  8e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000161678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3769  DNA mismatch repair protein  48.8 
 
 		 630 aa  260  9e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00256823  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  45.05 
 
 		 624 aa  260  9e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  48.05 
 
 		 636 aa  259  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3843  DNA mismatch repair protein  46.75 
 
 		 615 aa  259  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000795964  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  45.67 
 
 		 645 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  47.01 
 
 		 635 aa  258  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  41.67 
 
 		 650 aa  258  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  46.42 
 
 		 641 aa  257  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3895  DNA mismatch repair protein  48.5 
 
 		 638 aa  257  6e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.329435  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3282  DNA mismatch repair protein  46.85 
 
 		 641 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.645074  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  47.38 
 
 		 660 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>